Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14751
- Subject:
- XM_006724661.2
- Aligned Length:
- 3670
- Identities:
- 3438
- Gaps:
- 224
Alignment
Query 1 ATGAGGAGCCGGAGTAACTCCGGGGTCCGGCTGGACGGCTACGCTCGACTGGTGCAACAGACCATCCTGTGCCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGAGCCGGAGTAACTCCGGGGTCCGGCTGGACGGCTACGCTCGACTGGTGCAACAGACCATCCTGTGCCA 74
Query 75 TCAGAATCCAGTGACTGGCTTGCTTCCAGCCAGCTATGATCAGAAAGATGCTTGGGTCCGAGATAATGTGTACA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGAATCCAGTGACTGGCTTGCTTCCAGCCAGCTATGATCAGAAAGATGCTTGGGTCCGAGATAATGTGTACA 148
Query 149 GCATCTTGGCTGTGTGGGGTTTGGGCCTGGCCTATCGGAAGAATGCAGACCGGGATGAGGATAAGGCAAAGGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCATCTTGGCTGTGTGGGGTTTGGGCCTGGCCTATCGGAAGAATGCAGACCGGGATGAGGATAAGGCAAAGGCC 222
Query 223 TATGAATTGGAGCAGAGTGTAGTGAAGCTGATGAGAGGACTACTGCACTGCATGATCAGACAGGTGGATAAAGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TATGAATTGGAGCAGAGTGTAGTGAAGCTGATGAGAGGACTACTGCACTGCATGATCAGACAGGTGGATAAAGT 296
Query 297 AGAATCCTTCAAATATAGTCAGAGTACTAAGGATAGCCTCCATGCAAAGTACAACACCAAAACCTGTGCCACTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAATCCTTCAAATATAGTCAGAGTACTAAGGATAGCCTCCATGCAAAGTACAACACCAAAACCTGTGCCACTG 370
Query 371 TAGTGGGTGATGATCAATGGGGACACCTGCAGTTGGATGCTACCTCTGTGTACCTGCTCTTCTTAGCCCAAATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAGTGGGTGATGATCAATGGGGACACCTGCAGTTGGATGCTACCTCTGTGTACCTGCTCTTCTTAGCCCAAATG 444
Query 445 ACTGCCTCAGGACTCCATATCATCCACAGCCTAGATGAAGTCAATTTCATACAGAACCTTGTGTTTTACATTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTGCCTCAGGACTCCATATCATCCACAGCCTAGATGAAGTCAATTTCATACAGAACCTTGTGTTTTACATTGA 518
Query 519 AGCTGCATATAAAACTGCTGACTTCGGGATATGGGAACGTGGAGACAAGACCAACCAAGGGATCTCAGAGTTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCTGCATATAAAACTGCTGACTTCGGGATATGGGAACGTGGAGACAAGACCAACCAAGGGATCTCAGAGTTGA 592
Query 593 ATGCCAGTTCAGTTGGAATGGCAAAGGCAGCCCTGGAAGCATTAGATGAACTGGATCTGTTTGGTGTGAAAGGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGCCAGTTCAGTTGGAATGGCAAAGGCAGCCCTGGAAGCATTAGATGAACTGGATCTGTTTGGTGTGAAAGGT 666
Query 667 GGGCCTCAATCAGTTATCCATGTCCTGGCTGATGAAGTACAGCACTGCCAGTCTATCCTAAATTCACTACTGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGGCCTCAATCAGTTATCCATGTCCTGGCTGATGAAGTACAGCACTGCCAGTCTATCCTAAATTCACTACTGCC 740
Query 741 CCGTGCTTC-ACATC-AAAGAG--TGATGCTAGTCTACTCTCAGTGGTTTCCTTCCCTGCC-TTGCAGTAGAGG 809
||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 741 CCGTGCTTCAACATCAAAAGAGGTTGATGCTAGTCTACTCTCAGTGGTTTCCTTCCCTGCCTTTGCAGTAGAGG 814
Query 810 GTAGCCAGTTGGTGGAGCTCACAAAACAGGAAATCATCACCAAGCTTCAGGGTCGTTATGGTTGCTGTCGCTTT 883
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATAGCCAGTTGGTGGAGCTCACAAAACAGGAAATCATCACCAAGCTTCAGGGTCGTTATGGTTGCTGTCGCTTT 888
