Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14910
- Subject:
- NM_001317061.3
- Aligned Length:
- 2013
- Identities:
- 1518
- Gaps:
- 492
Alignment
Query 1 ATGCAACCAGACATGTCCTTGAATGTCATTAAGATGAAATCCAGTGACTTCCTGGAGAGTGCAGAACTGGACAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGGAGGCTTCGGGAAGGTGTCTCTGTGTTTCCACAGAACCCAGGGACTCATGATCATGAAAACAGTGTACAAGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGCCCAACTGCATTGAGCACAACGAGGCCCTCTTGGAGGAGGCGAAGATGATGAACAGACTGAGACACAGCCGG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTGGTGAAGCTCCTGGGCGTCATCATAGAGGAAGGGAAGTACTCCCTGGTGATGGAGTACATGGAGAAGGGCAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCTGATGCACGTGCTGAAAGCCGAGATGAGTACTCCGCTTTCTGTAAAAGGAAGGATAATTTTGGAAATCATTG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AAGGAATGTGCTACTTACATGGAAAAGGCGTGATACACAAGGACCTGAAGCCTGAAAATATCCTTGTTGATAAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GACTTCCACATTAAGATCGCAGACCTCGGCCTTGCCTCCTTTAAGATGTGGAGCAAACTGAATAATGAAGAGCA 518
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------ATGTGGAGCAAACTGAATAATGAAGAGCA 29
Query 519 CAATGAGCTGAGGGAAGTGGACGGCACCGCTAAGAAGAATGGCGGCACCCTCTACTACATGGCGCCCGAGCACC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 CAATGAGCTGAGGGAAGTGGACGGCACCGCTAAGAAGAATGGCGGCACCCTCTACTACATGGCGCCCGAGCACC 103
Query 593 TGAATGACGTCAACGCAAAGCCCACAGAGAAGTCGGATGTGTACAGCTTTGCTGTAGTACTCTGGGCGATATTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104 TGAATGACGTCAACGCAAAGCCCACAGAGAAGTCGGATGTGTACAGCTTTGCTGTAGTACTCTGGGCGATATTT 177
Query 667 GCAAATAAGGAGCCATATGAAAATGCTATCTGTGAGCAGCAGTTGATAATGTGCATAAAATCTGGGAACAGGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 GCAAATAAGGAGCCATATGAAAATGCTATCTGTGAGCAGCAGTTGATAATGTGCATAAAATCTGGGAACAGGCC 251
Query 741 AGATGT-GATGACATCACTGAGTACTGCCC-AGAGAAATTATCAGTCTCATGAAGCTCTGCTGGGAAGCGAATC 812
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 AGATGTGGATGACATCACTGAGTACTGCCCAAGAGAAATTATCAGTCTCATGAAGCTCTGCTGGGAAGCGAATC 325
Query 813 CGGAAGCTCGGCCGACATTTCCTGGCATTGAAGAAAAATTTAGGCCTTTTTATTTAAGTCAATTAGAAGAAAGT 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326 CGGAAGCTCGGCCGACATTTCCTGGCATTGAAGAAAAATTTAGGCCTTTTTATTTAAGTCAATTAGAAGAAAGT 399
Query 887 GTAGAAGAGGACGTGAAGAGTTTAAAGAAAGAGTATTCAAACGAAAATGCAGTTGTGAAGAGAATGCAGTCTCT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 GTAGAAGAGGACGTGAAGAGTTTAAAGAAAGAGTATTCAAACGAAAATGCAGTTGTGAAGAGAATGCAGTCTCT 473
Query 961 TCAACTTGATTGTGTGGCAGTACCTTCAAGCCGGTCAAATTCAGCCACAGAACAGCCTGGTTCACTGCACAGTT 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 TCAACTTGATTGTGTGGCAGTACCTTCAAGCCGGTCAAATTCAGCCACAGAACAGCCTGGTTCACTGCACAGTT 547
Query 1035 CCCAGGGACTTGGGATGGGTCCTGTGGAGGAGTCCTGGTTTGCTCCTTCCCTGGAGCACCCACAAGAAGAGAAT 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 CCCAGGGACTTGGGATGGGTCCTGTGGAGGAGTCCTGGTTTGCTCCTTCCCTGGAGCACCCACAAGAAGAGAAT 621
