Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14751
- Subject:
- XM_017318427.1
- Aligned Length:
- 3635
- Identities:
- 2202
- Gaps:
- 1228
Alignment
Query 1 ATGAGGAGCCGGAGTAACTCCGGGGTCCGGCTGGACGGCTACGCTCGACTGGTGCAACAGACCATCCTGTGCCA 74
|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGAGCCGCAGTAACTCGGGAGTCCGCCTGGACGGCTATGCTCGGCTGGTGCATCAGACCATCCTGTGCCA 74
Query 75 TCAGAATCCAGTGACTGGCTTGCTTCCAGCCAGCTATGATCAGAAAGATGCTTGGGTCCGAGATAATGTGTACA 148
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGAATCCAGTGACAGGCTTGCTTCCAGCCAGCTATGATCAAAAAGATGCCTGGGTCCGAGATAATGTGTACA 148
Query 149 GCATCTTGGCTGTGTGGGGTTTGGGCCTGGCCTATCGGAAGAATGCAGACCGGGATGAGGATAAGGCAAAGGCC 222
|.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 GTATCCTGGCTGTGTGGGGTTTGGGCCTGGCATATCGCAAAAATGCTGACCGTGATGAGGACAAGGCAAAGGCC 222
Query 223 TATGAATTGGAGCAGAGTGTAGTGAAGCTGATGAGAGGACTACTGCACTGCATGATCAGACAGGTGGATAAAGT 296
||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TATGAACTGGAGCAGAGTGTAGTGAAGTTAATGAGGGGACTGCTGCACTGCATGATCAGACAGGTGGATAAAGT 296
Query 297 AGAATCCTTCAAATATAGTCAGAGTACTAAGGATAGCCTCCATGCAAAGTACAACACCAAAACCTGTGCCACTG 370
|||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 AGAGTCCTTCAAGTACAGTCAGAGTACTAAAGATAGCCTCCATGCCAAGTACAACACCAAAACTTGTGCCACTG 370
Query 371 TAGTGGGTGATGATCAATGGGGACACCTGCAGTTGGATGCTACCTCTGTGTACCTGCTCTTCTTAGCCCAAATG 444
|.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct 371 TGGTGGGTGATGACCAGTGGGGACACCTGCAGTTGGATGCTACTTCTGTGTACCTGCTCTTCCTAGCACAAATG 444
Query 445 ACTGCCTCAGGACTCCATATCATCCACAGCCTAGATGAAGTCAATTTCATACAGAACCTTGTGTTTTACATTGA 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445 ACTGCCTCAGGACTCCATATCATCCACAGCCTAGACGAAGTCAATTTTATACAGAACCTCGTGTTTTACATTGA 518
Query 519 AGCTGCATATAAAACTGCTGACTTCGGGATATGGGAACGTGGAGACAAGACCAACCAAGGGATCTCAGAGTTGA 592
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 519 AGCTGCATATAAAACTGCTGACTTTGGGATATGGGAACGTGGCGATAAGACAAACCAAGGCATCTCGGAATTGA 592
Query 593 ATGCCAGTTCAGTTGGAATGGCAAAGGCAGCCCTGGAAGCATTAGATGAACTGGATCTGTTTGGTGTGAAAGGT 666
||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||.|.||..|||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGCGAGTTCAGTTGGAATGGCCAAGGCAGCCCTGGAAGCACTAGATGAATTAGACTTGTTTGGTGTGAAAGGT 666
Query 667 GGGCCTCAATCAGTTATCCATGTCCTGGCTGATGAAGTACAGCACTGCCAGTCTATCCTAAATTCACTACTGCC 740
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 667 GGGCCACAATCAGTTATCCATGTCCTGGCTGATGAAGTCCAACACTGCCAGTCTATCCTGAATTCACTACTGCC 740
Query 741 CCGTGCTTC-ACAT-CAAAGA--GTGATGCTAGTCTACTCTCAGTGGTTTCCTTCCCTGCC-TTGCAGTAGAGG 809
|.|.||||| |||| |||||| .||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||| ||||.|||||||
Sbjct 741 CAGGGCTTCAACATCCAAAGAAGTTGATGCCAGTCTGCTCTCAGTGGTCTCTTTCCCAGCCTTTGCTGTAGAGG 814