Query 884 CTACGAGATGGATATAAAACTCCTAAAGAGGATCCCAATCGTCTGTACTATGAACCAGCTGAGCTGAAGCTATT 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTACGAGATGGATATAAAACTCCTAAAGAGGATCCCAATCGTCTGTACTATGAACCAGCTGAGCTGAAGCTATT 962
Query 958 TGAAAACATTGAGTGTGAATGGCCATTGTTCTGGACATACTTTATTCTTGATGGGGTCTTCAGTGGCAATGCAG 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAAAACATTGAGTGTGAATGGCCATTGTTCTGGACATACTTTATTCTTGATGGGGTCTTCAGTGGCAATGCAG 1036
Query 1032 AACAGGTTCAAGAATATAAAGAGGCTCTTGAAGCAGTCCTCATCAAGGGCAAAAATGGAGTCCCACTTCTGCCA 1105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AACAGGTTCAAGAATATAAAGAGGCTCTTGAAGCAGTCCTCATCAAGGGCAAAAATGGAGTCCCACTTCTGCCA 1110
Query 1106 GAGCTGTACAGTGTTCCTCCTGACAGGGTCGATGAAGAATATCAGAATCCTCACACTGTGGACCGAGTCCCCAT 1179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGCTGTACAGTGTTCCTCCTGACAGGGTCGATGAAGAATATCAGAATCCTCACACTGTGGACCGAGTCCCCAT 1184
Query 1180 GGGGAAATTGCCTCACATGTGGGGTCAGTCTCTATACATTTTAGGAAGCTTGATGGCAGAGGGATTTTTAGCCC 1253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGGGAAATTGCCTCACATGTGGGGTCAGTCTCTATACATTTTAGGAAGCTTGATGGCAGAGGGATTTTTAGCCC 1258
Query 1254 CTGGAGAAATTGATCCCCTGAATCGCAGGTTTTCTACTGTACCGAAGCCCGATGTTGTGGTTCAAGTCTCCATT 1327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGGAGAAATTGATCCCCTGAATCGCAGGTTTTCTACTGTACCGAAGCCCGATGTTGTGGTTCAAGTCTCCATT 1332
Query 1328 CTAGCTGAAACAGAAGAAATCAAGACCATTTTGAAGGACAAGGGAATTTACGTGGAGACCATTGCTGAGGTATA 1401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTAGCTGAAACAGAAGAAATCAAGACCATTTTGAAGGACAAGGGAATTTACGTGGAGACCATTGCTGAGGTATA 1406
Query 1402 CCCCATCAGAGTACAACCAGCTCGTATTCTCAGCCACATTTATTCCAGCCTAGGATGCAACAATAGAATGAAAC 1475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCCCATCAGAGTACAACCAGCTCGTATTCTCAGCCACATTTATTCCAGCCTAGGATGCAACAATAGAATGAAAC 1480
Query 1476 TCAGTGGACGACCCTACAGACACATGGGAGTGCTTGGAACTTCAAAACTCTATGACATTCGGAAAACTATCTTT 1549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCAGTGGACGACCCTACAGACACATGGGAGTGCTTGGAACTTCAAAACTCTATGACATTCGGAAAACTATCTTT 1554
Query 1550 ACTTTCACTCCACAGTTTATAGACCAGCAACAGTTCTACCTGGCTCTGGACAACAAGATGATAGTGGAAATGCT 1623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACTTTCACTCCACAGTTTATAGACCAGCAACAGTTCTACCTGGCTCTGGACAACAAGATGATAGTGGAAATGCT 1628
Query 1624 TAGAACAGACCTCTCCTACCTCTGTAGCCGCTGGCGGATGACAGGCCAGCCCACCATCACCTTCCCCATCTCAT 1697
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1629 TAGAACAGACCTCTCCTACCTCTGTAGCCGCTGGCGGATGACAGGCCAGCCCACCATCACCTTCCCCATCTCAC 1702
Query 1698 ACAGCATGCTTGATGAAGATGGAACAAGCTTGAATTCAAGTATCCTGGCAGCACTCCGAAAAATGCAAGATGGG 1771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACAGCATGCTTGATGAAGATGGAACAAGCTTGAATTCAAGTATCCTGGCAGCACTCCGAAAAATGCAAGATGGG 1776
Query 1772 TATTTTGGTGGGGCAAGGGTTCAAACAGGTAAATTGTCAGAGTTTTTGACAACATCTTGTTGCACACACTTGAG 1845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TATTTTGGTGGGGCAAGGGTTCAAACAGGTAAATTGTCAGAGTTTTTGACAACATCTTGTTGCACACACTTGAG 1850
