Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12444
• Subject: NM_022319.2
• Aligned Length: 2922
• Identities: 2547
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGCTGCCTGGGCGGCTGTGCTGGGTGCCGCTCCTGCTGGCGCTGGGCGTGGGGAGCGGCAGCGGCGGT-----  69
            ||||||||.|||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||     
Sbjct    1  ATGCTGCCGGGGAGGCTGTGCTTGGTGCCGCTCCTGCTGGCGCTGGGCGTAGGGAGCGGCGGCGGCAGTGGAGA  74

Query   70  -GGCGGGGACAGCCGGCAGCGCCGCCTCCTCGCGGCTAAAGTCAATAAGCACAAGCCATGGATCGAGACTTCAT  142
             |||||.||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct   75  CGGCGGAGACAGCCGGCGGCGCCGCCTCCTCGTGGCGAAAGTCAATAAACACAAGCCATGGATCGAGACATCGT  148

Query  143  ATCATGGAGTCATAACTGAGAACAATGACACAGTCATTTTGGACCCACCACTGGTAGCCCTGGATAAAGATGCA  216
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  149  ATCACGGAGTCATAACTGAGAACAATGACACAGTCATCTTGGACCCTCCACTGGTTGCCCTGGATAAAGATGCC  222

Query  217  CCGGTTCCTTTTGCAGGGGAAATCTGTGCGTTCAAGATCCATGGCCAGGAGCTGCCCTTTGAGGCTGTGGTGCT  290
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCAGTGCCTTTTGCAGGGGAAATCTGTGCATTCAAGATCCATGGACAGGAGCTGCCCTTTGAGGCTGTGGTGCT  296

Query  291  CAACAAGACATCAGGAGAGGGCCGGCTCCGTGCCAAGAGCCCCATTGACTGTGAGTTGCAGAAGGAGTACACAT  364
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CAATAAGACATCTGGAGAGGGCCGGCTCCGCGCCAAGAGTCCCATCGACTGTGAGCTGCAGAAGGAGTACACGT  370

Query  365  TCATCATCCAGGCCTATGACTGTGGTGCTGGGCCCCACGAGACAGCCTGGAAAAAGTCACACAAGGCCGTGGTC  438
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|..||..||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  TCATCATCCAGGCCTATGACTGTGGTGCGGGGCCTCGGGAAGCAGCCTGGAAGAAGTCACACAAGGCTGTGGTC  444

Query  439  CATATACAGGTGAAGGATGTCAACGAGTTTGCTCCCACCTTCAAAGAGCCAGCCTACAAGGCTGTTGTGACGGA  512
            ||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||.|||||
Sbjct  445  CACATCCAGGTGAAGGATGTCAATGAGTTTGCACCCACCTTCAAAGAGCCAGCCTACAAGGCCATCGTCACGGA  518

Query  513  GGGCAAGATCTATGACAGCATTCTGCAGGTGGAGGCCATTGACGAGGACTGCTCCCCACAGTACAGCCAGATCT  586
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  GGGCAAGATCTATGACAGCATCCTGCAGGTAGAAGCCATTGATGAGGACTGCTCCCCGCAGTACAGCCAGATTT  592

Query  587  GCAACTATGAAATCGTCACCACAGATGTGCCTTTTGCCATCGACAGAAATGGCAACATCAGGAACACTGAGAAG  660
            |||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAACTATGAAATTGTCACAACGGATGTGCCTTTTGCCATTGACAGAAATGGCAACATCAGGAACACTGAGAAG  666

Query  661  CTGAGCTATGACAAACAACACCAGTATGAGATCCTGGTGACCGCCTACGACTGTGGACAGAAGCCCGCTGCTCA  734
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  667  CTGAGCTATGACAAGCAACACCAGTATGAGATCCTGGTAACCGCTTATGACTGTGGACAGAAACCCGCCGCTCA  740

Query  735  GGACACCCTGGTGCAGGTGGATGTGAAGCCAGTTTGCAAGCCTGGCTGGCAAGACTGGACCAAGAGGATTGAGT  808
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GGACACCCTGGTGCAGGTGGACGTGAAACCAGTGTGCAAGCCCGGCTGGCAAGATTGGACCAAAAGGATTGAGT  814

Query  809  ACCAGCCTGGCTCCGGGAGCATGCCCCTGTTCCCCAGCATCCACCTGGAGACGTGCGATGGAGCCGTGTCTTCC  882
            |||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  815  ACCAGCCTGGCTCGGGGAGTATGCCCTTGTTCCCCAGCATCCACCTGGAGACATGCGATGGAGCTGTGTCCTCC  888

Query  883  CTCCAGATCGTCA---CAGAGCTGCAGACTAATTACATTGGGAAGGGTTGTGACCGGGAGACCTACTCTGAGAA  953
            ||||||   ||||   |.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCAG---GTCACTGCGGAGCTGCAGACTAATTACATCGGCAAGGGCTGTGACCGAGAGACCTACTCTGAGAA  959

Query  954  ATCCCTTCAAAAGTTATGTGGAGCCTCCTCTGGCATCATTGACCTCTTGCCATCCCCTAGCGCTGCCACCAACT  1027
            |||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  960  ATCCCTTCAGAAATTATGTGGCGCATCCTCGGGTATCATCGATCTCTTGCCGTCCCCTAGCGCAGCTACCAACT  1033

Query 1028  GGACTGCAGGACTGCTGGTGGACAGCAGTGAGATGATCTTCAAGTTTGACGGCAGGCAGGGTGCCAAAGTCCCC  1101
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.
Sbjct 1034  GGACTGCGGGGCTGCTGGTGGACAGCAGTGAGATGATCTTCAAGTTTGACGGCAGGCAGGGTGCCAAGATCCCT  1107

Query 1102  GATGGGATTGTGCCCAAGAACCTGACCGATCAGTTCACCATCACCATGTGGATGAAACACGGCCCCAGCCCTGG  1175
            ||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1108  GATGGGATCGTGCCCAAGAACCTGACGGACCAGTTCACCATCACCATGTGGATGAAACATGGCCCCAGCCCCGG  1181

Query 1176  TGTGAGAGCCGAGAAGGAAACCATCCTCTGCAACTCAGACAAAACCGAAATGAACCGGCATCACTATGCCCTGT  1249
            .||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  CGTGAGAGCCGAGAAGGAAACTATCCTCTGTAACTCAGATAAAACTGAAATGAACCGGCATCACTATGCCCTGT  1255

Query 1250  ATGTGCACAACTGCCGCCTCGTCTTTCTCTTGCGGAAGGACTTCGACCAGGCTGACACCTTTCGCCCCGCGGAG  1323
            |||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1256  ATGTGCACAACTGCCGCCTCGTCTTCCTCCTGCGGAAGGACTTTGACCAGGCAGACACCTTTCGCCCTGCAGAG  1329

Query 1324  TTCCACTGGAAGCTGGATCAGATTTGTGACAAAGAGTGGCACTACTATGTCATCAATGTGGAGTTTCCTGTGGT  1397
            ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1330  TTTCACTGGAAGCTGGACCAGATTTGTGACAAAGAGTGGCATTACTATGTCATCAATGTGGAGTTCCCTGTGGT  1403

Query 1398  AACCTTATACATGGATGGAGCAACATATGAACCATACCTGGTGACCAACGACTGGCCCATTCATCCATCTCACA  1471
            .|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  TACCCTGTACATGGATGGAGCAACATATGAACCATACCTGGTGACTAATGACTGGCCCATTCATCCATCTCACA  1477

Query 1472  TAGCCATGCAACTCACAGTCGGCGCTTGTTGGCAAGGAGGAGAAGTCACCAAACCACAGTTTGCTCAGTTCTTT  1545
            |||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|||||||||.||||||.||.||.||.
Sbjct 1478  TAGCCATGCAACTTACTGTCGGCGCCTGTTGGCAAGGAGGCGAAGTGGCCAAACCACGGTTTGCACAATTTTTC  1551

