Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12439
• Subject: XM_011529678.2
• Aligned Length: 3483
• Identities: 3418
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATG  74

Query   75  TCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCA  148

Query  149  ACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAG  222

Query  223  TTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAA  296

Query  297  GGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGG  370

Query  371  CGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATC  444

Query  445  CCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCA  518

Query  519  GGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAGCCCAGCCAGTGGG  592

Query  593  CGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAA  666

Query  667  GCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGA  740

Query  741  ACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGAATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGAATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAAC  814

Query  815  CCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATC  888

Query  889  ATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAA  962

Query  963  GCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCA  1036

Query 1037  AGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGCTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGG  1110

Query 1111  GTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGG  1184

Query 1185  TGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCT  1258

Query 1259  ACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATC  1332

Query 1333  GAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGA-------------------------------------------  1363
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct 1333  GAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGGACTCATAGCACACCCTGGAGAGGGGGGGCCCGGCGGCAG  1406

Query 1364  -----------------CAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCA  1420
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCGGCTTAGAGACCTACCAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCA  1480

Query 1421  ACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGC  1494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGC  1554

Query 1495  AAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGC  1568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGC  1628

Query 1569  CGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCC  1642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCC  1702

Query 1643  GGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTC  1716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTC  1776

Query 1717  TTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAG  1790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAG  1850

Query 1791  GGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGG  1864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGG  1924

Query 1865  AGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATG  1938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATG  1998

Query 1939  GAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGC  2012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGC  2072

Query 2013  CCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCG  2086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCG  2146

Query 2087  GGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGC  2160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGC  2220

Query 2161  GAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGA  2234
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2221  GAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAATGTCCGCGA  2294

Query 2235  GTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGG  2308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGG  2368

Query 2309  GCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAG  2382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAG  2442

Query 2383  CGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGAC  2456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGAC  2516

Query 2457  CCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACA  2530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACA  2590

Query 2531  TGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTG  2604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTG  2664

Query 2605  TCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCT  2678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCT  2738

Query 2679  GGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGC  2752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGC  2812

Query 2753  AGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAG  2826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAG  2886

Query 2827  GAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAG  2900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAG  2960

Query 2901  TGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGA  2974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGA  3034

Query 2975  CCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTT  3048
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  CCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTT  3108

Query 3049  ACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCT  3122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  ACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCT  3182

Query 3123  GACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCC  3196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCC  3256

Query 3197  AGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCC  3270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCC  3330

Query 3271  CTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCC  3344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3331  CTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCTC  3404

Query 3345  GCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACA  3418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACA  3478

Query 3419  GCTAC  3423
            |||||
Sbjct 3479  GCTAC  3483