Query 1846 CTTCATGGACCCTGGACCTGAGGGTAAGCTGTACAGTGAAGATTATGATGACAACTATGATTACCTGGAATCTG 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTTCATGGACCCTGGACCTGAGGGTAAGCTGTACAGTGAAGATTATGATGACAACTATGATTACCTGGAATCTG 1924
Query 1920 GCAACTGGATGAATGATTATGATTCAACCAGTCATGCTCGCTGTGGTGATGAAGTTGCTCGTTATTTAGATCAC 1993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GCAACTGGATGAATGATTATGATTCAACCAGTCATG-------------------------------------- 1960
Query 1994 CTTTTGGCGCACACTGCTCCCCATCCTAAACTAGCCCCTACCTCACAGAAGGGAGGGCTAGATCGGTTCCAAGC 2067
Sbjct 1961 -------------------------------------------------------------------------- 1960
Query 2068 TGCTGTGCAAACAACCTGCGACTTAATGTCCTTGGTGACCAAGGCCAAGGAACTGCATGTACAGAATGTTCACA 2141
|||||||||
Sbjct 1961 -----------------------------------------------------------------ATGTTCACA 1969
Query 2142 TGTATCTTCCTACGAAGTTATTTCAGGCTTCCCGGCCTTCATTCAACTTACTTGATTCACCTCATCCCCGACAG 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 TGTATCTTCCTACGAAGTTATTTCAGGCTTCCCGGCCTTCATTCAACTTACTTGATTCACCTCATCCCCGACAG 2043
Query 2216 GAGAACCAGGTTCCCTCTGTTCGTGTAGAAATACATCTTCCTAGAGACCAGTCTGGGGAGGTGGACTTTAAAGC 2289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2044 GAGAACCAGGTTCCCTCTGTTCGTGTAGAAATACATCTTCCTAGAGACCAGTCTGGGGAGGTGGACTTTAAAGC 2117
Query 2290 ACTGGTTTTACAGTTGAAGGAGACCTCAAGCTTACAGGAACAAGCTGATATCCTCTATATGCTGTATACTATGA 2363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2118 ACTGGTTTTACAGTTGAAGGAGACCTCAAGCTTACAGGAACAAGCTGATATCCTCTATATGCTGTATACTATGA 2191
Query 2364 AAGGACCTGACTGGAACACTGAATTGTATAATGAACGGAGTGCTACAGTGAGAGAGCTTCTTACCGAGCTGTAT 2437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2192 AAGGACCTGACTGGAACACTGAATTGTATAATGAACGGAGTGCTACAGTGAGAGAGCTTCTTACCGAGCTGTAT 2265
Query 2438 GGCAAAGTGGGAGAAATTCGTCACTGGGGCCTGATCCGATACATTTCTGGGATCTTAAGGAAGAAAGTGGAAGC 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2266 GGCAAAGTGGGAGAAATTCGTCACTGGGGCCTGATCCGATACATTTCTGGGATCTTAAGGAAGAAAGTGGAAGC 2339
Query 2512 ACTTGATGAGGCCTGCACAGACCTTCTCTCCCACCAGAAACATTTGACAGTAGGACTTCCTCCAGAACCTCGAG 2585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 ACTTGATGAGGCCTGCACAGACCTTCTCTCCCACCAGAAACATTTGACAGTAGGACTTCCTCCAGAACCTCGAG 2413
Query 2586 AAAAGACTATCTCTGCACCTCTGCCCTATGAGGCGCTCACTCAGCTGATAGATGAAGCCAGTGAAGGGGATATG 2659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414 AAAAGACTATCTCTGCACCTCTGCCCTATGAGGCGCTCACTCAGCTGATAGATGAAGCCAGTGAAGGGGATATG 2487
Query 2660 AGCATTTCAATCCTTACACAGGAAATAATGGTATATCTAGCCATGTATATGCGAACCCAGCCTGGCCTCTTTGC 2733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2488 AGCATTTCAATCCTTACACAGGAAATAATGGTATATCTAGCCATGTATATGCGAACCCAGCCTGGCCTCTTTGC 2561
Query 2734 TGAAATGTTTCGACTTCGAATTGGTCTGATCATACAAGTTATGGCAACAGAACTGGCCCACTCCCTTCGATGCT 2807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562 TGAAATGTTTCGACTTCGAATTGGTCTGATCATACAAGTTATGGCAACAGAACTGGCCCACTCCCTTCGATGCT 2635
