Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14983
• Subject: XM_024451332.1
• Aligned Length: 2205
• Identities: 1467
• Gaps: 516

Alignment

Query    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74
            |||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||..|
Sbjct    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCATGCAGGCAGGGCC  74

Query   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT  147
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT  147

Query  148  CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC-GGAAGAGACAGAACC  220
            ||||||..|||||||.|..|||||||||..||||||||.||||||..|||| |.|||| ||.|.|||.|.||||
Sbjct  148  CAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTGGGACAGAAATAACC  220

Query  221  CACTGGAGCCTGGAGC-----CAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACA-------GTGCAGGG  282
            |||||||.||     |     ||||||||..|||..|||.||||||       ||||||       .|||||||
Sbjct  221  CACTGGAACC-----CAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACACAGCACCATGCAGGG  282

Query  283  CGATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGG  356
            .|||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..||||||
Sbjct  283  AGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGG  356

Query  357  ATTCTATGCA--GAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCA  428
            ||||||  ||  .|||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||.
Sbjct  357  ATTCTA--CAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCG  428

Query  429  GTGTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACCC  496
            .||||...|||.|.|.|||  |.||||  .||||||| ||.|| ||||   ||||||..||||||||.||||||
Sbjct  429  ATGTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCC  499

Query  497  TGTACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGG  570
            ||.||||||||.||||||.||..|||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||..||||
Sbjct  500  TGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAGG  573

Query  571  TGGAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTC-AGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGA  643
            ||||||||||.|||||||||||||||.| .|||.||||.| .|||||||||..||||||||||||.||||||||
Sbjct  574  TGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATA-CAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGA  646

Query  644  TTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGC--A  715
            |||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||..|  |||  |
Sbjct  647  TTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTG--GGCAGA  718

Query  716  GCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTC  789
            ||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.||
Sbjct  719  GCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTC  792

Query  790  GTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTC  863
            .|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  CTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTC  866

Query  864  CCACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTG  936
            |.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| |||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  867  CTACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTG  939

Query  937  GCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTC  1007
            |.||||||||||.||||||.||||..|||||   |||   ||||.||.|..|||||||||||||..||||||||
Sbjct  940  GACATCCTGATCACAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTC  1010

Query 1008  AGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATA----GACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGG  1077
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||    .|.||    |||||||||.||.|||||||.||.|||
Sbjct 1011  AGGAGAGAACATGACCCTGCTGTGTCAGTCACGG----GGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGG  1080

Query 1078  GCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTC  1150
            ||||||||||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1081  GCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC  1153

Query 1151  CTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGC  1224
            ||||||||||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||...|
Sbjct 1154  CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC  1227

Query 1225  CCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC  1297
            ||.|||.|.||||.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.|||
Sbjct 1228  CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCC  1299

Query 1298  -CCACACCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCT  1370
             |||||||                                                ||||||||||||..||||
Sbjct 1300  TCCACACC------------------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCT  1325

Query 1371  GGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATC  1444
            ||.||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct 1326  GGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTC  1399

Query 1445  GGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCA  1506
            .||.|||.|||||||||||||||||.|.||            |||||.|.|||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1400  AGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACA  1473

Query 1507  GAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAA-------------  1567
            ||||||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||             
Sbjct 1474  GAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTGTAAGAG  1547

Query 1568  --------------------------------------------------------------------------  1567
                                                                                      
Sbjct 1548  GAAGAGAGGGGACAAATGGGGGTGCTGGAGAGACAGGAGTCCCAAAATTTCAGTAGCAACAGGGAGGGGCTGGG  1621

Query 1568  --------------------------------------------------------------------------  1567
                                                                                      
Sbjct 1622  AAGGGTCTGGGGCTCCGTGGAAGATGGTCTTGCCCCACACTGTGGGACCTCCCTGCATTCGGTGGCCCCATCTG  1695

Query 1568  --------------------------------TTCTCA------------------------------------  1573
                                            .|||||                                    
Sbjct 1696  GGAGCAGGGCAGGGGGCCAGCAGGACTGAGAGGTCTCAGAGAACCAGGAGACGAACCCCTTGCTCTGCCCCAGC  1769

Query 1574  --ATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGG---------------------------------  1612
              |||||||.|||||||||||||||.|..|||||.||||||                                 
Sbjct 1770  AGATGCTGCTGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACC  1843

Query 1613  --------------------------------------------------------------------------  1612
                                                                                      
Sbjct 1844  CCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTG  1917

Query 1613  -------------------------------------------------AGATGGATGCTCGGGCTGCTGCATC  1637
                                                             |||||||..||..||||||||||||
Sbjct 1918  TCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATC  1991

Query 1638  TGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTC  1711
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1992  TGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTC  2065

Query 1712  CATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC  1770
            |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 2066  CATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  2124