Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15308
- Subject:
- XM_017003981.2
- Aligned Length:
- 1034
- Identities:
- 936
- Gaps:
- 91
Alignment
Query 1 ATGGAAAAGTATGAAAAATTAGCTAAGACTGGAGAAGGGTCTTATGGGGTTGTATTCAAATGCAGAAACAAAAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAAAGTATGAAAAATTAGCTAAGACTGGAGAAGGGTCTTATGGGGTTGTATTCAAATGCAGAAACAAAAC 74
Query 75 CTCTGGACAAGTAGTAGCTGTTAAAAAATTTGTGGAATCTGAAGATGATCCTGTTGTTAAGAAAATAGCACTAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCTGGACAAGTAGTAGCTGTTAAAAAATTTGTGGAATCTGAAGATGATCCTGTTGTTAAGAAAATAGCACTAA 148
Query 149 GAGAAATACGTATGTTGAAGCAAATTAAAACAATNCCAAATCTTGTGAACCTCATCGAAGGTGTTCAGGAGAAA 222
||||||||||||||||||||| |||||||||| .|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 149 GAGAAATACGTATGTTGAAGC-AATTAAAACA--TCCAAATCTTGTGAACCTCATCG-AGGTGTTCAGGAG-AA 217
Query 223 AAAGGAAAATGCATTTAGTTTTTGAATACTGTGATCATACACTTTTAAATGAGCTGGAAAGAAACCCAAATGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 AAAGGAAAATGCATTTAGTTTTTGAATACTGTGATCATACACTTTTAAATGAGCTGGAAAGAAACCCAAATGGA 291
Query 297 GTTGCTGATGGAGTGATCAAAAGCGTATTATGGCAAACACTTCAAGCTCTTAATTTCTGTCATATACATAACTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 GTTGCTGATGGAGTGATCAAAAGCGTATTATGGCAAACACTTCAAGCTCTTAATTTCTGTCATATACATAACTG 365
Query 371 TATTCACAGAGATATAAAACCTGAAAATATTCTAATAACTAAGCAAGGAATAATCAAGATTTGTGACTTCGGGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 TATTCACAGAGATATAAAACCTGAAAATATTCTAATAACTAAGCAAGGAATAATCAAGATTTGTGACTTCGGGT 439
Query 445 TTGCACAAATTCTGATTCCAGGAGATGCCTACACCGATTATGTAGCTACGAGATGGTACCGAGCTCCTGAACTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 TTGCACAAATTCTGATTCCAGGAGATGCCTACACCGATTATGTAGCTACGAGATGGTACCGAGCTCCTGAACTT 513
Query 519 CTTGTGGGAGATACTCAGTATGGTTCTTCAGTCGATATATGGGCTATTGGTTGTGTTTTTGCAGAGCTCCTGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 CTTGTGGGAGATACTCAGTATGGTTCTTCAGTCGATATATGGGCTATTGGTTGTGTTTTTGCAGAGCTCCTGAC 587
Query 593 AGGCCAGCCACTGTGGCCTGGAAAATCAGATGTGGACCAACTTTATCTGATAATCAGAACACTAGGAAAATTAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 AGGCCAGCCACTGTGGCCTGGAAAATCAGATGTGGACCAACTTTATCTGATAATCAGAACACTAGGAAAATTAA 661
Query 667 TCCCAAGACATCAATCAATCTTTAAAAGTAACGGGTTTTTCCATGGCATCAGTATACCTGAGCCAGAAGACATG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 TCCCAAGACATCAATCAATCTTTAAAAGTAACGGGTTTTTCCATGGCATCAGTATACCTGAGCCAGAAGACATG 735
Query 741 GAAACTCTTGAGGAAAAGTTCTCAGATGTTCATCCTGTGGCTTCTGAACTTCATGAANGGNTGTCTGAAGATGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 736 GAAACTCTTGAGGAAAAGTTCTCAGATGTTCATCCTGTGGC-TCTGAACTTCATGAAGGGGTGTCTGAAGATGA 808
Query 815 ATCCAGATGACAGATTAACCTGTTCCCAACTCCTGGAGAGCTCCTACTTTGATTCTTTTCAAGAGGCCCAAATT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 ATCCAGATGACAGATTAACCTGTTCCCAACTCCTGGAGAGCTCCTACTTTGATTCTTTTCAAGAGGCCCAAATT 882
Query 889 AAAAGAAAAGCACGTAATGAAGGAAGAAACAGAAGACGCCAACAG--------GTACTTCCGCTCAAA--AGT- 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |.||.||||.| ||.
Sbjct 883 AAAAGAAAAGCACGTAATGAAGGAAGAAACAGAAGACGCCAACAGAATCAACTGT--TGCCTCTCATACCAGGA 954
Query 952 ------------------------------------------------------------------------ 951
Sbjct 955 AGCCACATCTCCCCCACACCTGATGGAAGAAAACAAGTCCTCCAGTTAAAATTTGATCACCTTCCAAACATT 1026