Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12859
- Subject:
- NM_001318746.1
- Aligned Length:
- 1062
- Identities:
- 888
- Gaps:
- 174
Alignment
Query 1 ATGCCTGCTTGGGTGATAGATAAATATGGGAAGAATGAAGTGCTTCGATTCACTCAGAACATGATGATGCCTAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATACACTATCCAAATGAAGTCATTGTCAAAGTTCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGACGTTAATATGAGAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTGGTTATGGAGCTACAGCTTTAAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------ATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCCT 48
Query 223 CTGACTCTGGGTCGGGATGTCTCTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 CTGACTCTGGGTCGGGATGTCTCTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAGA 122
Query 297 TGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCTCCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 TGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCTCCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAGG 196
Query 371 TCTCTCACAAACCCAAATCACTCACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 TCTCTCACAAACCCAAATCACTCACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTCT 270
Query 445 GCTATAAACAAAGTTGGTGGCCTGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 GCTATAAACAAAGTTGGTGGCCTGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAGG 344
Query 519 CGGAGTTGGTACTTTTGCTATACAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 CGGAGTTGGTACTTTTGCTATACAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGATG 418
Query 593 CCAGTGAACTTGTAAGGAAGCTTGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 CCAGTGAACTTGTAAGGAAGCTTGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTTG 492
Query 667 AAATCCTTAAAACCATTTGATTTTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 AAATCCTTAAAACCATTTGATTTTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTCT 566
Query 741 CAAGAAATGGTCAGGAGCCACCTATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567 CAAGAAATGGTCAGGAGCCACCTATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATAG 640
Query 815 CAGATGGCATGTTGCAGACAGGAGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 CAGATGGCATGTTGCAGACAGGAGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTAT 714
Query 889 CGCTGGGCATTTTTCATGGCCAGTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCCG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 CGCTGGGCATTTTTCATGGCCAGTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCCG 788
Query 963 GCCAGTTATTGAACAAACCTTTCCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 GCCAGTTATTGAACAAACCTTTCCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCAC 862
Query 1037 GAGGAAAGACTGTAATTAATGTTGTT 1062
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 GAGGAAAGACTGTAATTAATGTTGTT 888