Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14638
- Subject:
- XM_011242120.1
- Aligned Length:
- 2467
- Identities:
- 2206
- Gaps:
- 14
Alignment
Query 1 ATGTGGAGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACACTCTGCACCGCTAGGCCGTCCCC 74
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..||||
Sbjct 1 ATGTGGGGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACTCTCTGCACTGCCAGGCCAGCCCC 74
Query 75 GACCTTGCCTGAACAAGCCCAGCCCTGGGGAGCCCCTGTGGAAGTGGAGTCCTTCCTGGTCCACCCCGGTGACC 148
.|||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||
Sbjct 75 AACCTTGCCTGAACAAGCTCAGCCCTGGGGAGTCCCTGTGGAAGTGGAGTCTCTCCTGGTCCACCCTGGCGACC 148
Query 149 TGCTGCAGCTTCGCTGTCGGCTGCGGGACGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGACGGGGTGCAGCTGGCG 222
||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 149 TGCTACAGCTTCGCTGTCGGCTTCGCGATGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGATGGGGTGCAGCTGGTG 222
Query 223 GAAAGCAACCGCACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCAGGACTCCGTGCCCGCAGACTCCGGCCTCTA 296
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 223 GAGAGCAACCGTACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCGGGACTCCATCCCCGCTGACTCTGGCCTCTA 296
Query 297 TGCTTGCGTAACCAGCAGCCCCTCGGGCAGTGACACCACCTACTTCTCCGTCAATGTTTCAGATGCTCTCCCCT 370
.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 297 CGCTTGCGTGACCAGCAGCCCCTCTGGCAGCGATACCACCTACTTCTCCGTCAATGTCTCAGATGCACTCCCAT 370
Query 371 CCTCGGAGGATGATGATGATGATGATGACTCCTCTTCAGAGGAGAAAGAAACAGATAACACCAAACCAAAC--- 441
|||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CCTCGGAAGATGATGACGACGACGATGACTCCTCCTCGGAGGAGAAAGAGACGGACAACACCAAACCAAACCGT 444
Query 442 ---CCCGTAGCTCCATATTGGACATCCCCAGAAAAGATGGAAAAGAAATTGCATGCAGTGCCGGCTGCCAAGAC 512
||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 445 AGGCCTGTAGCTCCCTACTGGACATCCCCAGAGAAAATGGAGAAGAAACTGCATGCGGTGCCCGCTGCCAAGAC 518
Query 513 AGTGAAGTTCAAATGCCCTTCCAGTGGGACCCCAAACCCCACACTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAATTCA 586
.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 519 GGTGAAGTTCAAGTGCCCGTCGAGTGGGACACCCAACCCCACTCTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAGTTTA 592
Query 587 AACCTGACCACAGAATTGGAGGCTACAAGGTCCGTTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGACTCTGTGGTGCCC 660
|.|||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 593 AGCCTGACCACCGAATTGGAGGCTACAAGGTTCGCTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGATTCTGTGGTGCCT 666
Query 661 TCTGACAAGGGCAACTACACCTGCATTGTGGAGAATGAGTACGGCAGCATCAACCACACATACCAGCTGGATGT 734
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 667 TCTGACAAGGGCAACTACACCTGCATCGTGGAGAATGAGTATGGGAGCATCAACCACACCTACCAGCTTGACGT 740
Query 735 CGTGGAGCGGTCCCCTCACCGGCCCATCCTGCAAGCAGGGTTGCCCGCCAACAAAACAGTGGCCCTGGGTAGCA 808
||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CGTGGAACGATCTCCGCACCGACCCATCCTTCAGGCAGGGCTGCCTGCCAACAAGACAGTGGCCCTGGGCAGCA 814
Query 809 ACGTGGAGTTCATGTGTAAGGTGTACAGTGACCCGCAGCCGCACATCCAGTGGCTAAAGCACATCGAGGTGAAT 882
|.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 815 ATGTGGAGTTCATGTGTAAGGTGTACAGCGATCCGCAGCCTCACATTCAGTGGCTGAAGCACATCGAGGTGAAC 888
Query 883 GGGAGCAAGATTGGCCCAGACAACCTGCCTTATGTCCAGATCTTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAA 956
|||||.|||||.||.|||||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGAGTAAGATCGGGCCAGACAACTTGCCGTATGTCCAGATCCTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAA 962
Query 957 AGAGATGGAGGTGCTTCACTTAAGAAATGTCTCCTTTGAGGACGCAGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACT 1030
.||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAAATGGAGGTGCTTCATCTACGGAATGTCTCCTTTGAGGATGCGGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACT 1036
Query 1031 CTATCGGACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGGCCGGCAGTGATGACC 1104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1037 CTATCGGACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGACCAGCTGTGATGACC 1110
Query 1105 TCGCCCCTGTACCTGGAGATCATCATCTATTGCACAGGGGCCTTCCTCATCTCCTGCATGGTGGGGTCGGTCAT 1178
||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||.|||||
Sbjct 1111 TCACCGCTCTACCTGGAGATCATTATCTACTGCACCGGGGCCTTCCTGATCTCCTGCATGTTGGGCTCTGTCAT 1184
Query 1179 CGTCTACAAGATGAAGAGTGGTACCAAGAAGAGTGACTTCCACAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGA 1252
