Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15196
• Subject: NM_032415.6
• Aligned Length: 3468
• Identities: 3421
• Gaps: 37

Alignment

Query    1  ---------------------ATGGATGACTACATGGAGACGCTGAAGGATGAAGAGGACGCCTTGTGGGAGAA  53
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCAGGAGGAGGGCCAGAGATGGATGACTACATGGAGACGCTGAAGGATGAAGAGGACGCCTTGTGGGAGAA  74

Query   54  TGTGGAGTGTAACCGGCACATGCTCAGCCGCTATATCAACCCTGCCAAGCTCACGCCCTACCTGCGTCAGTGTA  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGGAGTGTAACCGGCACATGCTCAGCCGCTATATCAACCCTGCCAAGCTCACGCCCTACCTGCGTCAGTGTA  148

Query  128  AGGTCATTGATGAGCAGGATGAAGATGAAGTGCTTAATGCCCCTATGCTGCCATCCAAGATCAACCGAGCAGGC  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTCATTGATGAGCAGGATGAAGATGAAGTGCTTAATGCCCCTATGCTGCCATCCAAGATCAACCGAGCAGGC  222

Query  202  CGGCTGTTGGACATTCTACATACCAAGGGGCAAAGGGGCTATGTGGTCTTCTTGGAGAGCCTAGAATTTTATTA  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGCTGTTGGACATTCTACATACCAAGGGGCAAAGGGGCTATGTGGTCTTCTTGGAGAGCCTAGAATTTTATTA  296

Query  276  CCCAGAACTGTACAACTTGGTGACTGGGAAAGAGCCCACTCGGAGATTCTCCACCATTGTGGTGGAGGAAGGCC  349
            |||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCAGAACTGTACAAACTGGTGACTGGGAAAGAGCCCACTCGGAGATTCTCCACCATTGTGGTGGAGGAAGGCC  370

Query  350  ACGAGGGCCTCACGCACTTCCTGATGAACGAGGTCATCAAGCTGCAGCAGCAGATGAAGGCCAAGGACCTGCAA  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGAGGGCCTCACGCACTTCCTGATGAACGAGGTCATCAAGCTGCAGCAGCAGATGAAGGCCAAGGACCTGCAA  444

Query  424  CGCTGCGAGCTGCTGGCCAGGTTGCGGCAGCTGGAGGATGAGAAGAAGCAGATGACGCTGACGCGCGTGGAGCT  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCTGCGAGCTGCTGGCCAGGTTGCGGCAGCTGGAGGATGAGAAGAAGCAGATGACGCTGACGCGCGTGGAGCT  518

Query  498  GCTAACCTTCCAGGAGCGGTACTACAAGATGAAGGAAGAGCGGGACAGCTACAATGACGAGCTGGTCAAGGTGA  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTAACCTTCCAGGAGCGGTACTACAAGATGAAGGAAGAGCGGGACAGCTACAATGACGAGCTGGTCAAGGTGA  592

Query  572  AGGACGACAACTACAACTTAGCCATGCGCTACGCACAGCTCAGTGAGGAGAAGAACATGGCGGTCATGAGGAGC  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGACGACAACTACAACTTAGCCATGCGCTACGCACAGCTCAGTGAGGAGAAGAACATGGCGGTCATGAGGAGC  666

Query  646  CGAGACCTCCAACTCGAGATCGATCAGCTAAAGCACCGGTTGAATAAGATGGAGGAGGAATGTAAGCTGGAGAG  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGAGACCTCCAACTCGAGATCGATCAGCTAAAGCACCGGTTGAATAAGATGGAGGAGGAATGTAAGCTGGAGAG  740

Query  720  AAATCAGTCTCTAAAACTGAAGAATGACATTG-AAATCGGCCCAAG-ATGAGCAG--TCTGGAACTGGAGCGGG  789
            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |.||||||  |||||||||||||| ||
Sbjct  741  AAATCAGTCTCTAAAACTGAAGAATGACATTGAAAATCGGCCCAAGAAGGAGCAGGTTCTGGAACTGGAGC-GG  813

Query  790  GAGAATGAAATGCTGAAGACCAAAAACCAGGAGCTGCAGTCCATCATCCAGGCCGGGAAGCGCAGCCTGCCAGA  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GAGAATGAAATGCTGAAGACCAAAAACCAGGAGCTGCAGTCCATCATCCAGGCCGGGAAGCGCAGCCTGCCAGA  887

