Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12714
• Subject: NM_001288749.2
• Aligned Length: 1275
• Identities: 1030
• Gaps: 243

Alignment

Query    1  ATGATTGATGTTTCTCAGGCGGTGTGCTGGCGTTCCATGCGACGTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCT  74
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGCGACGTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCT  38

Query   75  GCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   39  GCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCG  112

Query  149  GGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  113  GGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTT  186

Query  223  CCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  187  CCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTG  260

Query  297  GCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  261  GCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGAC  334

Query  371  TCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  TCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCT  408

Query  445  AGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct  409  AGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCC---------------------------------------  443

Query  519  ATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGC  592
                                                                                      
Sbjct  444  --------------------------------------------------------------------------  443

Query  593  CGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTG  666
                                                                                      
Sbjct  444  --------------------------------------------------------------------------  443

Query  667  ACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAG  740
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  --------------------CAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAG  497

Query  741  CCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  CCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGA  571

Query  815  ATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  ATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGC  645

Query  889  CTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  CTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAG  719

Query  963  CCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCCTGCTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTT  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  CCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCTTGTTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTT  793

Query 1037  GCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  GCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAG  867

Query 1111  GGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACATGGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  GGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACATGGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCG  941

Query 1185  TGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTAGCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  TGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTAGCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTG  1015

Query 1259  CTCAGGACTCCCTCCTC  1275
            |||||||||||||||||
Sbjct 1016  CTCAGGACTCCCTCCTC  1032