Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13471
• Subject: NM_001170643.1
• Aligned Length: 915
• Identities: 770
• Gaps: 21

Alignment

Query   1  ATGGGCTCAGCTGGTAGGCTCCACTATCTCGCCATGACTGCTGAAAATCCCACTC-CTGGAGACCTGGCTCCGG  73
           ||||.|||.|..|.|.|||||||.|.|||..||||||||||.||||| |||||.| |||||||||||..|||.|
Sbjct   1  ATGGACTCCGTCGATGGGCTCCAGTGTCTGACCATGACTGCGGAAAA-CCCACCCTCTGGAGACCTGATTCCCG  73

Query  74  CCCCCCTCATCACTTGCAAACTCTGCCTGTGTGAGCAGTCTCTGGACAAGATGACCACACTCCAGGAATGCCAG  147
           ||||.|||.||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|||||.||.||||||
Sbjct  74  CCCCGCTCGTCACTTGCAAGCTCTGCCTGTGTGAACAGTCTCTGGACAAGATGACCATGCTCCAAGAGTGCCAG  147

Query 148  TGCATCTTTTGCACAGCTTGCCTGAAACAGTACATGCAGCTGGCAATCCGAGAAGGATGTGGGTCTCCCATCAC  221
           ||.||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||..||||.|||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 148  TGTATCTTTTGTACACCCTGCCTGAAACAGTATATGGTGCTGTCAATCCGAGAAGGCTGTGGATCTCCTATCAC  221

Query 222  TTGCCCTGACATGGTGTGCCTAAACCACGGGACCCTGCAGGAAGCTGAGATTGCCTGTTTGGTACCTGTGGACC  295
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||.||||..
Sbjct 222  TTGTCCTGACATGGTGTGCCTAAACCACGGGACCCTGCAGGAAACCGAGATTGCCTGTTTGGTGCCTCTGGATG  295

Query 296  AGTTTCAACTTTATCAGAGGTTAAAATTTGAAAGAGAAGTTCATCTGGACCCCTACCGAACATGGTGTCCTGTT  369
           |||||||.||.||||||.||.|.||.||||||.||||.|||||..||||||||..|||.|||||||||||||||
Sbjct 296  AGTTTCAGCTGTATCAGCGGCTCAAGTTTGAACGAGAGGTTCACATGGACCCCCTCCGGACATGGTGTCCTGTT  369

Query 370  GCAGACTGTCAGACAGTGTGCCCTGTTGCCTCGAGTGACCCAGGACAGCCTGTGCTGGTGGAATGCCCTTCTTG  443
           ||||||||.|||||.|||||||.|.||.|..|..|.||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 370  GCAGACTGCCAGACCGTGTGCCATATTTCAGCCGGAGACCCAGGCCAGCCAGTGTTGGTGGAGTGCCCTTCTTG  443

Query 444  CCACCTGAAATTCTGCTCGTGTTGCAAGGATGCTTGGCATGCAGAGGTC-TCCTGTAGAGACAGTCAGCCTATT  516
           ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.| ||..||| ||||||||||||||.||       
Sbjct 444  CCACCTGAAATTCTGCTCATGTTGCAAGGATGCTTGGCACG-AGGAGTCTTCCTGTAGAGACAGCCA-------  509

Query 517  GTC----CTGCCAACAGAGCACCGAGCCCTCTTTGGGACAGATGCAGAAGCCCCCATTAAGCAGTGCCCAGTTT  586
           |||    .|||   |||||||..|.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 510  GTCGGCGATGC---CAGAGCATGGGGCTCTCTTTGGAACGGATGCGGACGCCCCCATCAAGCAGTGCCCGGTTT  580

Query 587  GCCGGGTTTATATCGAACGCAATGAAGGCTGCGCTCAGATGATGTGCAAAAACTGCAAGCATACATTTTGCTGG  660
           ||||..||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 581  GCCGCATTTACATTGAGCGCAACGAAGGCTGCGCCCAGATGATGTGCAAGAACTGCAAGCACACATTTTGCTGG  654

Query 661  TACTGCCTTCAGAACTTGGATAATGACATTTTCCTCAGACATTATGACAAAGGGCCATGCAGGAATAAACTTGG  734
           |||||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 655  TACTGTCTGCAGAACCTGGACAATGACATATTCCTCAGGCACTATGACAAAGGGCCATGCAGGAATAAGCTCGG  728

Query 735  CCACTCAAGAGCATCAGTGATGTGGAACCGAACACAGGTGGTGGGGATTCTCGTAGGCTTGGGCATCATTGCCT  808
           ||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||..|||||||||
Sbjct 729  CCACTCGAGGGCATCGGTAATGTGGAACCGAACACAGGTAGTGGGGATCCTTGTGGGATTAGGTGTCATTGCCT  802

Query 809  TGGTTACTTCCCCCT---TACTCCTGGCCTCCCCATGTATAATCTGTTGTGTCTGCAAGTCCTGTCGGGGCAAG  879
           ||||.||.||.||||   |.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 803  TGGTGACCTCACCCTTGCTGCTCCTGGCCTCTCCCTGTATAATCTGCTGTGTCTGCAAGTCCTGTCGCGGCAAG  876

Query 880  AAGAAAAAGCACGACCCATCCACAACC  906
           |||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 877  AAGAAAAAGCATGATCCATCCACAACC  903