Query 810 GTAGCCAGTTGGTGGAGCTCACAAAACAGGAAATCATCACCAAGCTTCAGGGTCGTTATGGTTGCTGTCGCTTT 883
..|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 ACAGCCATTTGGTGGAGCTCACCAAACAGGAGATCATCACCAAGCTTCAGGGTCGTTATGGTTGCTGTCGTTTT 888
Query 884 CTACGAGATGGATATAAAACTCCTAAAGAGGATCCCAATCGTCTGTACTATGAACCAGCTGAGCTGAAGCTATT 957
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGCGAGATGGATATAAAACTCCTAAAGAGGATCCCAATCGCCTATACTATGAACCAGCTGAGCTGAAGCTATT 962
Query 958 TGAAAACATTGAGTGTGAATGGCCATTGTTCTGGACATACTTTATTCTTGATGGGGTCTTCAGTGGCAATGCAG 1031
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|.||
Sbjct 963 TGAAAACATTGAGTGCGAATGGCCATTGTTCTGGACATACTTTATCCTTGATGGGATCTTCAGTGGCAACGTAG 1036
Query 1032 AACAGGTTCAAGAATATAAAGAGGCTCTTGAAGCAGTCCTCATCAAGGGCAAAAATGGAGTCCCACTTCTGCCA 1105
||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1037 AACAGGTTCAAGAATATAGAGAGGCTCTTGATGCAGTCCTCATCAAGGGCAAAAATGGAGTCCCTCTTCTTCCA 1110
Query 1106 GAGCTGTACAGTGTTCCTCCTGACAGGGTCGATGAAGAATATCAGAATCCTCACACTGTGGACCGAGTCCCCAT 1179
||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1111 GAGCTGTACAGTGTCCCTCCTGACAGGGTTGATGAAGAGTATCAAAATCCCCACACTGTGGATCGAGTCCCTAT 1184
Query 1180 GGGGAAATTGCCTCACATGTGGGGTCAGTCTCTATACATTTTAGGAAGCTTGATGGCAGAGGGATTTTTAGCCC 1253
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 GGGAAAATTGCCTCACATGTGGGGTCAGTCTCTATACATTTTAGGAAGCTTGATGGCAGAGGGATTTTTAGCTC 1258
Query 1254 CTGGAGAAATTGATCCCCTGAATCGCAGGTTTTCTACTGTACCGAAGCCCGATGTTGTGGTTCAAGTCTCCATT 1327
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGGAGAAATTGATCCCCTGAATCGTAGGTTTTCTACTGTGCCAAAGCCAGATGTGGTGGTTCAAGTCTCCATT 1332
Query 1328 CTAGCTGAAACAGAAGAAATCAAGACCATTTTGAAGGACAAGGGAATTTACGTGGAGACCATTGCTGAGGTATA 1401
||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1333 CTGGCTGAAACAGAAGAAATCAAGGCCATTTTGAAGGACAAAGGAATTGATGTGGAGACCATTGCTGAAGTGTA 1406
Query 1402 CCCCATCAGAGTACAACCAGCTCGTATTCTCAGCCACATTTATTCCAGCCTAGGATGCAACAATAGAATGAAAC 1475
||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1407 CCCCATAAGAGTACAGCCAGCTCGTATTCTCAGCCATATTTATTCTAGTCTAGGATGCAACAGTAGAATGAAAC 1480
Query 1476 TCAGTGGACGACCCTACAGACACATGGGAGTGCTTGGAACTTCAAAACTCTATGACATTCGGAAAACTATCTTT 1549
|||||||||||||||||||.|.||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481 TCAGTGGACGACCCTACAGGCTCATGGGTGTGCTTGGAACATCAAAACTTTATGACATTCGCAAAACTATCTTT 1554
Query 1550 ACTTTCACTCCACAGTTTATAGACCAGCAACAGTTCTACCTGGCTCTGGACAACAAGATGATAGTGGAAATGCT 1623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct 1555 ACTTTCACTCCACAGTTTATAGACCAGCAACAGTTCTACCTGGCTCTGGACAACCAGATGATAGTAGAAATGCT 1628
Query 1624 TAGAACAGACCTCTCCTACCTCTGTAGCCGCTGGCGGATGACAGGCCAGCCCACCATCACCTTCCCCATCTCAT 1697
.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||..