Query 1546  CATGGAAGCCTGGCCAGTCTCACCATCCGCCCTGGCAAAATGGAAAGCCAGAAGGTGATCTCCTGCCTGCAGGC  1619
            |||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||..|||||||
Sbjct 1552  CATGGCAGCCTTGCCAGTCTCACAATCCGTCCTGGCAAAATGGAAAGCCAGAAGGTGATTTCTTGTTTGCAGGC  1625

Query 1620  CTGCAAGGAAGGGCTGGACATTAATTCCTTGGAAAGCCTTGGCCAAGGAATAAAGTATCACTTCAACCCCTCGC  1693
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1626  CTGCAAAGAAGGGCTGGATATTAATTCCTTGGAAAGCCTTGGGCGAGGGATAAAGTATCACTTCAACCCTTCAC  1699

Query 1694  AGTCCATCCTGGTGATGGAAGGTGACGACATTGGGAACATTAACCGTGCTCTCCAGAAAGTCTCCTACATCAAC  1767
            ||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1700  AGTCCATCCTCGTGATGGAAGGCGATGACATTGGGAACATCAACCGAGCCCTCCAGAAAGTCTCCTATATCAAC  1773

Query 1768  TCCAGGCAGTTCCCAACGGCGGGTGTGCGGCGCCTCAAAGTATCCTCCAAAGTCCAGTGCTTTGGGGAAGACGT  1841
            |||.||||.||||||||.||.||.||.||||||||||.|.|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1774  TCCCGGCAATTCCCAACAGCAGGGGTCCGGCGCCTCAGACTCTCTTCCAAAGTCCAGTGCTTTGGAGAAGATGT  1847

Query 1842  ATGCATCAGTATCCCTGAGGTAGATGCCTATGTGATGGTCCTCCAGGCCATCGAGCCCCGGATCACCCTCCGGG  1915
            .||||||||.|||||.||.||.||||||||..|.||||||.|.||||||||.|||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1848  GTGCATCAGCATCCCAGATGTGGATGCCTACATCATGGTCTTACAGGCCATTGAGCCCCAGATCACCCTCCAGG  1921

Query 1916  GCACAGACCACTTCTGGAGACCTGCTGCCCAGTTTGAAAGTGCCAGGGGAGTGACCCTCTTCCCTGATATCAAG  1989
            |.|||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1922  GAACAGAGCGTTTCTGGAGACCTGCTGCCCAGTTTGAAAGTGCCAGAGGAGTGACTCTCTTCCCTGACATCAAG  1995

Query 1990  ATTGTGAGCACCTTCGCCAAAACCGAAGCCCCCGGGGACGTGAAAACC------ACAGACCCCAAATCAGAAGT  2057
            ||||||||||||||.|||||.||.||.|||.||||||||.|||.|.||      ||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1996  ATTGTGAGCACCTTTGCCAAGACTGAGGCCTCCGGGGACATGAGAGCCACAGGTACAGCCCCCAAATCAGCAGT  2069

Query 2058  CTTAGAGGAAATGCTTCATAACTTAGATTTCTGTGACATTTTGGTGATCGGAGGGGACTTGGACCCAAGGCAGG  2131
            |||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2070  CTTGGAAGAAATGCTACACAATTTGGATTTCTGTGACATTTTGGTGCTTGGAGGGGACTTGGATCCAAGGCAAG  2143

Query 2132  AGTGCTTGGAGCTCAACCACAGTGAGCTCCACCAACGACACCTGGATGCCACTAATTCTACTGCAGGCTACTCC  2205
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 2144  AGTGCTTGGAGCTCAACCACAGTGAGCTCCACCAACGACACCTTGATGCCACCAACTCAACTGCTGGCTACTCC  2217