|.||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATCTATAAGATGAAGAGCGGCACCAAGAAGAGCGACTTCCATAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGA 1258
Query 1253 GCATCCCTCTGCGCAGACAGGTAACAGTGTCTGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTTCTGGTT 1326
|||||||||||||||||||| |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 GCATCCCTCTGCGCAGACAG------GTGTCAGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTCCTGGTT 1326
Query 1327 CGGCCATCACGGCTCTCCTCCAGTGGGACTCCCATGCTAGCAGGGGTCTCTGAGTATGAGCTTCCCGAAGACCC 1400
|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct 1327 CGGCCCTCACGGCTCTCCTCCAGCGGGACCCCCATGCTGGCTGGAGTCTCCGAATATGAGCTCCCTGAGGATCC 1400
Query 1401 TCGCTGGGAGCTGCCTCGGGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCCCTGGGAGAGGGCTGCTTTGGGCAGGTGGTGT 1474
.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1401 CCGCTGGGAGCTGCCACGAGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCACTTGGCGAGGGCTGCTTCGGGCAGGTGGTGT 1474
Query 1475 TGGCAGAGGCTATCGGGCTGGACAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCTGTGAAGATGTTGAAGTCG 1548
||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1475 TGGCTGAGGCCATCGGGCTGGATAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCCGTGAAGATGTTGAAGTCC 1548
Query 1549 GACGCAACAGAGAAAGACTTGTCAGACCTGATCTCAGAAATGGAGATGATGAAGATGATCGGGAAGCATAAGAA 1622
||||||||.|||||.|||.||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1549 GACGCAACGGAGAAGGACCTGTCGGATCTGATCTCGGAGATGGAGATGATGAAAATGATTGGGAAGCACAAGAA 1622
Query 1623 TATCATCAACCTGCTGGGGGCCTGCACGCAGGATGGTCC-CTTGTATGTCATCGTGGAGTATGCCTCCAAGGGC 1695
||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||| ||| ||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1623 TATCATCAACCTTCTGGGAGCGTGCACACAGGATGGTCCTCTT-TATGTCATTGTGGAGTACGCCTCCAAAGGC 1695
Query 1696 AACCTGCGGGAGTACCTGCAGGCCCGGAGGCCCCCAGGGCTGGAATACTGCTACAACCCCAGCCACAACCCAGA 1769
||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1696 AATCTCCGGGAGTATCTACAGGCCCGGAGGCCTCCTGGGCTGGAGTACTGCTATAACCCCAGCCACAACCCCGA 1769
Query 1770 GGAGCAGCTCTCCTCCAAGGACCTGGTGTCCTGCGCCTACCAGGTGGCCCGAGGCATGGAGTATCTGGCCTCCA 1843
|||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1770 GGAACAGCTGTCTTCCAAAGATCTGGTATCCTGTGCCTATCAGGTGGCTCGGGGCATGGAGTATCTTGCCTCTA 1843
Query 1844 AGAAGTGCATACACCGAGACCTGGCAGCCAGGAATGTCCTGGTGACAGAGGACAATGTGATGAAGATAGCAGAC 1917
|||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1844 AGAAGTGTATACACCGAGACCTGGCTGCTAGGAACGTCCTGGTGACCGAGGATAACGTAATGAAGATCGCAGAC 1917
Query 1918 TTTGGCCTCGCACGGGACATTCACCACATCGACTACTATAAAAAGACAACCAACGGCCGACTGCCTGTGAAGTG 1991
||||||.|.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1918 TTTGGCTTAGCTCGAGACATTCATCATATCGACTACTACAAGAAAACCACCAACGGCCGGCTGCCTGTGAAGTG 1991
Query 1992 GATGGCACCCGAGGCATTATTTGACCGGATCTACACCCACCAGAGTGATGTGTGGTCTTTCGGGGTGCTCCTGT 2065
||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||
Sbjct 1992 GATGGCCCCTGAGGCGTTGTTTGACCGGATCTACACACACCAGAGCGATGTGTGGTCTTTTGGAGTGCTCTTGT 2065
Query 2066 GGGAGATCTTCACTCTGGGCGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAG 2139
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066 GGGAGATCTTCACTCTGGGTGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAG 2139
Query 2140 GGTCACCGCATGGACAAGCCCAGTAACTGCACCAACGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGT 2213
|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2140 GGTCATCGAATGGACAAGCCCAGTAACTGTACCAATGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGT 2213
Query 2214 GCCCTCACAGAGACCCACCTTCAAGCAGCTGGTGGAAGACCTGGACCGCATCGTGGCCTTGACCTCCAACCAGG 2287
||||||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 GCCCTCTCAGAGACCTACGTTCAAGCAGTTGGTGGAAGACCTGGACCGCATTGTGGCCTTGACCTCCAACCAGG 2287
Query 2288 AGTACCTGGACCTGTCCATGCCCCTGGACCAGTACTCCCCCAGCTTTCCCGACACCCGGAGCTCTACGTGCTCC 2361
||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 2288 AGTATCTGGACCTGTCCATACCGCTGGACCAGTACTCACCCAGCTTTCCCGACACACGGAGCTCCACCTGCTCC 2361
Query 2362 TCAGGGGAGGATTCCGTCTTCTCTCATGAGCCGCTGCCCGAGGAGCCCTGCCTGCCCCGACACCCAGCCCAGCT 2435
|||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||..|||||||
Sbjct 2362 TCAGGGGAGGACTCTGTCTTCTCTCATGAGCCGTTACCTGAGGAGCCCTGTCTGCCTCGACACCCCACCCAGCT 2435
Query 2436 TGCCAATGGCGGACTCAAACGCCGC 2460
||||||..|.|||||||||||.|||
Sbjct 2436 TGCCAACAGTGGACTCAAACGGCGC 2460