Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13471
- Subject:
- NM_146042.4
- Aligned Length:
- 915
- Identities:
- 770
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGGGCTCAGCTGGTAGGCTCCACTATCTCGCCATGACTGCTGAAAATCCCACTC-CTGGAGACCTGGCTCCGG 73
||||.|||.|..|.|.|||||||.|.|||..||||||||||.||||| |||||.| |||||||||||..|||.|
Sbjct 1 ATGGACTCCGTCGATGGGCTCCAGTGTCTGACCATGACTGCGGAAAA-CCCACCCTCTGGAGACCTGATTCCCG 73
Query 74 CCCCCCTCATCACTTGCAAACTCTGCCTGTGTGAGCAGTCTCTGGACAAGATGACCACACTCCAGGAATGCCAG 147
||||.|||.||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|||||.||.||||||
Sbjct 74 CCCCGCTCGTCACTTGCAAGCTCTGCCTGTGTGAACAGTCTCTGGACAAGATGACCATGCTCCAAGAGTGCCAG 147
Query 148 TGCATCTTTTGCACAGCTTGCCTGAAACAGTACATGCAGCTGGCAATCCGAGAAGGATGTGGGTCTCCCATCAC 221
||.||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||..||||.|||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 148 TGTATCTTTTGTACACCCTGCCTGAAACAGTATATGGTGCTGTCAATCCGAGAAGGCTGTGGATCTCCTATCAC 221
Query 222 TTGCCCTGACATGGTGTGCCTAAACCACGGGACCCTGCAGGAAGCTGAGATTGCCTGTTTGGTACCTGTGGACC 295
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||.||||..
Sbjct 222 TTGTCCTGACATGGTGTGCCTAAACCACGGGACCCTGCAGGAAACCGAGATTGCCTGTTTGGTGCCTCTGGATG 295
Query 296 AGTTTCAACTTTATCAGAGGTTAAAATTTGAAAGAGAAGTTCATCTGGACCCCTACCGAACATGGTGTCCTGTT 369
|||||||.||.||||||.||.|.||.||||||.||||.|||||..||||||||..|||.|||||||||||||||
Sbjct 296 AGTTTCAGCTGTATCAGCGGCTCAAGTTTGAACGAGAGGTTCACATGGACCCCCTCCGGACATGGTGTCCTGTT 369
Query 370 GCAGACTGTCAGACAGTGTGCCCTGTTGCCTCGAGTGACCCAGGACAGCCTGTGCTGGTGGAATGCCCTTCTTG 443
||||||||.|||||.|||||||.|.||.|..|..|.||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 370 GCAGACTGCCAGACCGTGTGCCATATTTCAGCCGGAGACCCAGGCCAGCCAGTGTTGGTGGAGTGCCCTTCTTG 443
Query 444 CCACCTGAAATTCTGCTCGTGTTGCAAGGATGCTTGGCATGCAGAGGTC-TCCTGTAGAGACAGTCAGCCTATT 516
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.| ||..||| ||||||||||||||.||
Sbjct 444 CCACCTGAAATTCTGCTCATGTTGCAAGGATGCTTGGCACG-AGGAGTCTTCCTGTAGAGACAGCCA------- 509
Query 517 GTC----CTGCCAACAGAGCACCGAGCCCTCTTTGGGACAGATGCAGAAGCCCCCATTAAGCAGTGCCCAGTTT 586
||| .||| |||||||..|.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 510 GTCGGCGATGC---CAGAGCATGGGGCTCTCTTTGGAACGGATGCGGACGCCCCCATCAAGCAGTGCCCGGTTT 580
Query 587 GCCGGGTTTATATCGAACGCAATGAAGGCTGCGCTCAGATGATGTGCAAAAACTGCAAGCATACATTTTGCTGG 660
||||..||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 581 GCCGCATTTACATTGAGCGCAACGAAGGCTGCGCCCAGATGATGTGCAAGAACTGCAAGCACACATTTTGCTGG 654
Query 661 TACTGCCTTCAGAACTTGGATAATGACATTTTCCTCAGACATTATGACAAAGGGCCATGCAGGAATAAACTTGG 734
|||||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 655 TACTGTCTGCAGAACCTGGACAATGACATATTCCTCAGGCACTATGACAAAGGGCCATGCAGGAATAAGCTCGG 728
Query 735 CCACTCAAGAGCATCAGTGATGTGGAACCGAACACAGGTGGTGGGGATTCTCGTAGGCTTGGGCATCATTGCCT 808
||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||..|||||||||
Sbjct 729 CCACTCGAGGGCATCGGTAATGTGGAACCGAACACAGGTAGTGGGGATCCTTGTGGGATTAGGTGTCATTGCCT 802
Query 809 TGGTTACTTCCCCCT---TACTCCTGGCCTCCCCATGTATAATCTGTTGTGTCTGCAAGTCCTGTCGGGGCAAG 879
||||.||.||.|||| |.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 803 TGGTGACCTCACCCTTGCTGCTCCTGGCCTCTCCCTGTATAATCTGCTGTGTCTGCAAGTCCTGTCGCGGCAAG 876
Query 880 AAGAAAAAGCACGACCCATCCACAACC 906
|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 877 AAGAAAAAGCATGATCCATCCACAACC 903