Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12486
Subject:
NM_027310.4
Aligned Length:
585
Identities:
501
Gaps:
21

Alignment

Query   1  ATGGCGATGCACAACAAGGCGGCGCCGCCGCAGATCCCGGACACCCGGCGGGAGCTGGCGGAGCTCGTGAAGCG  74
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Sbjct   1  ATGGCGATGCACAACAAGACGGCGCCGCCGCAGATCCCAGACACCCGGCGGGAGCTGGCCGAGCTGGTTAAGCG  74

Query  75  GAAGCAGGAGCTGGCGGAAACATTGGCAAATTTGGAGCGACAGATCTATGCTTTTGAGGGAAGCTACCTGGAAG  148
           ||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  75  GAAGCAGGAGCTGGCGGAAACACTTGCAAACTTGGAGAGACAGATATATGCTTTTGAAGGAAGCTACCTGGAAG  148

Query 149  ACACTCAGATGTATGGCAATATTATTCGTGGCTGGGATCGGTATCTGACCAACCAAAAAAACTCCAATAGCAAA  222
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 149  ACACTCAGATGTATGGCAATATTATCCGTGGCTGGGATCGGTATTTGACCAATCAAAAGAACTCCAATAGCAAA  222

Query 223  AATGATCGAAGGAACCGGAAGTTTAAGGAAGCTGAGCGGCTCTTCAGTAAATCCTCGGTTACCTCAGCAGCTGC  296
           ||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct 223  AACGACCGGAGGAACCGGAAGTTCAAGGAGGCCGAACGGCTCTTCAGCAAATCCTCAGTCACGTCGGCTGCTGC  296

Query 297  AGTAAGTGCATTGGCAGGAGTTCAGGACCAGCTCATTGAAAAGAGGGAGCCAGGAAGTGGGACGGAAAGTGACA  370
           |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 297  AGTAAGTGCCTTGGCAGGGGTTCAGGACCAGCTCATCGAAAAGAGGGAACCAGGAAGTGGGACGGAAAGCGATA  370

Query 371  CTTCTCCAGACTTCCACAATCAGGAAAATGAGCCCAGC-CAGGAGGACCCTGAGGATCTGGATGGATCTGTGCA  443
           ||||||||||||||||||||||||||||.||| ||.|| |||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 371  CTTCTCCAGACTTCCACAATCAGGAAAACGAG-CCTGCGCAGGAGGACCCCGAGGACCTAGACGGCTCCGTCCA  443

Query 444  GGGAGTGAAACCTCAGAAGGCTGCTTCTTCTACTTCCTCAGGGAGTCACCACAGCAGCCATAAAAAGCGAAAGA  517
           ||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 444  GGGAGTGAAACCTCAGAAAGCCGCCTCTTCCACCTCCTCAGGAAGCCACCACAGCAGCCACAAAAAACGGAAGA  517

Query 518  ATAAAAACCGGCACAGGATTGATCTGAA-GTTAAACAAAAAAC-------CACGAGCTGACTAT---  573
           ||||||||||||||||.|      |||| ||....|...||||       |||.||||  |.||   
Sbjct 518  ATAAAAACCGGCACAGAA------TGAATGTCTCCCCCCAAACTGGCTGGCACCAGCT--CCATCTG  576