Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12574
• Subject: NM_001308173.2
• Aligned Length: 1305
• Identities: 951
• Gaps: 354

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGATGGATGAGCCGTGGTGGGAAGGGCGCGTCGCCTCGGACGTCCACTGCACCCTGCGCGAGAAGGAACTGAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCTGCCCACCTTCCGAGCCCACTCCCCACTCCTGAAGAGCCGCCGGTTCTTCGTGGACATCCTGACCCTGCTGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------ATGGATCGCTAC  12
                                                                          ||||||||||||
Sbjct  149  GCAGCCACTGCCAGCTCTGCCCTGCAGCCCGGCACCTGGCCGTCTACCTGCTGGACCACTTCATGGATCGCTAC  222

Query   13  AACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAACGGAGTTTCGCTCTT  86
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  223  AACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAA----------------  280

Query   87  ATCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTC  160
                                                                                      
Sbjct  281  --------------------------------------------------------------------------  280

Query  161  CTGCTTCAGCGCCCCACCCCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGTAAGTTCGAGGATCGGGAA  234
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct  281  ------------------------------------------------------GTAAGTTCGAGGATCGGGAA  300

Query  235  GACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCACCCTCACCAAGAA  308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCACCCTCACCAAGAA  374

Query  309  GGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCACGCCTGCCCACT  382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  GGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCACGCCTGCCCACT  448

Query  383  TCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCCACCACCTGCCCC  456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  TCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCCACCACCTGCCCC  522

Query  457  CGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGATCACATATTCTA  530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  CGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGATCACATATTCTA  596

Query  531  CAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGCTTTCTCCCTACT  604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  CAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGCTTTCTCCCTACT  670

Query  605  GGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAAATCCTGCTGGTA  678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  GGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAAATCCTGCTGGTA  744

Query  679  GTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCCCGGCACACCCCC  752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  GTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCCCGGCACACCCCC  818

Query  753  CACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCGACCACCCTGGCACAGT  826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  CACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCGACCACCCTGGCACAGT  892

Query  827  TCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCAGGGAGCCTGCTC  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  TCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCAGGGAGCCTGCTC  966

Query  901  TCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTGTCCCGTGCCCGT  974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  TCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTGTCCCGTGCCCGT  1040

Query  975  CCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCACCTATGGAAGCA  1048
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  CCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCACCTATGGAAGCA  1114

Query 1049  GCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA  1095
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  GCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA  1161