Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_13471
Subject:
XM_005248986.3
Aligned Length:
909
Identities:
799
Gaps:
108

Alignment

Query   1  ATGGGCTCAGCTGGTAGGCTCCACTATCTCGCCATGACTGCTGAAAATCCCACTCCTGGAGACCTGGCTCCGGC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGGCTCAGCTGGTAGGCTCCACTATCTCGCCATGACTGCTGAAAATCCCACTCCTGGAGACCTGGCTCCGGC  74

Query  75  CCCCCTCATCACTTGCAAACTCTGCCTGTGTGAGCAGTCTCTGGACAAGATGACCACACTCCAGGAATGCCAGT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCCCCTCATCACTTGCAAACTCTGCCTGTGTGAGCAGTCTCTGGACAAGATGACCACACTCCAGGAATGCCAGT  148

Query 149  GCATCTTTTGCACAGCTTGCCTGAAACAGTACATGCAGCTGGCAATCCGAGAAGGATGTGGGTCTCCCATCACT  222
           |||||||||||||||||                                                         
Sbjct 149  GCATCTTTTGCACAGCT---------------------------------------------------------  165

Query 223  TGCCCTGACATGGTGTGCCTAAACCACGGGACCCTGCAGGAAGCTGAGATTGCCTGTTTGGTACCTGTGGACCA  296
                                                           ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166  ------------------------------------------------ATTGCCTGTTTGGTACCTGTGGACCA  191

Query 297  GTTTCAACTTTATCAGAGGTTAAAATTTGAAAGAGAAGTTCATCTGGACCCCTACCGAACATGGTGTCCTGTTG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192  GTTTCAACTTTATCAGAGGTTAAAATTTGAAAGAGAAGTTCATCTGGACCCCTACCGAACATGGTGTCCTGTTG  265

Query 371  CAGACTGTCAGACAGTGTGCCCTGTTGCCTCGAGTGACCCAGGACAGCCTGTGCTGGTGGAATGCCCTTCTTGC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266  CAGACTGTCAGACAGTGTGCCCTGTTGCCTCGAGTGACCCAGGACAGCCTGTGCTGGTGGAATGCCCTTCTTGC  339

Query 445  CACCTGAAATTCTGCTCGTGTTGCAAGGATGCTTGGCATGCAGAGGTCTCCTGTAGAGACAGTCAGCCTATTGT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340  CACCTGAAATTCTGCTCGTGTTGCAAGGATGCTTGGCATGCAGAGGTCTCCTGTAGAGACAGTCAGCCTATTGT  413

Query 519  CCTGCCAACAGAGCACCGAGCCCTCTTTGGGACAGATGCAGAAGCCCCCATTAAGCAGTGCCCAGTTTGCCGGG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414  CCTGCCAACAGAGCACCGAGCCCTCTTTGGGACAGATGCAGAAGCCCCCATTAAGCAGTGCCCAGTTTGCCGGG  487

Query 593  TTTATATCGAACGCAATGAAGGCTGCGCTCAGATGATGTGCAAAAACTGCAAGCATACATTTTGCTGGTACTGC  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488  TTTATATCGAACGCAATGAAGGCTGCGCTCAGATGATGTGCAAAAACTGCAAGCATACATTTTGCTGGTACTGC  561

Query 667  CTTCAGAACTTGGATAATGACATTTTCCTCAGACATTATGACAAAGGGCCATGCAGGAATAAACTTGGCCACTC  740
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562  CTCCAGAACTTGGATAATGACATTTTCCTCAGACATTATGACAAAGGGCCATGCAGGAATAAACTTGGCCACTC  635

Query 741  AAGAGCATCAGTGATGTGGAACCGAACACAGGTGGTGGGGATTCTCGTAGGCTTGGGCATCATTGCCTTGGTTA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636  AAGAGCATCAGTGATGTGGAACCGAACACAGGTGGTGGGGATTCTCGTAGGCTTGGGCATCATTGCCTTGGTTA  709

Query 815  CTTCCCCC---TTACTCCTGGCCTCCCCATGTATAATCTGTTGTGTCTGCAAGTCCTGTCGGGGCAAGAAGAAA  885
           ||||.|||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710  CTTCACCCTTGTTACTCCTGGCCTCCCCATGTATAATCTGTTGTGTCTGCAAGTCCTGTCGGGGCAAGAAGAAA  783

Query 886  AAGCACGACCCATCCACAACC  906
           |||||||||||||||||||||
Sbjct 784  AAGCACGACCCATCCACAACC  804