Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15379
• Subject: NM_001321984.2
• Aligned Length: 1286
• Identities: 1210
• Gaps: 73

Alignment

Query    1  ATGGCCACTTCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGCTGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACTTCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGCTGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAA  74

Query   75  CCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCTTCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCTTCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATG  148

Query  149  GAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCGAATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCGAATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACAG  222

Query  223  CTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTGTGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTGTGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGCA  296

Query  297  GGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTGGCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTGGCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCC  370

Query  371  CAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTTACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTTACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGTA  444

Query  445  AAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTACCAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTACCAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGG  518

Query  519  CATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACAGGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACAGGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCT  592

Query  593  TGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTTCCTGCCCCAGTTTGAGAAAACTCTGGAACAAACTCCTAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTTCCTGCCCCAGTTTGAGAAAACTCTGGAACAAACTCCTAGG  666

Query  667  GGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCACTTATAAGCTCTATACACATAGTTACCTGGGATTTGGATT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCACTTATAAGCTCTATACACATAGTTACCTGGGATTTGGATT  740

Query  741  GAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTGGAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTGGAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCT  814

Query  815  GTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAAGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAAGGG  888

Query  889  GAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAGTGCTGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAGGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAGTGCTGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAGGT  962

Query  963  CCAGAGAGGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTATTATGACCGAGCTGTTGACACAGACATGATTGATTATGAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGAGAGGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTATTATGACCGAGCTGTTGACACAGACATGATTGATTATGAAA  1036

Query 1037  AGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAGAAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAGAAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCACC  1110

Query 1111  TCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCTACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCTACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGA  1184

Query 1185  CAGCACAGTCTTACA-GCTCACAAAGAAAGTGAACAACATAGAGACGGGCTG-GGCCTTGGGGGCCACCTTTCA  1256
            ||||||||||||||| |||                        |.||..||| ||                   
Sbjct 1185  CAGCACAGTCTTACAGGCT------------------------GCCGTACTGAGG-------------------  1215

Query 1257  CCTGTTGCAGTCTCTGGGCATCTCCCAT  1284
                                        
Sbjct 1216  ----------------------------  1215