Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14274
• Subject: NM_024833.3
• Aligned Length: 1668
• Identities: 1602
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGTTGTCCCCAGTGTCCCGAGACGCGTCTGATGCTCTGCAGGGACGGAAGTGCCTGCGTCCCCGATCGAGACG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGTCCCCAGTGTCCCGAGACGCGTCTGATGCTCTGCAGGGACGGAAGTGCCTGCGTCCCCGATCGAGACG  74

Query   75  CCTGCCGCTCCCGGCAGCTGTCCGCGCCCACGGTCCTATGGCGGAGCTAACGGACTCCGCGCGGGGCTGTGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGCCGCTCCCGGCAGCTGTCCGCGCCCACGGTCCTATGGCGGAGCTAACGGACTCCGCGCGGGGCTGTGTGG  148

Query  149  TCTTTGAGGATGTGTTTGTATACTTCTCTCGGGAAGAATGGGAGCTTCTTGATGATGCTCAGAGACTTTTGTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTTTGAGGATGTGTTTGTATACTTCTCTCGGGAAGAATGGGAGCTTCTTGATGATGCTCAGAGACTTTTGTAC  222

Query  223  CATGATGTGATGCTGGAGAACTTTGCACTTTTAGCCTCACTGGGAATTGCATTTTCCAGATCACGTGCAGTCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATGATGTGATGCTGGAGAACTTTGCACTTTTAGCCTCACTGGGAATTGCATTTTCCAGATCACGTGCAGTCAT  296

Query  297  GAAACTAGAGCGAGGAGAAGAGCCCTGGGTGTATGACCAGGTGGATATGACTTCAGCCACAGAAAGAGAGGCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAACTAGAGCGAGGAGAAGAGCCCTGGGTGTATGACCAGGTGGATATGACTTCAGCCACAGAAAGAGAGGCCC  370

Query  371  AGAGGGGACTTAGACCTGGTTGTTGGCATGGAGTGGAGGATGAAGAGGTATCTTCTGAGCAGAGCATTTTTGTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGGGGACTTAGACCTGGTTGTTGGCATGGAGTGGAGGATGAAGAGGTATCTTCTGAGCAGAGCATTTTTGTA  444

Query  445  GCAGGAGTGTCAGAGGTCAGGACTCTCATGGCAGAGCTGGAGTCTCACCCATGTGACATATGTGGCCCAATATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGGAGTGTCAGAGGTCAGGACTCTCATGGCAGAGCTGGAGTCTCACCCATGTGACATATGTGGCCCAATATT  518

Query  519  GAAAGATACCTTACACCTGGCTAAATACCATGGGGGAAAAGCCAGGCAGAAACCATACTTGTGTGGGGCATGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAAGATACCTTACACCTGGCTAAATACCATGGGGGAAAAGCCAGGCAGAAACCATACTTGTGTGGGGCATGTG  592

Query  593  GAAAGCAATTCTGGTTCAGTACAGACTTTGACCAGCACCAGAACCAGCCCAATGGAGGGAAACTTTTCCCAAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAAGCAATTCTGGTTCAGTACAGACTTTGACCAGCACCAGAACCAGCCCAATGGAGGGAAACTTTTCCCAAGG  666

Query  667  AAGGAGGGCAGAGACTCTGTGAAAAGCTGCAGAGTCCATGTGCCAGAGAAGACCCTCACATGTGGGAAAGGTAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGAGGGCAGAGACTCTGTGAAAAGCTGCAGAGTCCATGTGCCAGAGAAGACCCTCACATGTGGGAAAGGTAG  740

Query  741  GAGAGACTTTTCAGCCACATCTGGCCTTCTTCAGCATCAGGCCTCTCTCAGCAGCATGAAGCCCCACAAGAGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGAGACTTTTCAGCCACATCTGGCCTTCTTCAGCATCAGGCCTCTCTCAGCAGCATGAAGCCCCACAAGAGCA  814

Query  815  CTAAGCTTGTGAGTGGCTTTCTCATGGGACAGAGGTATCACAGGTGTGGTGAATGTGGGAAAGCCTTCACCCGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTAAGCTTGTGAGTGGCTTTCTCATGGGACAGAGGTATCACAGGTGTGGTGAATGTGGGAAAGCCTTCACCCGC  888

Query  889  AAAGACACACTTGCTCGGCATCAGAGAATCCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGTAACGAATGTGGGAAATT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGACACACTTGCTCGGCATCAGAGAATCCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGTAACGAATGTGGGAAATT  962

Query  963  CTTCAGCCAAAGCTATGACCTCTTTAAACACCAGACAGTTCACACTGGAGAAAGGCCATACGAGTGCAGCGAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTCAGCCAAAGCTATGACCTCTTTAAACACCAGACAGTTCACACTGGAGAAAGGCCATACGAGTGCAGCGAAT  1036

Query 1037  GTGGGAAATTCTTTAGACAAATCTCCGGCCTGATTGAGCACAGGCGAGTTCACACGGGTGAAAGACTCTATCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGGGAAATTCTTTAGACAAATCTCCGGCCTGATTGAGCACAGGCGAGTTCACACGGGTGAAAGACTCTATCAG  1110

Query 1111  TGTGGCAAATGTGGGAAATTTTTTAGCAGTAAGTCTAATCTCATTCGACACCAGGAAGTTCACACAGGAGCCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGTGGCAAATGTGGGAAATTTTTTAGCAGTAAGTCTAATCTCATTCGACACCAGGAAGTTCACACAGGAGCCAG  1184

Query 1185  GCCTTATGTATGCAGCGAATGTGGGAAAGAGTTCAGTCGGAAACACACACTTGTTCTGCACCAACGAACTCACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCTTATGTATGCAGCGAATGTGGGAAAGAGTTCAGTCGGAAACACACACTTGTTCTGCACCAACGAACTCACA  1258

Query 1259  CTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGCCTTTAGCCAAAGCTCCCACCTTAATGTACACTGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGCCTTTAGCCAAAGCTCCCACCTTAATGTACACTGG  1332

Query 1333  AGAATTCACAGCAGTGATTATGAGTGTAGCAGATGTGGTAAAGCTTTCAGCTGCATCTCCAAACTCATTCAGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGAATTCACAGCAGTGATTATGAGTGTAGCAGATGTGGTAAAGCTTTCAGCTGCATCTCCAAACTCATTCAGCA  1406

Query 1407  CCAGAAAGTTCACTCTGGAGAAAAGCCTTATGAGTGCAGCAAGTGCGGGAAAGCCTTCACTCAAAGACCCAACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCAGAAAGTTCACTCTGGAGAAAAGCCTTATGAGTGCAGCAAGTGCGGGAAAGCCTTCACTCAAAGACCCAACC  1480

Query 1481  TCATCAGGCACTGGAAAGTCCACACTGGGGAAAGGCCTTATGTGTGTAGTGAGTGCGGGAGAGAATTCATCCGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCATCAGGCACTGGAAAGTCCACACTGGGGAAAGGCCTTATGTGTGTAGTGAGTGCGGGAGAGAATTCATCCGG  1554

Query 1555  AAACAGACACTTGTTCTGCACCAGAGGGTTCATGCTGGAGAAAAGCTTAAGAGTGTAGCAAATGTGGGGGAAAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct 1555  AAACAGACACTTGTTCTGCACCAGAGGGTTCATGCTGGAGAAAAGCTT--------------------------  1602

Query 1629  TCTTAGGCCAATGCCCCTGACTTACTATCTGGTGGGCAAC  1668
                                                    
Sbjct 1603  ----------------------------------------  1602