Query 1109 GAGCCCAGCCTGCAGAGTAAACTCCAAGACGAAGCCAACTACCATCTTTATGGCAGCCGCATGGACAGGCAGAC 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 GAGCCCAGCCTGCAGAGTAAACTCCAAGACGAAGCCAACTACCATCTTTATGGCAGCCGCATGGACAGGCAGAC 695
Query 1183 GAAACAGCAGCCCAGACAGAAT-TGGGCTACAACAGAGAGGAGGAAAGGAGACGCAGGGTCTCCCATGACCTTT 1255
|||||||||||||||||||||| |||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 696 GAAACAGCAGCCCAGACAGAATGTGGCTTACAACAGAGAGGAGGAAAGGAGACGCAGGGTCTCCCATGACCCTT 769
Query 1256 TTGCACAGCAAAGACCTTACGAGAATTTTCAGAATACAGAGGGAAAAGGCACTGCTTATTCCAGTGCAGCCAGT 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 TTGCACAGCAAAGACCTTACGAGAATTTTCAGAATACAGAGGGAAAAGGCACTGCTTATTCCAGTGCAGCCAGT 843
Query 1330 CATGGTAATGCAGTGCACCAGCCCTCAGGGCTCACCAGCCAACCTCAAGTACTGTATCAGAACAATGGATTATA 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 CATGGTAATGCAGTGCACCAGCCCTCAGGGCTCACCAGCCAACCTCAAGTACTGTATCAGAACAATGGATTATA 917
Query 1404 TAGCTCACATGGCTTTGGAACAAGACCACTGGATCCAGGAACAGCAGGTCCCAGAGTTTGGTACAGGCCAATTC 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 918 TAGCTCACATGGCTTTGGAACAAGACCACTGGATCCAGGAACAGCAGGTCCCAGAGTTTGGTACAGGCCAATTC 991
Query 1478 CAAGTCATATGCCTAGTCTGCATAATATCCCAGTGCCTGAGACCAACTATCTAGGAAATACACCCACCATGCCA 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 CAAGTCATATGCCTAGTCTGCATAATATCCCAGTGCCTGAGACCAACTATCTAGGAAATACACCCACCATGCCA 1065
Query 1552 TTCAGCTCCTTGCCACCAACAGATGAATCTATAAAATATACCATATACAATAGTACTGGCATTCAGATTGGAGC 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 TTCAGCTCCTTGCCACCAACAGATGAATCTATAAAATATACCATATACAATAGTACTGGCATTCAGATTGGAGC 1139
Query 1626 CTACAATTATATGGAGATTGGTGGGACGAGTTCATCACTACTAGACAGCACAAATACGAACTTCAAAGAAGAGC 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 CTACAATTATATGGAGATTGGTGGGACGAGTTCATCACTACTAGACAGCACAAATACGAACTTCAAAGAAGAGC 1213
Query 1700 CAGCTGCTAAGTACCAAGCTATCTTTGATAATACCACTAGTCTGACGGATAAACACCTGGACCCAATCAGGGAA 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 CAGCTGCTAAGTACCAAGCTATCTTTGATAATACCACTAGTCTGACGGATAAACACCTGGACCCAATCAGGGAA 1287
Query 1774 AATCTGGGAAAGCACTGGAAAAACTGTGCCCGTAAACTGGGCTTCACACAGTCTCAGATTGATGAAATTGACCA 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 AATCTGGGAAAGCACTGGAAAAACTGTGCCCGTAAACTGGGCTTCACACAGTCTCAGATTGATGAAATTGACCA 1361
Query 1848 TGACTATGAGCGAGATGGACTGAAAGAAAAGGTTTACCAGATGCTCCAAAAGTGGGTGATGAGGGAAGGCATAA 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 TGACTATGAGCGAGATGGACTGAAAGAAAAGGTTTACCAGATGCTCCAAAAGTGGGTGATGAGGGAAGGCATAA 1435
Query 1922 AGGGAGCCACGGTGGGGAAGCTGGCCCAGGCGCTCCACCAGTGTTCCAGGATCGACCTTCTGAGCAGCTTGATT 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 AGGGAGCCACGGTGGGGAAGCTGGCCCAGGCGCTCCACCAGTGTTCCAGGATCGACCTTCTGAGCAGCTTGATT 1509
Query 1996 TACGTCAGCCAGAAC 2010
|||||||||||||||
Sbjct 1510 TACGTCAGCCAGAAC 1524