Query 2808 CAGCTGAGGAAGCCACAGAGGGCCTGATGAATCTCAGTCCTTCGCCCATGAAGGATCTCCTGCATCACATTCTC 2881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 CAGCTGAGGAAGCCACAGAGGGCCTGATGAATCTCAGTCCTTCGGCCATGAAGAATCTCCTGCATCACATTCTC 2709
Query 2882 AGCCGCAAGGAG-TTGGAGTGGGAACGAAGCGTTCGTCCCACTGATCAAAATGTCAGTCCTGCTATTTCTATCC 2954
|||.|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2710 AGCGGCAAGGAGTTTGGAGT-GGAACGAAGCGTTCGTCCCACTGATTCAAATGTCAGTCCTGCTATTTCTATCC 2782
Query 2955 ACGAGATTGGTGCTG-TGGAGCAACCAAAACAGAACGAACTGGGATCATGCAGTTAAAAAGTGAGATAAAG--- 3024
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2783 ACGAGATTGGTGCTGTTGGAGCAACCAAAACAGAACGAACTGGGATCATGCAGTTAAAAAGTGAGATAAAGCAG 2856
Query 3025 ------------------------------------CAGTCACCTGGAACCTCTATGACTCCAAGTAGTGGGTC 3062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2857 GTGGAATTTCGTAGACTGTCAATCTCAGCTGAGAGTCAGTCACCTGGAACCTCTATGACTCCAAGTAGTGGGTC 2930
Query 3063 CTTTCCTAGTGCATATGATCAGCAGTCATCTAAAGATAGTCGTCAAGGTCAATGGCAACGCCGAAGAAGGCTGG 3136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2931 CTTTCCTAGTGCATATGATCAGCAGTCATCTAAAGATAGTCGTCAAGGTCAATGGCAACGCCGAAGAAGGCTGG 3004
Query 3137 ATGGGGCACTGAATAGAGTTCCAGTTGGATTTTATCAGAAAGTATGGAAAGTTTTGCAGAAGTGTCACGGACTT 3210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3005 ATGGGGCACTGAATAGAGTTCCAGTTGGATTTTATCAGAAAGTATGGAAAGTTTTGCAGAAGTGTCACGGACTT 3078
Query 3211 TCTGTTGAAGGGTTTGTCCTTCCTTCCTCTACCACTAGAGAGATGACTCCAGGTGAGATTAAATTCTCTGTTCA 3284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3079 TCTGTTGAAGGGTTTGTCCTTCCTTCCTCTACCACTAGAGAGATGACTCCAGGTGAGATTAAATTCTCTGTTCA 3152
Query 3285 TGTGGAGTCTGTCCTGAATCGTGTACCTCAGCCAGAGTACCGTCAGCTGCTGGTTGAAGCCATCCTTGTCCTCA 3358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3153 TGTGGAGTCTGTCCTGAATCGTGTACCTCAGCCAGAGTACCGTCAGCTGCTGGTTGAAGCCATCCTTGTCCTCA 3226
Query 3359 CCATGCTGGCAGATATTGAAATTCATAGCATCGGAAGCATCATTGCTGTGGAAAAAATAGTGCATATTGCCAAT 3432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3227 CCATGCTGGCAGATATTGAAATTCATAGCATCGGAAGCATCATTGCTGTGGAAAAAATAGTGCATATTGCCAAT 3300
Query 3433 GACTTGTTCCTTCAAGAACAGAAAACCCTTGGCGCAGATGATACCATGTTGGCAAAGGATCCCGCATCTGGCAT 3506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3301 GACTTGTTCCTTCAAGAACAGAAAACCCTTGGCGCAGATGATACCATGTTGGCAAAGGATCCCGCATCTGGCAT 3374
Query 3507 CTGTACTCTTCTGTATGACAGTGCACCCAGTGGCAGGTTTGGCACCATGACCTACCTCTCCAAGGCAGCCGCCA 3580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3375 CTGTACTCTTCTGTATGACAGTGCACCCAGTGGCAGGTTTGGCACCATGACCTACCTCTCCAAGGCAGCCGCCA 3448
Query 3581 CCTACGTGCAGGAGTTCCTGCCTCACAGCATCTGTGCCATGCAA 3624
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3449 CCTACGTGCAGGAGTTCCTGCCCCACAGCATCTGTGCCATGCAA 3492