Query  864  CTCAGACAAGGCCATCCTGGACATCTTGGAACACGACCGCAAGGAGGCCCTGGAGGACAGGCAGGAGCTGGTCA  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CTCAGACAAGGCCATCCTGGACATCTTGGAACACGACCGCAAGGAGGCCCTGGAGGACAGGCAGGAGCTGGTCA  961

Query  938  ACAGGATCTACAACCTGCAGGAGGAGGCCCGCCAGGCAGAGGAGCTGCGAGACAAGTACCTGGAGGAGAAGGAG  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  ACAGGATCTACAACCTGCAGGAGGAGGCCCGCCAGGCAGAGGAGCTGCGAGACAAGTACCTGGAGGAGAAGGAG  1035

Query 1012  GACCTGGAGCTCAAGTGCTCGACCCTGGGAAAGGACTGTGAAATGTACAAGCACCGCATGAACACGGTCATGCT  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GACCTGGAGCTCAAGTGCTCGACCCTGGGAAAGGACTGTGAAATGTACAAGCACCGCATGAACACGGTCATGCT  1109

Query 1086  GCAGCTGGAGGAGGTGGAGCGGGAGCGGGACCAGGCCTTCCACTCCCGAGATGAAGCTCAGACACAGTACTCGC  1159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GCAGCTGGAGGAGGTGGAGCGGGAGCGGGACCAGGCCTTCCACTCCCGAGATGAAGCTCAGACACAGTACTCGC  1183

Query 1160  AGTGCTTAATCGAAAAGGACAAGTACAGGAAGCAGATCCGCGAGCTGGAGGAGAAGAACGACGAGATGAGGATC  1233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  AGTGCTTAATCGAAAAGGACAAGTACAGGAAGCAGATCCGCGAGCTGGAGGAGAAGAACGACGAGATGAGGATC  1257

Query 1234  GAGATGGTGCGGCGGGAGGCCTGCATCGTCAACCTGGAGAGCAAGCTGCGGCGCCTCTCCAAGGACAGCAACAA  1307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  GAGATGGTGCGGCGGGAGGCCTGCATCGTCAACCTGGAGAGCAAGCTGCGGCGCCTCTCCAAGGACAGCAACAA  1331

Query 1308  CCTGGACCAGAGTCTGCCCAGGAACCTGCCAGTAACCATCATCTCTCAGGACTTTGGGGATGCCAGCCCCAGGA  1381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  CCTGGACCAGAGTCTGCCCAGGAACCTGCCAGTAACCATCATCTCTCAGGACTTTGGGGATGCCAGCCCCAGGA  1405

Query 1382  CCAATGGTCAAGAAGCTGACGATTCTTCCACCTCGGAGGAGTCACCTGAAGACAGCAAGTACTTCCTGCCCTAC  1455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  CCAATGGTCAAGAAGCTGACGATTCTTCCACCTCGGAGGAGTCACCTGAAGACAGCAAGTACTTCCTGCCCTAC  1479

Query 1456  CATCCGCCCCAGCGCAGGATGAACCTGAAGGGCATCCAGCTGCAGAGAGCCAAATCCCCCATCAGCCTGAAGCG  1529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  CATCCGCCCCAGCGCAGGATGAACCTGAAGGGCATCCAGCTGCAGAGAGCCAAATCCCCCATCAGCCTGAAGCG  1553

Query 1530  AACATCAGATTTTCAAGCCAAGGGGCACGAGGAAGAAGGCACGGACGCCAGCCCTAGCTCCTGCGGATCTCTGC  1603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  AACATCAGATTTTCAAGCCAAGGGGCACGAGGAAGAAGGCACGGACGCCAGCCCTAGCTCCTGCGGATCTCTGC  1627

Query 1604  CCATCACCAACTCCTTCACCAAGATGCAGCCCCCCCGGAGCCGCAGCAGCATCATGTCAATCACCGCCGAGCCC  1677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  CCATCACCAACTCCTTCACCAAGATGCAGCCCCCCCGGAGCCGCAGCAGCATCATGTCAATCACCGCCGAGCCC  1701

Query 1678  CCGGGAAACGACTCCATCGTCAGACGCTACAAGGAGGACGCGCCCCATCGCAGCACAGTCGAAGAAGACAATGA  1751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  CCGGGAAACGACTCCATCGTCAGACGCTACAAGGAGGACGCGCCCCATCGCAGCACAGTCGAAGAAGACAATGA  1775

