Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13944
- Subject:
- XM_006510878.2
- Aligned Length:
- 1435
- Identities:
- 1270
- Gaps:
- 42
Alignment
Query 1 ----------------------------ATGA---TGTATTTTGTGATCGCAGCGATGAAAGCTCAAATTGAAA 43
|.|| ||.||..||||| ||.| |||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGCGGGAGTACGCAGCCCGGAACTACGACCTTGGATGCTGTGA--GCTG--------GCTCAAATTGAAA 64
Query 44 TTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAG 117
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 65 TTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCGTCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACGTGTGAAGGCTGCAAG 138
Query 118 GGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCG 191
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 GGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAGAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCG 212
Query 192 AACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAA 265
.|||||.||||||||||||||.||.|||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 213 GACCAGCAGAAACCGCTGCCAGCATTGTCGGCTGCAGAAATGCCTGGCCGTGGGGATGTCTCGAGATGCTGTCA 286
Query 266 AATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAG 339
|.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 287 AGTTTGGTCGGATGTCCAAGAAGCAGAGAGACAGCTTGTACGCCGAGGTGCAGAAGCACCGGATGCAGCAGCAG 360
Query 340 CAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCT 413
|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 361 CAGCGAGACCACCAGCAGCAGCCTGGGGAGGCGGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCAGCCAATGGGCT 434
Query 414 GACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCG 487
|||||||||.||.||.||||||||.|.|||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 435 GACGGAACTGCATGATGACCTCAGCACCTATATGGATGGGCACACCCCCGAGGGCAGCAAGGCCGACTCAGCCG 508
Query 488 TCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAA 561
||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||..|.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 509 TCAGCAGCTTCTACCTGGACATCCAGCCCTCCCCAGACCAGTCGGGATTGGACATCAATGGGATCAAACCCGAA 582
Query 562 CCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAAC 635
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 583 CCCATATGTGACTACACACCAGCATCTGGCTTCTTCCCCTACTGTTCCTTCACCAACGGAGAGACTTCCCCAAC 656
Query 636 TGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGA 709
.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.
Sbjct 657 CGTGTCCATGGCAGAACTAGAACACCTTGCCCAGAACATATCCAAATCCCACCTGGAAACCTGCCAGTACTTGC 730
Query 710 GAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGG 783
|.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.
Sbjct 731 GGGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTCCTGCAGGAGGAGATTGAAAACTACCAGAACAAGCAGAGA 804
Query 784 GAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCAT 857
||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GAGGTGATGTGGCAGCTGTGTGCCATCAAGATTACAGAAGCTATCCAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCAT 878
Query 858 TGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTA 931
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 879 TGATGGATTTATGGAGCTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGCTCGCTAGAGGTGGTGTTTA 952
Query 932 TCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTC 1005
|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 953 TTAGGATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGACGGGAAGTATGCGAGCCCCGATGTC 1026
Query 1006 TTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCT 1079
|||||.|||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1027 TTCAAGTCCCTAGGTTGTGAAGACTTCATCAGCTTTGTGTTTGAATTTGGGAAGAGTTTGTGTTCTATGCACCT 1100
Query 1080 GACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGG 1153
|||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 1101 GACCGAAGACGAAATCGCGTTATTTTCTGCATTCGTACTGATGTCAGCGGATCGCTCGTGGCTTCAGGAAAAGG 1174
Query 1154 TAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGAT 1227
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1175 TAAAAATAGAAAAGCTGCAACAGAAAATTCAGCTGGCCCTTCAGCACGTCCTACAGAAGAACCACCGAGAAGAT 1248
Query 1228 GGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAAT 1301
|||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1249 GGAATTCTAACCAAGCTAATATGCAAGGTGTCTACGTTAAGAGCCCTATGTGGACGACATACGGAAAAGCTAAT 1322
Query 1302 GGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAG 1375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1323 GGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTCCATTTTCCTCCATTATACAAGGAATTGTTCACTTCAG 1396
Query 1376 AATTTGAGCCAGCAATGC-AATTGATGGG 1403
|||||||||||||.|||| |||.||||||
Sbjct 1397 AATTTGAGCCAGCCATGCAAATCGATGGG 1425