Sbjct 1629 CAGAACAGACCTTTCCTACCTCTGTAGCCGCTGGAGGATGACAGGCCAGCCCACGATCACTTTCCCTATCTCGC 1702
Query 1698 ACAGCATGCTTGATGAAGATGGAACAAGCTTGAATTCAAGTATCCTGGCAGCACTCCGAAAAATGCAAGATGGG 1771
|||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1703 ACACCATGCTTGATGAAGATGGAACCAGCTTGAATTCAAGTATCTTGGCAGCACTCCGAAAAATGCAGGATGGC 1776
Query 1772 TATTTTGGTGGGGCAAGGGTTCAAACAGGTAAATTGTCAGAGTTTTTGACAACATCTTGTTGCACACACTTGAG 1845
||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1777 TATTTTGGTGGGGCCAGGATCCAAACAGGTAAATTGTCAGAGTTTTTGACAACATCTTGCTGCACACACTTAAG 1850
Query 1846 CTTCATGGACCCTGGACCTGAGGGTAAGCTGTACAGTGAAGATTATGATGACAACTAT---GATTACCTGGAAT 1916
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||| |||.|..||||.|
Sbjct 1851 CTTCATGGACCCTGGACCTGAGGGTAAGCTGTACAGTGAAGATTATGATGAAGACTATGAAGATGATTTGGACT 1924
Query 1917 CTGGCAACTGGATGAATGATTATGATTCAACCAGTCATGCTCGCTGTGGTGATGAAGTTGCTCGTTATTTAGAT 1990
||||||||||||||.|....|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1925 CTGGCAACTGGATGGACAGCTATGATTCAACAAGTAATGCTCGCTGTGGTGATGAAGTTGCCCGTTATTTAGAC 1998
Query 1991 CACCTTTTGGCGCACACTGCTCCCCATCCTAAACTAGCCCCTACCTCACAGAAGGGAGGGCTAGATCGGTTCCA 2064
|.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1999 CGCCTTTTGGCACACACTGTTCCCCATCCTAAACTAGCTCCTACCTCACGGAAGGGAGGGCTAGATCGGTTCCG 2072
Query 2065 AGCTGCTGTGCAAACAACCTGCGACTTAATGTCCTTGGTGACCAAGGCCAAGGAACTGCATGTACAGAATGTTC 2138
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 2073 AGCTGCTGTGCAAACAACTTGCGACTTAATGTCCTTGGTGGCCAAGGCCAAGGAGCTGCATATACAGAATGTTC 2146
Query 2139 ACATGTATCTTCCTACGAAGTTATTTCAGGCTTCCCGGCCTTCATTCAACTTACTTGATTCACCTCA-TCCCCG 2211
||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||||||.|||||||||||||.||.|||.| ||.||
Sbjct 2147 ACATGTATCTTCCTACAAAGTTATTTCAGCCTTCTCGTCCTTCACTCAACTTACTTGACTCCCCTGAGTCTCC- 2219
Query 2212 ACAGGAGAACCAGGTTCCCTCTGTTCGTGTAGAAATACATCTTCCTAGAGACCAGTCTGGGGAGGTGGACTTTA 2285
|||.||.|.|||||||||.||.||||.|||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..
Sbjct 2220 ACAAGATAGCCAGGTTCCTTCCGTTCATGTAGAAGTGCATCTTCCTAGGGACCAGTCTGGGGAAGTGGACTTCC 2293
Query 2286 AAGCACTGGTTTTACAGTTGAAGGAGACCTCAAGCTTACAGGAACAAGCTGATATCCTCTATATGCTGTATACT 2359
|..||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.