Query 1752  CAGCGGCGGGTTTGACGCCTTAGATCTGGATGATGACAGTCACGAACGCTACTCCTTCGGACCCTCCTCCATCC  1825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  CAGCGGCGGGTTTGACGCCTTAGATCTGGATGATGACAGTCACGAACGCTACTCCTTCGGACCCTCCTCCATCC  1849

Query 1826  ACTCCTCCTCCTCCTCCCACCAATCCGAGGGCCTGGATGCCTACGACCTGGAGCAGGTCAACCTCATGTTCAGG  1899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  ACTCCTCCTCCTCCTCCCACCAATCCGAGGGCCTGGATGCCTACGACCTGGAGCAGGTCAACCTCATGTTCAGG  1923

Query 1900  AAGTTCTCTCTGGAAAGACCCTTCCGGCCTTCGGTCACCTCTGTGGGGCACGTGCGGGGCCCAGGGCCCTCGGT  1973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  AAGTTCTCTCTGGAAAGACCCTTCCGGCCTTCGGTCACCTCTGTGGGGCACGTGCGGGGCCCAGGGCCCTCGGT  1997

Query 1974  GCAGCACACGACGCTGAATGGCGACAGCCTCACCTCCCAGCTCACCCTGCTGGGGGGCAACGCGCGAGGGAGCT  2047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998  GCAGCACACGACGCTGAATGGCGACAGCCTCACCTCCCAGCTCACCCTGCTGGGGGGCAACGCGCGAGGGAGCT  2071

Query 2048  TCGTGCACTCGGTCAAGCCTGGCTCTCTGGCCGAGAAAGCCGGCCTCCGTGAGGGCCACCAGCTGCTGCTGCTA  2121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072  TCGTGCACTCGGTCAAGCCTGGCTCTCTGGCCGAGAAAGCCGGCCTCCGTGAGGGCCACCAGCTGCTGCTGCTA  2145

Query 2122  GAAGGCTGCATCCGAGGCGAGAGGCAGAGTGTCCCGTTGGACACATGCACCAAAGAGGAAGCCCACTGGACCAT  2195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146  GAAGGCTGCATCCGAGGCGAGAGGCAGAGTGTCCCGTTGGACACATGCACCAAAGAGGAAGCCCACTGGACCAT  2219

Query 2196  CCAGAGGTGCAGCGGCCCCGTCACGCTGCACTACAAGGTCAACCACGAAGGGTACCGGAAGCTGGTGAAGGACA  2269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220  CCAGAGGTGCAGCGGCCCCGTCACGCTGCACTACAAGGTCAACCACGAAGGGTACCGGAAGCTGGTGAAGGACA  2293

Query 2270  TGGAGGACGGCCTGATCACATCGGGGGACTCGTTCTACATCCGGCTGAACCTGAACATCTCCAGCCAGCTGGAC  2343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294  TGGAGGACGGCCTGATCACATCGGGGGACTCGTTCTACATCCGGCTGAACCTGAACATCTCCAGCCAGCTGGAC  2367

Query 2344  GCCTGCACCATGTCCCTGAAGTGTGACGATGTTGTGCACGTCCGTGACACCATGTACCAGGACAGGCACGAGTG  2417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368  GCCTGCACCATGTCCCTGAAGTGTGACGATGTTGTGCACGTCCGTGACACCATGTACCAGGACAGGCACGAGTG  2441

Query 2418  GCTGTGCGCGCGGGTCGACCCTTTCACAGACCATGACCTGGATATGGGCACCATACCCAGCTACAGCCGAGCCC  2491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442  GCTGTGCGCGCGGGTCGACCCTTTCACAGACCATGACCTGGATATGGGCACCATACCCAGCTACAGCCGAGCCC  2515

Query 2492  AGCAGCTCCTCCTGGTGAAACTGCAGCGCCTGATGCACCGAGGCAGCCGGGAGGAGGTAGACGGCACCCACCAC  2565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516  AGCAGCTCCTCCTGGTGAAACTGCAGCGCCTGATGCACCGAGGCAGCCGGGAGGAGGTAGACGGCACCCACCAC  2589

Query 2566  ACCCTGCGGGCACTCCGGAACACCCTGCAGCCGGAAGAAGCGCTTTCAACAAGCGACCCCCGGGTCAG-CCCCG  2638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2590  ACCCTGCGGGCACTCCGGAACACCCTGCAGCCAGAAGAAGCGCTTTCAACAAGCGACCCCCGGGTCAGCCCCCG  2663