Query 2206  ATCTACGGTGTGGGCTCCATGAGCCGCTATGAGCAGGTGCTACATCACATCCGCTACCGCAACTGGCGTCCGGC  2279
            |||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||..||..|
Sbjct 2218  ATCTATGGTGTGGGCTCCATGAACCGCTATGAGCAGGTGCTGCATCACCTCCGTTACCGCAACTGGCACCCCAC  2291

Query 2280  TTCTCTTGAGGCCCGGCGTTTCCGGATTAAGTGCTCAGAACTCAATGGGCGCTACACTAGCAATGAGTTCAACT  2353
            .||.||||||.|||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  GTCCCTTGAGACCCGGAGGTTCCGGATCAAGTGCTCAGAACTCAACGGGCGTTACACTAGCAATGAGTTCAACT  2365

Query 2354  TGGAGGTCAGCATCCTTCATGAAGACCAAGTCTCAGATAAGGAGCATGTCAATCATCTGATTGTGCAGCCTCCC  2427
            ||||||||||..||||.|||||||....||||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 2366  TGGAGGTCAGTGTCCTCCATGAAGTGAGAGTCTCTGACAAGGAACATGTCAACCACCTTATTGTGCAGCCACCC  2439

Query 2428  TTCCTCCAGTCTGTCCATCATCCTGAGTCCCGGAGTAGCATCCAGCACAGTTCAGTGGTCCCAAGCATTGCCAC  2501
            ||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2440  TTTCTCCAGTCTGTCCATCACCCTGAGACCCGGAGTAGTATCCAGCGCAGTTCAGTGGTCCCGAGCATCGCCAC  2513

Query 2502  AGTGGTCATCATCATCTCCGTGTGCATGCTTGTGTTTGATGTGGCCATGGGTGTGTACCGGGTCCGGATCGCCC  2575
            .||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 2514  TGTCGTCATCATTATCTCTGTGTGCATGCTAGTGTTTGTTGTGGCCATGGGTGTGTACCGAGTCCGAATTGCCC  2587

Query 2576  ACCAGCACTTCATCCAGGAGACTGAGGCTGCCAAGGAATCTGAGATGGACTGGGACGATTCTGCGCTGACTATC  2649
            |||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 2588  ACCAGCATTTTATCCAAGAGACTGAGGCTGCCAAGGAAGCTGAGATGGACTGGGATGACTCTGCACTGACTATC  2661

Query 2650  ACAGTCAACCCCATGGAGAAACATGAAGGACCAGGGCATGGGGAAGATGA---GACTGAGGGAGAAGAGGAGGA  2720
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||   .||.||.|.|||.||.|||||
Sbjct 2662  ACTGTCAACCCTATGGAGAAACATGAAGGCCCAGGGAACGGGGAAGATGAAACCACCGAAGTAGAGGAAGAGGA  2735

Query 2721  AGAAGCCGAGGAAGAAATGAGCTC---CAGCAGTGGCTCTGACGACAGCGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGGA  2791
            .|||||.|||||||....||||||   |||||||||.||.||.|||||||||   |||||.||.||||||||||
Sbjct 2736  GGAAGCAGAGGAAGGCTCGAGCTCCAGCAGCAGTGGTTCCGATGACAGCGAA---GAGGAAGAAGAGGAAGGGA  2806

Query 2792  TGGGCAGAGGCAGACATGGGCAGAATGGAGCCAGGC-----AAGCC---------------------CAGCCGG  2839
            |||||||||.||||||||||||||..||..||| ||     |||||                     |.||.||
Sbjct 2807  TGGGCAGAGTCAGACATGGGCAGAGCGGCACCA-GCTCTCAAAGCCCTGAAAGAAGTACCTGGAACACTGCAGG  2879

Query 2840  AG----------TGGGATGACTCCACCCTCCCCTAC  2865
            ||          |.|||.|                 
Sbjct 2880  AGTCATAAACATTTGGAAG-----------------  2898