Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_13887
Subject:
NM_008449.2
Aligned Length:
957
Identities:
703
Gaps:
233

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGEETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQEQVYNACAKQIVKDV  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  LEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLD  148

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 149  VSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEEVMDVIDEGKANRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEK  222

Query   1  ----------MATYIHVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNC  64
                     .|....||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  KLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNC  296

Query  65  RTTIVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAKTIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNVIQHLEMELNRW  138
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||||||||
Sbjct 297  RTTIVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAKTIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKALKSVLQHLEMELNRW  370

Query 139  RNGEAVPEDEQISAKDQKNLEPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYDEEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEK  212
           ||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.|||. |||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  RNGEAVPEDEQISAKDQKSLEPCDNTPIIDNITPVVDGISA-EKEKYDEEITSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEK  443

Query 213  LKQQMLDQDELLASTRRDYEKIQEELTRLQIENEAAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDE  286
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444  LKQQMLDQDELLASTRRDYEKIQEELTRLQIENEAAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDE  517

Query 287  LAQKTTTLTTTQRELSQLQELSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFTMARLYIS  360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518  LAQKTTTLTTTQRELSQLQELSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFTMARLYIS  591

Query 361  KMKSEVKSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNMEQKRRQLEESQDSLSE  434
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  KMKSEVKSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNMEQKRRQLEESQDSLSE  665

Query 435  ELAKLRSQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQKQLSRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQ  508
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 666  ELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEVKKALEQQMESHREAHQKQLSRLRDEIEEKQRIIDEIRDLNQ  739

Query 509  KLQLEQEKLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKREQAREDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVK  582
           |||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740  KLQLEQERLSSDYNKLKIEDQEREVKLEKLLLLNDKREQAREDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVK  813

Query 583  KSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLENNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKE  656
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814  KSVELDSDDGGGSAAQKQKISFLENNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKE  887

Query 657  NAMRDRKRYQQEVDRIKEAVRAKNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK  725
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 888  NAMRDRKRYQQEVDRIKEAVRAKNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAVRGGGGGSSNSTHYQK  956