Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_14299
Subject:
NM_001317781.1
Aligned Length:
840
Identities:
555
Gaps:
284

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MDKALKEVFDYSYRDYILSWYGNLSRDEGQLYHLLLEDFWEIARQLHHRLSHVDVVKVVCNDVVRTLLTHFCDL  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  KAANARHEEQPRPFVLHACLRNSDDEVRFLQTCSRVLVFCLLPSKDVQSLSLRIMLAEILTTKVLKPVVELLSN  148

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 149  PDYINQMLLAQLAYREQMNEHHKRAYTYAPSYEDFIKLINSNSDVEFLKQLRYQIVVEIIQATTISSFPQLKRH  222

Query   1  -------MKADLLRARNMKRYINQLTVAKKQCEKRIRILGGPAYDQQEDGALDEGEGPQSQKILQFEDILANTF  67
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  KGKETAAMKADLLRARNMKRYINQLTVAKKQCEKRIRILGGPAYDQQEDGALDEGEGPQSQKILQFEDILANTF  296

Query  68  YREHFGMYMERMDKRALISFWESVEHLKNANKNEIPQLVGEIYQNFFVESKEISVEKSLYKEIQQCLVGNKGIE  141
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  YREHFGMYMERMDKRALISFWESVEHLKNANKNEIPQLVGEIYQNFFVESKEISVEKSLYKEIQQCLVGNKGIE  370

Query 142  VFYKIQEDVYETLKDRYYPSFIVSDLYEKLLIKEEEKHASQMISNKDEMGPRDEAGEEAVDDGTNQINEQASFA  215
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  VFYKIQEDVYETLKDRYYPSFIVSDLYEKLLIKEEEKHASQMISNKDEMGPRDEAGEEAVDDGTNQINEQASFA  444

Query 216  VNKLRELNEKLEYKRQALNSIQNAPKPDKKIVSKLKDEIILIEKERTDLQLHIARTDWWCENLGMWKASITSGE  289
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 445  VNKLRELNEKLEYKRQALNSIQNAPKPDKKIVSKLKDEIILIEKERTDLQLHMARTDWWCENLGMWKASITSGE  518

Query 290  VTEENGEQLPCYFVMVSLQEVGGVETKNWTVPRRLSEFQNLHRKLSECVPSLKKVQLPSLSKLPFKSIDQKFME  363
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  VTEENGEQLPCYFVMVSLQEVGGVETKNWTVPRRLSEFQNLHRKLSECVPSLKKVQLPSLSKLPFKSIDQKFME  592

Query 364  KSKNQLNKFLQ-------------------------------------------------------EETEEDSD  382
           |||||||||||                                                       ||||||||
Sbjct 593  KSKNQLNKFLQNLLSDERLCQSEALYAFLSPSPDYLKVIDVQGKKNSFSLSSFLERLPRDFFSHQEEETEEDSD  666

Query 383  LSDYGDDVDGRKDALAEPCFMLIGEIFELRGMFKWVRRTLIALVQVTFGRTINKQIRDTVSWIFSEQMLVYYIN  456
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  LSDYGDDVDGRKDALAEPCFMLIGEIFELRGMFKWVRRTLIALVQVTFGRTINKQIRDTVSWIFSEQMLVYYIN  740

Query 457  IFRDAFWPNGKLAPPTTIRSKEQSQETKQRAQQKLLENIPDMLQSLVGQQNARHGIIKIFNALQETRANKHLLY  530
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  IFRDAFWPNGKLAPPTTIRSKEQSQETKQRAQQKLLENIPDMLQSLVGQQNARHGIIKIFNALQETRANKHLLY  814

Query 531  ALMELLLIELCPELRVHLDQLKAGQV  556
           ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  ALMELLLIELCPELRVHLDQLKAGQV  840