Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15687
- Subject:
- NM_133649.2
- Aligned Length:
- 3482
- Identities:
- 2530
- Gaps:
- 685
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCATCCACCAGAAGCCACCACCAAGATGTCCTCAGTTCGGTTCATGGTGACACCAACTAAGATTGATGACAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCAGGTTTGTCAGACACCAGCCCGGACCTCAGCTCTCGGTCTAGTTCTCGAGTAAGATTTAGCTCCCGAGAAA 148
Query 1 -----------------------------ATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCA 45
|||||.||..||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 149 GTGTGCCAGAAACAAGCCGTAGTGAGCCTATGAGCGAACTGTCTGGGGCTACTACTTCTCTGGCAACTGTTGCC 222
Query 46 CTGGATCCACCCAGTGACCGGACTTCTCACCCCCAGGATGTCATCGAGGACCTGAGTCAGAACTCCATCACAGG 119
||.|||||..|||||||||||||||||.|.|||||||||||.|..|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTAGATCCTTCCAGTGACCGGACTTCTAATCCCCAGGATGTTACGGAGGACCCGAGTCAGAACTCCATCACAGG 296
Query 120 GGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGACATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAG 193
|||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 GGAGCACAGCCAGCTGTTAGATGACGGCCATAAAAAAGCCCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAACTATGAAG 370
Query 194 AAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCC 267
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 371 AAGGAGACGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCAAAGGTGTCTTCT 444
Query 268 CTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAATCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCAC 341
||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CTCCTCAACCGCATGGCCAACTATACAAATCTGACACAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAGAACATCAC 518
Query 342 TGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCCCCCAAATGGGTACCTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAAA 415
||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 TGAAGGGAAAAAGAAGCCTACCAAGAGCCCCCAAATGGGTACTTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAGA 592
Query 416 ATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGCCTTACATGGGTGGTGGGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCTTTTGCA 489
|.||.||||||||||||||.||..|.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||||
Sbjct 593 ACATCTTTGGAGTGATCCTCTTCCTGCGTCTTACCTGGGTAGTGGGAACAGCTGGAATCCTTCAGGCCTTTGCA 666
Query 490 ATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGT 563
||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 667 ATTGTCCTCATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTAACTGCCATCTCCATGAGCGCCATCGCCACTAACGGAGTGGT 740
Query 564 GCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTTCCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCT 637
|||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 741 GCCAGCTGGGGGCTCATACTTCATGATTTCCAGAGCCCTGGGCCCAGAGTTTGGCGGGGCTGTAGGCCTCTGCT 814
Query 638 TTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCCATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTC 711
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 815 TTTATCTTGGCACCACATTTGCAGCAGCCATGTATATTCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTATACATTGTC 888
Query 712 CCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGACGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTA 785
|||||||||||||||||||..|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 889 CCCCGAGCTGCCATCTTTCGGAGTGACGATGCACTCAAGGAGTCAGCAGCTATGCTGAACAACATGCGCGTCTA 962
Query 786 CGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTATTAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCAC 859
.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 TGGTACAGCCTTCTTGGTCCTCATGGTCTTGGTGGTATTCATCGGCGTACGCTATGTGAATAAGTTTGCCTCAC 1036
Query 860 TTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATCTTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCA 933
|.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1037 TCTTCCTGGCCTGTGTAATTGTGTCGATCTTGGCTATCTATGCTGGTGCCATCAAGTCTTCCTTTGCTCCACCA 1110
Query 934 CACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCGCACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGA 1007
||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACTTCCCGGTCTGTATGCTGGGCAACCGTACCCTGTCATCAAGACACCTTGACATTTGCTCTAAGACCAAGGA 1184
Query 1008 AATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCT 1081
..||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1185 GGTTGACAACATGACAGTACCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGCAACTCGAGTCAGTTCTTTAATGCCACCT 1258
Query 1082 GTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTCACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACA 1155
|||||||.||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1259 GTGATGAGTACTTTGTTCACAATAACGTCATCTCAATCCAAGGCATTCCAGGGTTGGCTAGTGGTATCATTACT 1332
Query 1156 GAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAAGGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTT 1229
||.|||||||||||||||||..||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1333 GAAAATCTTTGGAGTAATTATTTACCAAAGGGTGAGATAATTGAAAAGCCATCAGCCAAGTCATCTGATGTCTT 1406