Sbjct 2294 AGTCATTGGTTTCACAGTTGAAGGAGACCTCAAGCTTACAGGAGCAAGCTGATATACTCTACATGCTGTATTCA 2367
Query 2360 ATGAAAGGACCTG--ACTGGAACACTGAATTGTATAATGAACGGAGTGCTACAGTGAGAGAGCTTCTTACCGAG 2431
|||||.| || ||.||| ||..|..|.||| |.|||..|.|.||||.| ||
Sbjct 2368 ATGAAGG----TGATACAGGA------AAAAGCCTCATG--------------GGGAGCCACCCTCTTTC--AG 2415
Query 2432 CTGTATGGCAAAGTGGGAGAAATTCGTCACTGGGGCCTGATCCGATACATTTCTGGGATCTTAAGGAAGAAAGT 2505
|.|
Sbjct 2416 CAG----------------------------------------------------------------------- 2418
Query 2506 GGAAGCACTTGATGAGGCCTGCACAGACCTTCTCTCCCACCAGAAACATTTGACAGTAGGACTTCCTCCAGAAC 2579
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 2580 CTCGAGAAAAGACTATCTCTGCACCTCTGCCCTATGAGGCGCTCACTCAGCTGATAGATGAAGCCAGTGAAGGG 2653
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 2654 GATATGAGCATTTCAATCCTTACACAGGAAATAATGGTATATCTAGCCATGTATATGCGAACCCAGCCTGGCCT 2727
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 2728 CTTTGCTGAAATGTTTCGACTTCGAATTGGTCTGATCATACAAGTTATGGCAACAGAACTGGCCCACTCCCTTC 2801
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 2802 GATGCTCAGCTGAGGAAGCCACAGAGGGCCTGATGAATCTCAGTCCTTCGCCCATGAAGGATCTCCTGCATCAC 2875
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 2876 ATTCTCAGCCGCAAGGAGTTGGAGTGGGAACGAAGCGTTCGTCCCACTGATCAAAATGTCAGTCCTGCTATTTC 2949
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 2950 TATCCACGAGATTGGTGCTGTGGAGCAACCAAAACAGAACGAACTGGGATCATGCAGTTAAAAAGTGAGATAAA 3023
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 3024 GCAGTCACCTGGAACCTCTATGACTCCAAGTAGTGGGTCCTTTCCTAGTGCATATGATCAGCAGTCATCTAAAG 3097
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 3098 ATAGTCGTCAAGGTCAATGGCAACGCCGAAGAAGGCTGGATGGGGCACTGAATAGAGTTCCAGTTGGATTTTAT 3171
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 3172 CAGAAAGTATGGAAAGTTTTGCAGAAGTGTCACGGACTTTCTGTTGAAGGGTTTGTCCTTCCTTCCTCTACCAC 3245
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 3246 TAGAGAGATGACTCCAGGTGAGATTAAATTCTCTGTTCATGTGGAGTCTGTCCTGAATCGTGTACCTCAGCCAG 3319
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 3320 AGTACCGTCAGCTGCTGGTTGAAGCCATCCTTGTCCTCACCATGCTGGCAGATATTGAAATTCATAGCATCGGA 3393
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 3394 AGCATCATTGCTGTGGAAAAAATAGTGCATATTGCCAATGACTTGTTCCTTCAAGAACAGAAAACCCTTGGCGC 3467
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 3468 AGATGATACCATGTTGGCAAAGGATCCCGCATCTGGCATCTGTACTCTTCTGTATGACAGTGCACCCAGTGGCA 3541
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 3542 GGTTTGGCACCATGACCTACCTCTCCAAGGCAGCCGCCACCTACGTGCAGGAGTTCCTGCCTCACAGCATCTGT 3615
Sbjct 2419 -------------------------------------------------------------------------- 2418
Query 3616 GCCATGCAA 3624
Sbjct 2419 --------- 2418