Query 2639  TTTCTCGGGAGCAAGC-TCCTTTTTGCCCAGCTCCTTCAGTTCGTCAGCAG--TCGAGAAAACAAGTATAAGCG  2709
            |.|||||.|||||||| |||||||||.||||||||||||||||||||||||  .||||  ||||||||||||||
Sbjct 2664  TCTCTCGCGAGCAAGCTTCCTTTTTGGCCAGCTCCTTCAGTTCGTCAGCAGGTCCGAG--AACAAGTATAAGCG  2735

Query 2710  GATGAACAGCAACGAGCGGGTCCGCATCATCTCGGGGAGT-CGCTANGGGAGCCTGGCCCGGGTCCTCGCT-GA  2781
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 2736  GATGAACAGCAACGAGCGGGTCCGCATCATCTCGGGGAGTCCGCTA-GGGAGCCTGGCCC-GGTCCTCGCTGGA  2807

Query 2782  CGCCCACCAAGCTCTGNACTGAGAAGCAGGAAGAGCTGGACCCTGAGAGCGAGCTGGGCAAGAACCTCAGCCTC  2855
            || ||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808  CG-CCACCAAGCTCTTGACTGAGAAGCAGGAAGAGCTGGACCCTGAGAGCGAGCTGGGCAAGAACCTCAGCCTC  2880

Query 2856  ATCCCCTACAGCCTGGTACGCGCCTTCTACTGCGAGCGCCGCCGGCCCGTGCTCTTCACACCCACCGTGCTGGC  2929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2881  ATCCCCTACAGCCTGGTACGCGCCTTCTACTGCGAGCGCCGCCGGCCCGTGCTCTTCACACCCACCGTGCTGGC  2954

Query 2930  CAAGACGCTGGTGCAGAGGCTGCTCAACTCGGGAGGTGCCATGGAGTTCACCATCTGCAAGTCAGATATCGTCA  3003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2955  CAAGACGCTGGTGCAGAGGCTGCTCAACTCGGGAGGTGCCATGGAGTTCACCATCTGCAAGTCAGATATCGTCA  3028

Query 3004  CAAGAGATGAGTTCCTCAGAAGGCAGAAGACGGAGACCATCATCTACTCCCGAGAGAAGAACCCCAACGCGTTC  3077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3029  CAAGAGATGAGTTCCTCAGAAGGCAGAAGACGGAGACCATCATCTACTCCCGAGAGAAGAACCCCAACGCGTTC  3102

Query 3078  GAATGCATCGCCCCTGCCAACATTGAAGCTGTGGCCGCCAAGAACAAGCACTGCCTGCTGGAGGCTGGGATCGG  3151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3103  GAATGCATCGCCCCTGCCAACATTGAAGCTGTGGCCGCCAAGAACAAGCACTGCCTGCTGGAGGCTGGGATCGG  3176

Query 3152  CTGCACAAGAGACTTGATCAAGTCCAACATCTACCCCATCGTGCTCTTCATCCGGGTGTGTGAGAAGAACATCA  3225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3177  CTGCACAAGAGACTTGATCAAGTCCAACATCTACCCCATCGTGCTCTTCATCCGGGTGTGTGAGAAGAACATCA  3250

Query 3226  AGAGGTTCAGAAAGCTGCTGCCCCGACCTGAGACGGAGGAGGAGTTCCTGCGCGTGTGCCGGCTGAAGGAGAAG  3299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3251  AGAGGTTCAGAAAGCTGCTGCCCCGACCTGAGACGGAGGAGGAGTTCCTGCGCGTGTGCCGGCTGAAGGAGAAG  3324

Query 3300  GAGCTGGAGGCCCTGCCGTGCCTGTACGCCACGGTGGAACCTGACATGTGGGGCAGCGTAGAGGAGCTGCTCCG  3373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3325  GAGCTGGAGGCCCTGCCGTGCCTGTACGCCACGGTGGAACCTGACATGTGGGGCAGCGTAGAGGAGCTGCTCCG  3398

Query 3374  CGTTGTCAAGGACAAGATCGGCGAGGAGCAGCGCAAGACCATCTGGGTGGACGAGGACCAGCTG  3437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3399  CGTTGTCAAGGACAAGATCGGCGAGGAGCAGCGCAAGACCATCTGGGTGGACGAGGACCAGCTG  3462