Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12695
- Subject:
- NM_153202.3
- Aligned Length:
- 2439
- Identities:
- 1998
- Gaps:
- 441
Alignment
Query 1 ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT 74
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Sbjct 1 ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT 74
Query 75 GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC 148
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Sbjct 75 GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC 148
Query 149 CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC 222
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Sbjct 149 CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC 222
Query 223 CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC 296
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Sbjct 223 CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC 296
Query 297 AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCC 370
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Sbjct 297 AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCC 370
Query 371 CCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGGATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTAT 444
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Sbjct 371 CCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGGATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTAT 444
Query 445 TATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGACTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCT 518
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Sbjct 445 TATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGACTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCT 518
Query 519 CACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTGGGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCC 592
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Sbjct 519 CACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTGGGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCC 592
Query 593 AGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGGAAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTG 666
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Sbjct 593 AGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGGAAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTG 666
Query 667 TTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAAACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCT 740
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Sbjct 667 TTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAAACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCT 740
Query 741 TCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCGGCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACC------------ 802
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Sbjct 741 TCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCGGCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACCGCAGCCGCGTCA 814
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 815 CGCAGGACGCCAACGCCACGCTCTGGGCCTTCCTGCAGTGGCGCCGGGGGCTGTGGGCGCAGCGGCCCCACGAC 888
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 889 TCCGCGCAGCTGCTCACGGGCCGCGCCTTCCAGGGCGCCACAGTGGGCCTGGCGCCCGTCGAGGGCATGTGCCG 962
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 963 CGCCGAGAGCTCGGGAGGCGTGAGCACGGACCACTCGGAGCTCCCCATCGGCGCCGCAGCCACCATGGCCCATG 1036
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 1037 AGATCGGCCACAGCCTCGGCCTCAGCCACGACCCCGACGGCTGCTGCGTGGAGGCTGCGGCCGAGTCCGGAGGC 1110
Query 803 ----------------------------------------------------GCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGC 824
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Sbjct 1111 TGCGTCATGGCTGCGGCCACCGGGCACCCGTTTCCGCGCGTGTTCAGCGCCTGCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGC 1184
Query 825 CTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCT 898
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Sbjct 1185 CTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCT 1258
Query 899 GCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGC 972
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Sbjct 1259 GCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGC 1332
Query 973 TTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAA 1046
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Sbjct 1333 TTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAA 1406
Query 1047 GCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCC 1120
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Sbjct 1407 GCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCC 1480
Query 1121 ACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCA 1194
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Sbjct 1481 ACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCA 1554
Query 1195 TGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCA 1268
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Sbjct 1555 TGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCA 1628
Query 1269 GGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAG 1342
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Sbjct 1629 GGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAG 1702
Query 1343 GGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCA 1416
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Sbjct 1703 GGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCA 1776
Query 1417 GTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCT 1490
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Sbjct 1777 GTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCT 1850
Query 1491 GGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCT 1564
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Sbjct 1851 GGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTGGACCTAGAAT-------------------- 1904
Query 1565 GCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAAC 1638
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Sbjct 1905 ----------------------------------------------------------GGTTTGCAATAGCAAC 1920
Query 1639 CATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAG 1712
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Sbjct 1921 CATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAG 1994
Query 1713 TGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCC 1786
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Sbjct 1995 TGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCC 2068
Query 1787 CAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGA 1860
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Sbjct 2069 CAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGA 2142
Query 1861 AGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGA 1934
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Sbjct 2143 AGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGA 2216
Query 1935 GTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTG 2008
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Sbjct 2217 GTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTG 2290
Query 2009 AGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCA---AGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG 2076
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Sbjct 2291 AGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCAAGCAGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG 2361