Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15039
• Subject: XM_017011974.1
• Aligned Length: 865
• Identities: 591
• Gaps: 272

Alignment

Query   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148
                                                                         ||||||||||||
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------ATGGAGGTGCCA  12

Query 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAG-------------------------------------  185
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  13  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGATTCCTCTGACAGTATCCTCCAAGACCTGACATGGAC  86

Query 186  ---------------------CTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCTATTAGGCCTGAAGTCA  238
                                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  87  AATGTGTGAAAAAGCGCTCAACTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCTATTAGGCCTGAAGTCA  160

Query 239  GAGAATACTATGCTACT---------------------------------------------------------  255
           |||||||||||||||||                                                         
Sbjct 161  GAGAATACTATGCTACTAAGGTGTTAATTTTCTCAATATTGGGCACATCTTTCAAAGAAGAGAAGGAACCTTTC  234

Query 256  ---------------------AAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACCACACTGACTTTACTAA  308
                                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235  TCAGGAAGGAGGGAAGAGAAAAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACCACACTGACTTTACTAA  308

Query 309  GTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATCGTGACACTGGGAGGCC  382
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 309  GTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATCGTGACACTGGGAGGCC  382

Query 383  TTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCACATCACTCCTTTTCCA  456
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383  TTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCACATCACTCCTTTTCCA  456

Query 457  ATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGTTGCATGTAGACACTGG  530
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 457  ATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGTTGCATGTAGACACTGG  530

Query 531  AATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACAACCACAGGCCTCAAGT  604
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531  AATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTATGCAGGTTACAACCACAGGCCTCAAGT  604

Query 605  GGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTACGACGGGTCTGGTGTT  678
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 605  GGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTACGACGGGTCTGGTGTT  678

Query 679  GTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC  729
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679  GTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC  729