Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14692
• Subject: XM_024446444.1
• Aligned Length: 1384
• Identities: 1199
• Gaps: 173

Alignment

Query    1  ATGAACCGATACACAACCATGAGACAGTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCGATACACAACCATGAGACAGTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGA  74

Query   75  ATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAAGGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAAGGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAG  148

Query  149  AAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAATCATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAATCATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCAT  222

Query  223  CTTTATTTTATATTTGAATATATGAAAGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTTATTTTATATTTGAATATATGAAAGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGA  296

Query  297  ATCAGTCATCAGAAATATTATGTATCAAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCAGTCATCAGAAATATTATGTATCAAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATA  370

Query  371  GGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTTTGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTTTGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGA  444

Query  445  GAATTAAGGTCACAGCCACCATACACTGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATTAAGGTCACAGCCACCATACACTGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAG  518

Query  519  ATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTGATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTGATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGC  592

Query  593  CACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTCGATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTCGATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGT  666

Query  667  GACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGCATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGCATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAA  740

Query  741  AACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATGAAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATGAAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAAC  814

Query  815  GACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAACACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAACACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCAT  888

Query  889  CTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAAGCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAAGCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCC  962

Query  963  TAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATCAGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATCAGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGC  1036

Query 1037  CCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGCGTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGCGTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACG  1110

Query 1111  CTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACATGCCAACT-------AAGCCAAATGGCACACTGAGTCATAAAAGTGGTA  1177
            |||||||||||||||||||||||||||||||||       .|||||    |.||.|                  
Sbjct 1111  CTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACATGCCAACTGCTTCCAGAGCCA----GTACCC------------------  1162

Query 1178  GGAGGCGTTGGGGTCAGACTATCTTCAAGTCTGGAGATAGCTGGGAAGAGTTGGAGGACTATGATTTCGGAGCC  1251
                         ||||.||                                                    ||
Sbjct 1163  -------------TCAGGCT----------------------------------------------------CC  1171

Query 1252  TCCCATTCCAAGAAGCCAAGCATGGGTGTTTTTAAAGAAAA-AAGGAAAAAAGATT--CTCCATTTCGTCAACA  1322
            ..|||.||.|          ||.||           ||||| |||      ||.||  ||              
Sbjct 1172  AACCACTCGA----------CAGGG-----------GAAAACAAG------AGCTTACCT--------------  1204

Query 1323  GGTGAAGATGGCTGTTATTTCCCT---CTCAGCACACCAGTTTCCCACGTTA  1371
                      |||||||.||||||   .||                      
Sbjct 1205  ----------GCTGTTACTTCCCTAAAATC----------------------  1224