Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14210
• Subject: XM_017004495.1
• Aligned Length: 1377
• Identities: 1223
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCAGGTTCCAGGGAATGATGTACAGCTGGAGAAGCAGGTGCCGCTGCCTCGCCTGCTGGAAGGGAGCCC  74

Query    1  -------------------------------------------------------------------------A  1
                                                                                     |
Sbjct   75  GTCAGAGCGACCAGGCTTTTGCTTCATTGGCGCAGACTCTGTGTATGAGAGATGGAGTCTTCCTACTGGAAGCA  148

Query    2  TGGCAGATGCTCCGAAGGAGGGAAGACTGACCCGGTTTCTGGACTTCACCCAGCTGATGGACATGGCATCTGAA  75
            .|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGCTGATGCTCCGAAGGAGGGAAGACTGACCCGGTTTCTGGACTTCACCCAGCTGATGGACATGGCATCTGAA  222

Query   76  TCCGTAGGAGGAAAAATTTTATTTGCAACAGATGACTTTTTTGCTCCTGCAGAAAACCTCATAAAGAGTGACAG  149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCGTAGGAGGAAAAATTTTATTTGCAACAGATGACTTTTTTGCTCCTGCAGAAAACCTCATAAAGAGTGACAG  296

Query  150  CCCGTGCTTCAAAGAGCATGAATATACGGAGTTTGGGAAATGGATGGATGGCTGGGAGACCAGGAGGAAAAGGA  223
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCGTGCTTCAAAGAGCATGAATATACGGAGTTTGGGAAATGGATGGATGGCTGGGAGACCAGGAGGAAAAGGA  370

Query  224  TTCCAGGTCACGACTGGTGTGTCCTCAGGCTGGGGATCCAAGGAGTCATCCGGGGCTTCGACGTGGACGTTTCT  297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCCAGGTCACGACTGGTGTGTCCTCAGGCTGGGGATCCAAGGAGTCATCCGGGGCTTCGACGTGGACGTTTCT  444

Query  298  TACTTCACGGGAGATTACGCTCCTCGAGTGTCCATTCAAGCAGCAAACTTGGAAGAAGATAAACTACCAGAAAT  371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACTTCACGGGAGATTACGCTCCTCGAGTGTCCATTCAAGCAGCAAACTTGGAAGAAGATAAACTACCAGAAAT  518

Query  372  CCCAGAAAGAGGAATCAGGACAGGAGCTGCAGCCACTCCTGAGGAGTTTGAAGCCATTGCTGAGCTAAAATCCG  445
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCAGAAAGAGGAACCAGGACAGGAGCTGCAGCCACTCCTGAGGAGTTTGAAGCCATTGCTGAGCTAAAATCCG  592

Query  446  ACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCACAACTATTTTCTT  519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCACAACTATTTTCTT  666

Query  520  GTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCCAGATGGTGGAATTGCACGACTTAGAGT  593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCCAGATGGTGGAATTGCACGACTTAGAGT  740

Query  594  ATTCGGTACTGGACAAAAAGACTGGACTGCAACTGACCCCAAAGAACCTGCAGACCTAGTGGCCATCGCTTTTG  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTCGGTACTGGACAAAAAGACTGGACTGCAACTGACCCCAAAGAACCTGCAGACCTAGTGGCCATCGCTTTTG  814

Query  668  GGGGTGTCTGTGTAGGATTTAGTAATGCTAAGTTTGGGCACCCAAACAATATAATAGGAGTTGGCGGGGCAAAG  741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGGTGTCTGTGTAGGATTTAGTAATGCTAAGTTTGGGCACCCAAACAATATAATAGGAGTTGGCGGGGCAAAG  888

Query  742  TCTATGGCGGATGGTTGGGAAACTGCAAGAAGGCTGGACCGGCCACCAATATTAGAAAATGATGAGAATGGCAT  815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTATGGCGGATGGTTGGGAAACTGCAAGAAGGCTGGACCGGCCACCAATATTAGAAAATGATGAGAATGGCAT  962

Query  816  TCTCTTGGTTCCGGGTTGTGAATGGGCAGTTTTCCGATTGGCACATCCTGGAGTAATAACTCGAATTGAAATTG  889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTCTTGGTTCCGGGTTGTGAATGGGCAGTTTTCCGATTGGCACATCCTGGAGTAATAACTCGAATTGAAATTG  1036

Query  890  ACACAAAATATTTTGAAGGCAATGCTCCTGACAGCTGTAAAGTGGATGGGTGCATCCTGACAACTCAG---GAA  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||
Sbjct 1037  ACACAAAATATTTTGAAGGCAATGCTCCTGACAGCTGTAAAGTGGATGGGTGCATCCTGACAACTCAGGAAGAA  1110

Query  961  GAAGCCGTGATCAGGCAAAAGTGGATTCTCCCGGCCCACAAGTGGAAACCACTGCTTCCAGTGACCAAGTTGTC  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGCCGTGATCAGGCAAAAGTGGATTCTCCCGGCCCACAAGTGGAAACCACTGCTTCCAGTGACCAAGTTGTC  1184

Query 1035  TCCCAACCAAAGTCATCTGTTCGATAGCCTGACCCTAGAGCTCCAAGATGTCATCACTCACGCCAGGCTCACCA  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCCAACCAAAGTCATCTGTTCGATAGCCTGACCCTAGAGCTCCAAGATGTCATCACTCACGCCAGGCTCACCA  1258

Query 1109  TCGTCCCCGACGGGGGAGTGAGCCGCCTTCGGCTCCGGGGCTTCCCCAGCTCCATCTGCCTCCTGAGGCCCCGG  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCGTCCCCGACGGGGGAGTGAGCCGCCTTCGGCTCCGGGGCTTCCCCAGCTCCATCTGCCTCCTGAGGCCCCGG  1332

Query 1183  GAGAAGCCCATGTTGAAGTTCTCGGTGAGCTTCAAAGTAAACCCT  1227
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1333  GAGAAGCCCATGTTGAAGTTCTCGGTGAGCTTCAAAGCAAACCCT  1377