Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13944
- Subject:
- NM_134260.2
- Aligned Length:
- 1678
- Identities:
- 1389
- Gaps:
- 285
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAATGAGGGGGCCCCAGGAGACAGTGACTTAGAGACTGAGGCAAGAGTGCCGTGGTCAATCATGGGTCATTG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCTTCGAACTGGACAGGCCAGAATGTCTGCCACACCCACACCTGCAGGTGAAGGAGCCAGAAGGGATGAACTTT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TTGGGATTCTCCAAATACTCCATCAGTGTATCCTGTCTTCAGGTGATGCTTTTGTTCTTACTGGCGTCTGTTGT 222
Query 1 ----------------------------------------------ATGATGTA-----TTTTGTGAT-CGCAG 22
|.||.||| | .||| |
Sbjct 223 TCCTGGAGGCAGAATGGCAAGCCACCATATTCACAAAAGGAAGATAAGGAAGTACAAACT----GGATAC---- 288
Query 23 CGATGAAAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTC 96
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 --ATGAATGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTC 360
Query 97 ATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCA 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCA 434
Query 171 GAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAG 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 GAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAG 508
Query 245 GGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAG 318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 GGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAG 582
Query 319 AAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTA 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 AAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTA 656
Query 393 CAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGG 466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 CAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGG 730
Query 467 GGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGAT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731 GGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGAT 804
Query 541 ATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCAC 614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 ATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCAC 878
Query 615 CAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATC 688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 CAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATC 952
Query 689 TGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAG 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 TGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAG 1026
Query 763 AACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGT 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 AACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGT 1100
Query 837 GGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAG 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 GGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAG 1174
Query 911 GTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGG 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 GTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGG 1248
Query 985 AAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAA 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 AAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAA 1322
Query 1059 GAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATC 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 GAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATC 1396
Query 1133 GCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTA 1206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 GCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTA 1470
Query 1207 CAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGG 1280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 CAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGG 1544
Query 1281 ACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTAT 1354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 ACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTAT 1618
Query 1355 ACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGC-AATTGATGGG 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1619 ACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAATTGATGGG 1668