Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12961
• Subject: NM_001081433.3
• Aligned Length: 993
• Identities: 542
• Gaps: 414

Alignment

Query   1  MAVLKLTDQPPLVQAIFSGDPEEIRMLIHKTEDVNTLDSEKRTPLHVAAFLGDAEIIELLILSGARVNAKDNMW  74
           ||||||..|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MAVLKLCEQPPLVQAIFSGDPEEIRMLIHKTEDVNALDSEKRTPLHVAAFLGDAEIIELLILSGARVNAKDNMW  74

Query  75  LTPLHRAVASRSEEAVQVLIKHSADVNARDKNWQTPLHVAAANKAVKCAEVIIPLLSSVNVSDRGGRTALHHAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  LTPLHRAVASRSEEAVQVLIKHSADVNARDKNWQTPLHVAAANKAVKCAEVIIPLLSSVNVSDRGGRTALHHAA  148

Query 149  LNGHVEMVNLLLAKGANINAFDKKDRRALHWAAYMGHLDVVALLINHGAEVTCKDKKGYTPLHAAASNGQINVV  222
           ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 149  LNGHMEMVNLLLAKGANINAFDKKDRRALHWAAYMGHLDVVALLINHGAEVTCKDKKGYTPLHAAASNGQISVV  222

Query 223  KHLLNLGVEIDEINVYGNTALHIACYNGQDAVVNELIDYGANVNQPNNNGFTPLHFAAASTHGALCLELLVNNG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  KHLLNLGVEIDEINVYGNTALHIACYNGQDAVVNELIDYGANVNQPNNSGFTPLHFAAASTHGALCLELLVNNG  296

Query 297  ADVNIQSKDGKSPLHMTAVHGRFTRSQTLIQNGGEIDCVDKDGNTPLHVAARYGHELLINTLITSGADTAKCGI  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 297  ADVNIQSKDGKSPLHMTAVHGRFTRSQTLIQNGGEIDCVDKDGNTPLHVAARHGHELLINTLITSGADTAKCGI  370

Query 371  HSMFPLHLAALNAHSDCCRKLLSSGFEIDTPDKFGRTCLHAAAAGGNVECIKLLQSSGADFHKKDKCGRTPLHY  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  HSMFPLHLAALNAHSDCCRKLLSSGFEIDTPDTFGRTCLHAAAAGGNVECIKLLQSSGADFHKKDKCGRTPLHY  444

Query 445  AAANCHFHCIETLVTTGANVNETDDWGRTALHYAAASDMDRNKTILGNAHDNSEELERARELKEKEATLCLEFL  518
           ||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct 445  AAANCHFHCIKALVTTGANVNETDDWGRTALHYAAASDMDRNKMILGNAHDNSEELERAREVKEKDAALCLEFL  518

Query 519  LQNDANPSIRDKEGYNSIHYAAAYGHRQCLELV-----SCF------VLFSLTHTHTHTPNHRGINCFFPEL--  579
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.     ..|      .|.|..|.......|.........|  
Sbjct 519  LQNDANPSIRDKEGYNSIHYAAAYGHRQCLELLLERTNTGFEESDGGALKSPLHLAAYNGHHQALEVLLQSLVD  592

Query 580  --------------------------------------------------------------------------  579
                                                                                     
Sbjct 593  LDIRDEKGRTALYLAAFKGHTECVEALVNQGASIFVKDNVTKRTPLHASVINGHTLCLRLLLETADNPEVVDVK  666

Query 580  --------------------------------------------------------------------------  579
                                                                                     
Sbjct 667  DAKGQTPLMLAVAYGHIDAVSLLLEKEANVDAVDIVGCTALHRGIMTGHEECVQMLLEQEASILCKDSRGRTPL  740

Query 580  --------------------------------------------------------------------------  579
                                                                                     
Sbjct 741  HYAAARGHATWLNELLQIALSEEDCCLKDNQGYTPLHWACYNGNENCIEVLLEQKCFRKFIGNPFTPLHCAIIN  814

Query 580  --------------------------------------------------------------------------  579
                                                                                     
Sbjct 815  GHESCASLLLGAIDPSIVSCRDDKGRTTLHAAAFGDHAECLQLLLRHDAQVNAVDNSGKTALMMAAENGQAGAV  888

Query 580  --------------------------------------------------------------------------  579
                                                                                     
Sbjct 889  DILVNSAQADLTVKDKDLNTPLHLAISKGHEKCALLILDKIQDESLINAKNSALQTPLHIAARNGLKVVVEELL  962

Query 580  -------------------------------  579
                                          
Sbjct 963  AKGACVLAVDENASRSNGPRSPPGTAVRKEE  993