Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14807
• Subject: NM_008927.3
• Aligned Length: 1181
• Identities: 1069
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGCCCAAGAAGAAGCCGACGCCCATCCAGCTGAACCCGGCCCCCGACGGCTCTGCAGTTAACGGGACCAGCTC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCAAGAAGAAGCCGACGCCCATCCAGCTGAACCCGGCCCCCGATGGCTCGGCGGTTAACGGGACCAGCTC  74

Query   75  TGCGGAGACCAACTTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTAGAGCTTGATGAGCAGCAGCGAAAGCGCC  148
            .||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct   75  GGCCGAGACCAACCTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAGCTTGACGAGCAGCAGCGGAAGCGGC  148

Query  149  TTGAGGCCTTTCTTACCCAGAAGCAGAAGGTGGGAGAACTGAAGGATGACGACTTTGAGAAGATCAGTGAGCTG  222
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  TCGAGGCCTTTCTGACGCAGAAGCAGAAGGTGGGGGAACTGAAGGATGATGACTTTGAGAAGATCAGCGAACTG  222

Query  223  GGGGCTGGCAATGGCGGTGTGGTGTTCAAGGTCTCCCACAAGCCTTCTGGCCTGGTCATGGCCAGAAAGCTAAT  296
            ||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  223  GGAGCTGGCAACGGTGGAGTGGTCTTCAAGGTCTCCCACAAGCCATCTGGCCTGGTTATGGCTAGAAAGCTGAT  296

Query  297  TCATCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATAAGGGAGCTGCAGGTTCTGCATGAGTGCAACTCTC  370
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  297  CCACCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTACTGCACGAGTGCAACTCCC  370

Query  371  CGTACATCGTGGGCTTCTATGGTGCGTTCTACAGCGATGGCGAGGATCAGTATCTGCATGGAGCACATGGATGG  444
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||| ||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGA-GATCAGCATCTGCATGGAGCACATGGATGG  443

Query  445  AGGTTCTCTGGATCAAGTCCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAACAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTGCTG  518
            .||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  TGGGTCCTTGGATCAAGTTCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAGCAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTGCTG  517

Query  519  TAATAAAAGGCCTGACATATCTGAGGGAGAAGCACAAGATCATGCACAGAGATGTCAAGCCCTCCAACATCCTA  592
            |.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  518  TGATAAAAGGCCTGACCTATCTTCGGGAGAAGCACAAGATTATGCACAGAGATGTCAAGCCATCCAACATTCTA  591

Query  593  GTCAACTCCCGTGGGGGAGATCAAGCTCTGTGACTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTCATCGACTCCATGGCCAACT  666
            ||.|||||.||| |||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  592  GTGAACTCACGT-GGGGAGATCAAACTCTGTGATTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTAATTGACTCTATGGCCAACT  664

Query  667  CCTTCGTGGGCACAAGGTCCTACATGTCGCCAGAAAGACTCCAGGGGACTCATTACTCTGTGCAGTCAGACATC  740
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  665  CCTTCGTGGGCACGAGATCCTACATGTCGCCTGAGAGACTCCAGGGGACTCACTACTCTGTGCAGTCGGACATC  738

Query  741  TGGAGCATGGGACTGTCTCTGGTAGAGATGGCGGTTGGGAGGTATCCCATCCCTCCTCCAGATGCCAAGGAGCT  814
            |||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  739  TGGAGCATGGGGCTCTCTCTGGTGGAGATGGCAGTTGGGAGATACCCCATTCCTCCTCCTGATGCCAAGGAGCT  812

Query  815  GGAGCTGATGTTTGGGTGCCAGGTGGAAGGAGATGCGGCTGAGACCCCACCCAGGCCAAGGACCCCCGGGAGGC  888
            ||||||..|||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  813  GGAGCTACTGTTTGGATGCCATGTGGAAGGAGACGCAGCCGAAACACCACCCAGGCCAAGGACCCCTGGGAGGC  886

Query  889  CCCTTAGCTCATACGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATAGTCAACGAG  962
            |.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  887  CTCTCAGCTCATATGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATTGTCAATGAG  960

Query  963  CCTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTGTTCAGTCTGGAATTTCAAGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  961  CCTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTATTCAGTCTGGAGTTTCAGGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAAGAA  1034

Query 1037  CCCCGCAGAGAGAGCAGATTTGAAGCAACTCATGGTTCATGCTTTTATCAAGAGATCTGATGCTGAGGAAGTGG  1110
            |||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1035  CCCTGCAGAGAGAGCAGATCTGAAGCAGCTCATGGTACATGCTTTCATCAAAAGATCTGACGCCGAGGAGGTAG  1108

Query 1111  ATTTTGCAGGTTGGCTCTGCTCCACCATCGGCCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCATGCTGCTGGCGTC  1181
            |.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.||
Sbjct 1109  ACTTCGCAGGCTGGCTCTGCTCCACCATTGGGCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCACGCTGCCAGCATC  1179