Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14692
- Subject:
- XM_011514622.3
- Aligned Length:
- 1755
- Identities:
- 1353
- Gaps:
- 390
Alignment
Query 1 ATGAACCGATACACAACCATGAGACAGTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCGATACACAACCATGAGACAGTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGA 74
Query 75 ATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAAGGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAAGGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAG 148
Query 149 AAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAATCATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAATCATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCAT 222
Query 223 CTTTATTTTATATTTGAATATATGAAAGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTTATTTTATATTTGAATATATGAAAGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGA 296
Query 297 ATCAGTCATCAGAAATATTATGTATCAAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCAGTCATCAGAAATATTATGTATCAAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATA 370
Query 371 GGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTTTGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTTTGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGA 444
Query 445 GAATTAAGGTCACAGCCACCATACACTGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAATTAAGGTCACAGCCACCATACACTGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAG 518
Query 519 ATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTGATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTGATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGC 592
Query 593 CACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTCGATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTCGATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGT 666
Query 667 GACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGCATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGCATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAA 740
Query 741 AACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATGAAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATGAAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAAC 814
Query 815 GACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAACACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAACACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCAT 888
Query 889 CTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAAGCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAAGCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCC 962
Query 963 TAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATCAGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATCAGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGC 1036
Query 1037 CCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGCGTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGCGTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACG 1110
Query 1111 CTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACATGCCAACTAAGCCAAATGGCACACTGAGTCATAAAAGTGGTAGGAGGCG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACATGCCAACTAAGCCAAATGGCACACTGAGTCATAAAAGTGGTAGGAGGCG 1184
Query 1185 TTGGGGTCAGACTATCTTCAAGTCTGGAGATAGCTGGGAAGAGTTGGAGGACTATGATTTCGGAGCCTCCCATT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTGGGGTCAGACTATCTTCAAGTCTGGAGATAGCTGGGAAGAGTTGGAGGACTATGATTTCGGAGCCTCCCATT 1258
Query 1259 CCAAGAAGCCAAGCATGGGTGTTTTTAAAGAAAAAAGGAAAAAAGATTCTCCATTTCG---------------- 1316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCAAGAAGCCAAGCATGGGTGTTTTTAAAGAAAAAAGGAAAAAAGATTCTCCATTTCGGCTTCCAGAGCCAGTA 1332
Query 1317 ------------------TCAACAGGTGAAGA------------TGGCTGTTATTTCCCTCTCAGCACACCAGT 1360
||.|||||.|||.| | |||||||.|||||| .|.|.|.|.
Sbjct 1333 CCCTCAGGCTCCAACCACTCGACAGGGGAAAACAAGAGCTTACCT-GCTGTTACTTCCCT-----AAAATCTGA 1400
Query 1361 TTCCCA--CGTTA------------------------------------------------------------- 1371
||||.| .||.|
Sbjct 1401 TTCCGAATTGTCAACTGCTCCAACCTCTAAACAGTACTACTTGAAACAATCAAGATATCTTCCAGGTGTGAATC 1474
Query 1372 -------------------------------------------------------------------------- 1371
Sbjct 1475 CCAAGAAGGTGTCCTTGATAGCCAGTGGAAAGGAAATAAACCCCCACACTTGGAGCAACCAGTTATTCCCCAAG 1548
Query 1372 -------------------------------------------------------------------------- 1371
Sbjct 1549 TCACTGGGACCCGTTGGGGCAGAACTTGCTTTCAAAAGGAGCAATGCAGAATATACCTGGAACACAAAAACTGG 1622
Query 1372 -------------------------------------------------------------------------- 1371
Sbjct 1623 TCGGGGGCAGTTTTCAGGACGTACTTATAATCCTACAGCAAAAAACCTAAATATTGTGAACCGTGCACAGCCCA 1696
Query 1372 ----------------------------------------------------- 1371
Sbjct 1697 TTCCCTCAGTGCATGGGAGGACAGACTGGGTGGCCAAGTATGGAGGCCACCGG 1749