Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14345
• Subject: XM_017013979.2
• Aligned Length: 1167
• Identities: 927
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  ATGTTGGCGCCACCAGCTGGTGAGGGCCCTGGGGTGGACCTGGCGGCCAAAGCCCAGGTGTGGCTGGAGCAGGT  74
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGGCGCCAGCAGCTGGTGAGGGCCCTGGGGTGGACCTGGCGGCCAAAGCCCAGGTGTGGCTGGAGCAGGT  74

Query   75  GTGTGCCCACCTGGGGCTGGGGGTGCAGGAGCCACATCCAGGCGAGCGGGCAGCCTTTGTGGCCTATGCCTTGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGTGCCCACCTGGGGCTGGGGGTGCAGGAGCCGCATCCAGGCGAGCGGGCAGCCTTTGTGGCCTATGCCTTGG  148

Query  149  CTTTTCCCCGGGCCTTCCAGGGCCTCCTGGACACCTACAGCGTGTGGAGGAGTGGTCTCCCCAACTTCCTAGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTTTCCCCGGGCCTTCCAGGGCCTCCTGGACACCTACAGCGTGTGGAGGAGTGGTCTCCCCAACTTCCTAGCA  222

Query  223  GTCGCCTTGGCCCTGGGAGAGCTGGGCTACCGGGCAGTGGGCGTGAGGCTGGACAGTGGTGACCTGCTACAGCA  296
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCGCCCTGGCCCTGGGAGAGCTGGGCTACCGGGCAGTGGGCGTGAGGCTGGACAGTGGTGACCTGCTACAGCA  296

Query  297  GGCTCAGGAGATCCGCAAGGTCTTCCGAGCTGCTGCAGCCCAGTTCCAGGTGCCCTGGCTGGAGTCAGTCCTCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCTCAGGAGATCCGCAAGGTCTTCCGAGCTGCTGCAGCCCAGTTCCAGGTGCCCTGGCTGGAGTCAGTCCTCA  370

Query  371  TCGTAGTCAGCAACAACATTGACGAGGAGGCGCTGGCCCGACTGGCCCAGGAGGGCAGTGAGGTGAATGTCATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCGTAGTCAGCAACAACATTGACGAGGAGGCGCTGGCCCGACTGGCCCAGGAGGGCAGTGAGGTGAATGTCATT  444

Query  445  GGCATTGGCACCAGTGTGGTCACCTGCCCCCAACAGCCTTCCCTGGGTGGCGTCTATAAGCTGGTGGCCGTGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCATTGGCACCAGTGTGGTCACCTGCCCCCAACAGCCTTCCCTGGGTGGCGTCTATAAGCTGGTGGCCGTGGG  518

Query  519  GGGCCAGCCACGAATGAAGCTGACCGAGGACCCCGAGAAGCAGACGTTGCCTGGGAGCAAGGCTGCTTTCCGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGCCAGCCACGAATGAAGCTGACCGAGGACCCCGAGAAGCAGACGTTGCCTGGGAGCAAGGCTGCTTTCCGGC  592

Query  593  TCCTGGGCTCTGACGGGTCTCCACTCATGGACATGCTGCAGTTAGCAGAAGAGCCAGTGCCACAGGCTGGGCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCTGGGCTCTGACGGGTCTCCACTCATGGACATGCTGCAGTTAGCAGAAGAGCCAGTGCCACAGGCTGGGCAG  666

Query  667  GAGCTGAGGGTGTGGCCTCCAGGGGCCCAGGAGCCCTGCACCGTGAGGCCAGCCCAGGTGGAGCCACTACTGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCTGAGGGTGTGGCCTCCAGGGGCCCAGGAGCCCTGCACCGTGAGGCCAGCCCAGGTGGAGCCACTACTGCG  740

Query  741  GCTCTGCCTCCAGCAGGGACAGCTGTGTGAGCCGCTCCCATCCCTGGCAGAGTCTAGAGCCTTGGCCCAGCTGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTCTGCCTCCAGCAGGGACAGCTGTGTGAGCCGCTCCCATCCCTGGCAGAGTCTAGAGCCTTGGCCCAGCTGT  814

Query  815  CCCTGAGCCGACTCAGCCCTGAGCACAGGCGGCTGCGGAGCCCTGCACAGTAC---------------------  867
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  815  CCCTGAGCCGACTCAGCCCTGAGCACAGGCGGCTGCGGAGCCCTGCACAGTACCAGGTTGGGGGGAGGCCCACC  888

Query  868  ----------------------------------------------------------------CAGGTGGTGC  877
                                                                            ||||||||||
Sbjct  889  CTGTCATTCTGCCCTGTGCGCCCCCGCCCTCACCCTGCCCACCGCTCCTGTCCTCTGCTCCCTGCAGGTGGTGC  962

Query  878  TGTCCGAGAGGCTGCAGGCCCTGGTGAACAGTCTGTGTGCGGGGCAGTCCCCC---------------------  930
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  963  TGTCCGAGAGGCTGCAGGCCCTGGTGAACAGTCTGTGTGCGGGGCAGTCCCCCTGAGACTCGGAGCGGGGCTGA  1036

Query  931  --------------------------------------------------------------------------  930
                                                                                      
Sbjct 1037  CTGGAAACAACACGAATCACTCACTTTTCCCCACAGCTTGTCCTGTGTTGTTTGTGTCGTTTGTTCACCCAGCC  1110

Query  931  ---------------------------------------------------------  930
                                                                     
Sbjct 1111  CACGGGCTGCGCCTCCCGGGCTGCGGCTGGGCTGGAGTCGGGAATCTGAGCTCGAGG  1167