Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12575
• Subject: NM_001324387.2
• Aligned Length: 1271
• Identities: 894
• Gaps: 361

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTTAGTTCCTTTCCAGTGGTTTTGCTGGAAACCATGTCTCATTATACAGATGAACCCAGATTTACCATAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCAGATAGATCTGCTTCAGCGACTTCGGCGTACTGGAATGACTAAACATGAAATTCTCCATGCCTTGGAAACTT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGGACCGTCTTGATCAAGAGCATAGTGACAAGTTTGGAAGAAGGTCCAGCTATGGAGGAAGTTCATATGGGAAT  222

Query    1  ------------------------------------------------------------------ATGTCCCC  8
                                                                              ||||||||
Sbjct  223  AGTACTAACAATGTCCCAGCATCTTCCTCTACAGCTACAGCTTCCACACAGACGCAGCATTCGGGAATGTCCCC  296

Query    9  GTCACCTAGCAACAGTTATGATACTTCCCCACAGCCTTGCACTACCAATCAAAATGGGAGGGAGAATAATGAGC  82
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCACCTAGCAACAGTTATGATACTTCCCCACAGCCTTGCACTACCAATCAAAATGGGAGGGAGAATAATGAGC  370

Query   83  GATTATCTACATCCAATGGAAAGATGTCACCAACTCGCTACCATGCAAACAGCATGGGTCAGAGGTCATACAGT  156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GATTATCTACATCCAATGGAAAGATGTCACCAACTCGCTACCATGCAAACAGCATGGGTCAGAGGTCATACAGT  444

Query  157  TTTGAAGCCTCAGAAGAGGACCTAGATGTAGATGATAAAGTGGAAGAATTAATGAGGAGGGACAGCAGTGTGAT  230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGAAGCCTCAGAAGAGGACCTAGATGTAGATGATAAAGTGGAAGAATTAATGAGGAGGGACAGCAGTGTGAT  518

Query  231  AAAAGAGGAAATCAAAGCCTTTCTTGCCAATCGGAGGATTTCCCAAGCAGTTGTTGCACAGGTAACAGGTATCA  304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAAGAGGAAATCAAAGCCTTTCTTGCCAATCGGAGGATTTCCCAAGCAGTTGTTGCACAGGTAACAGGTATCA  592

Query  305  GTCAGAGCCGGATCTCTCATTGGCTGTTGCAGCAGGGATCAGACCTGAGTGAACAGAAGAAAAGAGCATTTTAC  378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCAGAGCCGGATCTCTCATTGGCTGTTGCAGCAGGGATCAGACCTGAGTGAACAGAAGAAAAGAGCATTTTAC  666

Query  379  CGATGGTATCAACTTGAGAAGACAAACCCTGGCGCTACACTAAGTATGAGACCAGCCCCCATTCCAATAGAGGA  452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGATGGTATCAACTTGAGAAGACAAACCCTGGCGCTACACTAAGTATGAGACCAGCCCCCATTCCAATAGAGGA  740

Query  453  CCCTGAATGGAGACAAACGCCTCCCCCAGTCTCTGCCACATCTGGTACTTTCCGACTGCGACGAGGGAGTCGAT  526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCTGAATGGAGACAAACGCCTCCCCCAGTCTCTGCCACATCTGGTACTTTCCGACTGCGACGAGGGAGTCGAT  814

Query  527  TTACCTGGAGAAAGGAGTGCCTGGCTGTTATGGAAAGTTACTTCAATGAGAATCAATACCCAGATGAAGCAAAG  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTACCTGGAGAAAGGAGTGCCTGGCTGTTATGGAAAGTTACTTCAATGAGAATCAATACCCAGATGAAGCAAAG  888

Query  601  AGGGAAGAAATTGCAAACGCTTGCAATGCAGTTATACAGAAGCCAGGCAAAAAGCTGTCAGATCTGGAAAGAGT  674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGGAAGAAATTGCAAACGCTTGCAATGCAGTTATACAGAAGCCAGGCAAAAAGCTGTCAGATCTGGAAAGAGT  962

Query  675  TACCTCCCTGAAAGTATATAATTGGTTTGCTAACAGAAGGAAGGAGATCAAGAGGAGAGCCAATATTGCAGCAA  748
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
Sbjct  963  TACCTCCCTGAAAGTATATAATTGGTTTGCTAACAGAAGGAAGGAGATCAAGAGGAGAGCCAATATT---GCAA  1033

Query  749  TCCTGGAGAGTCATGGGATAGATGTGCAGAGTCCAGGAGGCCACTCAAACAGTGATGATGTCGACGGGAATGAC  822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  TCCTGGAGAGTCATGGGATAGATGTGCAGAGTCCAGGAGGCCACTCAAACAGTGATGATGTCGACGGGAATGAC  1107

Query  823  TACTCTGAGCAGGAT-ACTTGGCAAGTAC--GCAATGGGGAGGAGGAGGAGGGAAGA----AGTTCA------G  883
            ||||||||||||||| ||      |||||  ||.||.|.||..|       ..||||    |..|||      |
Sbjct 1108  TACTCTGAGCAGGATGAC------AGTACGAGCCATAGTGACCA-------CCAAGACCCCATCTCATTAGCTG  1168

Query  884  AGGGA--GGCAG-AG--AAGCA--------------------GAGAAGGTAG-----------AAGA-AGAG--  918
            .||.|  ||||| ||  ||.||                    ||.|||| ||           |||| ||||  
Sbjct 1169  TGGAAATGGCAGCAGTCAACCACACTATCTTGGCATTGGCCCGACAAGG-AGCCAACGAAATCAAGACAGAGGC  1241

Query  919  --CGGAGGATC--  927
              .|||.|||.  
Sbjct 1242  CCTGGATGATGAC  1254