Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15247
- Subject:
- XR_002956408.1
- Aligned Length:
- 2495
- Identities:
- 1897
- Gaps:
- 588
Alignment
Query 1 ----------------ATGGCGACCTCCGAGAGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCT 58
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AACCCCGCTAAACAAGATGGCGACCTCCGAGAGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCT 74
Query 59 TGGGCAGATCCCGAACTGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTT 132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGGCAGATCCCGAACTGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTT 148
Query 133 CCCATGGGGCAGAAGACGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTA 206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCATGGGGCAGAAGACGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTA 222
Query 207 TCAGGAGCTGGACTCGGACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCG 280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCAGGAGCTGGACTCGGACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCG 296
Query 281 AAATGCTGAATTTGGAGGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTG 354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAATGCTGAATTTGGAGGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTG 370
Query 355 GGGCGCTCAGGCTCTGGGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAG 428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGCGCTCAGGCTCTGGGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAG 444
Query 429 CATTCTCTGTGGATATGTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGA 502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CATTCTCTGTGGATATGTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGA 518
Query 503 GTTGTATGCCTTATCTCCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCC 576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTGTATGCCTTATCTCCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCC 592
Query 577 AAAAACCTCAAGAAAGCGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCT 650
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAAACCTCAAGAAGGCGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCT 666
Query 651 CACTAAACTAATTTTGGATGGCAATGAGATAGAAG-AATCAGTGGACTAGAGATGTGCA--CACCTAATTCACC 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| .||||||||||||
Sbjct 667 CACTAAACTAATTTTGGATGGCAATGAGATAGAAGAAATCAGTGGACTAGAGATGTGCAACAACCTAATTCACC 740
Query 722 TTAGTTTGGCC-ACAAT-AGATCACGAC-ATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTGTTCTGAG 792
||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 741 TTAGTTTGGCCAACAATAAGATCACGACAATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTG-TCTGAG 813
Query 793 CAATAACCAGATTGAGATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATC 866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CAATAACCAGATTGAGATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATC 887
Query 867 AGATAAGCAGCCTCCAAGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCT 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 AGATAAGCAGCCTCCAAGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCT 961
Query 941 GAGCTGAGAGAAATAGAATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCA 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GAGCTGAGAGAAATAGAATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCA 1035
Query 1015 GGAAAAGTCTGAATATTGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTA 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GGAAAAGTCTGAATATTGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTA 1109
Query 1089 AAGTGGAAGAAAAGGTTTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTG 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 AAGTGGAAGAAAAGGTTTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTG 1183
Query 1163 ACCCATGTTGTCAACAGCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCTCCTTA 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1184 ACCCATGTTGTCAACAGCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCCCCTTA 1257
Query 1237 TCCCATGCTGATACTAGCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTA 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 TCCCATGCTGATACTAGCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTA 1331
Query 1311 GCACTTACTTCAGATATGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTAT 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 GCACTTACTTCAGATATGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTAT 1405
Query 1385 CATTTTATCTCTCAAGACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAA 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 CATTTTATCTCTCAAGACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAA 1479
Query 1459 TCACAAGTATGGATTAAATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGG 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 TCACAAGTATGGATTAAATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGG 1553
Query 1533 AAATAGAAGGTGTAAGAAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAG 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 AAATAGAAGGTGTAAGAAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAG 1627
Query 1607 GAAAAATATGAGGGATATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 GAAAAATATGAGGGATATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGT 1701
Query 1681 GGACCTTTATAATAAAAATTAATCAGAATTTTCCGGGGATATTTGAATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGA 1754
|||||||||| ||.|||||||||||||||||||| |||||||||..||| ||||||||||||
Sbjct 1702 GGACCTTTAT-ATTAAAATTAATCAGAATTTTCC-GGGATATTTTGATG-------------AGATGATCTGGA 1760
Query 1755 TG-TGCCTTACAAAAAACTGAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATGGAATGAGGAACCTGCCAAGAGTTTG 1827
|| |||| |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 TGTTGCC-TACCAAAAACTGAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATTGACTGAGGAACCTGCCAAGAGTTTG 1833
Query 1828 GCTACAACTGCAGATGTAAAGACATCCCACCTGAAACCTGAAGCGCATCCTACAAAGTATATTTCTTCGAATAT 1901
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834 GCTACAACTGCAGATGTTAAGACATCCCACCTGAAACCTGAAGCGCATCCTACAAAGTATATTTCTTCGAATAT 1907
Query 1902 GGGTGATTTCCTGCATTCTACAGACAGAAACTACCTCATTAAATTTTGGGCCAAACTTTCAGCCAAAAAAACAC 1975
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 GGGTGATTTCCTGCATTCTACAG--------------------------------------------------- 1930
Query 1976 CAGCGGAAAGAGATTCTATACACAGACAGCACGAGGCAGCCCGGCAAGCTCTAATGGGAAGGATACGCCCTGAT 2049
Sbjct 1931 -------------------------------------------------------------------------- 1930
Query 2050 CACACACTCCTATTTCAAAGGGGTCCAGTACCAGCACCTCTCACCAGTGGTCTACACTATTATACAACTTTAGA 2123
Sbjct 1931 -------------------------------------------------------------------------- 1930
Query 2124 AGAACTCTGGAAAAGTTTTGATCTTTGTGAAGACTATTTTAAACCTCCATTTGGACCATATCCTGAAAAGAGTG 2197
Sbjct 1931 -------------------------------------------------------------------------- 1930
Query 2198 GGAAGGATTCCTTGGTTTCCATGAAATGTTCATTGTTTCGGTTCTGTCCGTGGTCAAAAGAATTGCCTTTCCAG 2271
Sbjct 1931 -------------------------------------------------------------------------- 1930
Query 2272 CCTCCGGAGGGGAGCATTTCTTCACACCTAGGATCAGGAGCCAGTGACAGTGAGACCGAAGAGACCCGGAAAGC 2345
Sbjct 1931 -------------------------------------------------------------------------- 1930
Query 2346 ACTACCTATACAATCATTTTCACATGAAAAAGAGTCTCACCAACACAGACAACACTCGGTCCCAGTCATCAGTC 2419
Sbjct 1931 -------------------------------------------------------------------------- 1930
Query 2420 GCCCAGGTTCCAACGTCAAACCCACCCTCCCTCCAATCCCTCAGGGCCGCAGG 2472
Sbjct 1931 ----------------------------------------------------- 1930