Query 1230 AGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTGTTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTC 1303
|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1407 AGGCAACTTAAACCATGAATATGTTCTTGCTGATATCACCACCTCCTTCACTCTGCTGGTGGGGATCTTCTTTC 1480
Query 1304 CCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATT 1377
||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1481 CCTCGGTCACAGGTATCATGGCTGGGTCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCCCAGAAGTCTATTCCCATT 1554
Query 1378 GGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTCCTTTGTTTTAGATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTAT 1451
||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GGGACCATCCTTGCCATCCTGACCACATCCTTTGTGT---ATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTAT 1625
Query 1452 TGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCGGTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGC 1525
||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1626 TGAAGGAGTCGTTCTCAGAGACAAATTTGGGGATGCTGTAAAAGGGAATTTGGTTGTAGGCACCTTATCCTGGC 1699
Query 1526 CATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCA 1599
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1700 CATCCCCGTGGGTGATCGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGGCTGCAGAGCCTCACAGGTGCG 1773
Query 1600 CCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGATAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAA 1673
||..|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1774 CCTCGGCTGCTGCAGGCTATCGCCAAGGATAACATCATACCTTTCCTTAGGGTTTTTGGTCACAGCAAAGCTAA 1847
Query 1674 TGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATC 1747
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1848 TGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATAGCAGAGCTGGGAATTCTCATCGCCTCCCTGGATC 1921
Query 1748 TTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACA 1821
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1922 TCGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTGAACTTGGCTTGTGCCTTGCAAACA 1995
Query 1822 TTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCGATTCCGCTACTACCATTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAATGAGTAT 1895
||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 TTGCTGCGAACCCCCAACTGGAGGCCTCGATTCCGCTATTATCACTGGGCCCTCTCTTTCATGGGAATGAGTAT 2069
Query 1896 CTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCTGGTATTATGCCATTGTAGCCATGGTAATAGCTGGTATGATCTACA 1969
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2070 CTGTCTAGCTCTGATGTTCATTTCTTCTTGGTATTATGCCATTGTAGCTATGGTAATAGCTGGCATGATCTACA 2143
Query 1970 AGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAAGAATGGGGTGATGGTATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCAGCCCGG 2043
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2144 AGTACATTGAATATCAAGGGGCTGAGAAAGAATGGGGGGATGGTATCCGTGGGCTGTCGCTCAGTGCAGCCCGC 2217
Query 2044 TTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACCTCCACACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATTACTGAA 2117
||.||||||||.||..|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||..|||||||
Sbjct 2218 TTCGCTTTGCTCCGTCTAGAGGAAGGACCTCCTCACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGCTGCTCGTCCTACTGAA 2291
Query 2118 ACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAAAAGGTC 2191
.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 2292 GCTGGATGAAGATTTACACGTCAAGCACCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCCCAGCTCAAGGCAGGAAAGGGAC 2365
Query 2192 TCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCCTAGAGAACTACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAGCAGACC 2265
||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||..|.||.||.|||||||||
Sbjct 2366 TCACGATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCTTGGAGAACTATGGTGACGCGCTCGCGGCAGAGCAGACC 2439
Query 2266 ATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGTAAAAGGATTCTGCCAGCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAGGGAGGG 2339
||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||..|||||
Sbjct 2440 ATTAAGCACCTAATGGAGGCAGAAAAGGTAAAAGGATTCTGCCAATTGGTGGTGGCTGCCAAGCTGAAAGAGGG 2513
Query 2340 CATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCCTTGGGGGCATGAAGCACAACACGGTGGTGATGGGCTGGCCTAATG 2413
||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2514 CATTTCACACCTCATCCAGTCCTGTGGCCTCGGAGGCATGAAACACAACACAGTGGTGATGGGCTGGCCCAATG 2587
Query 2414 GCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCTTGGAAGACTTTTATTGGCACAGTTCGAGTGACAACTGCTGCCCAT 2487
||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2588 GCTGGCGTCAGAGTGAAGATGCTCGCGCTTGGAAGACTTTCATTGGCACAGTACGAGTGACAACTGCTGCCCAT 2661
Query 2488 CTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAACATTGA 2561
||.||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2662 CTAGCCCTGCTGGTGGCTAAAAATGTCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAGTTTTCTGAGGGCAACATTGA 2735
Query 2562 TGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGATGCTTATGCTACTACCATTCCTACTGAAACAGCACAAGGTGTGGC 2635
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2736 TGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGCATGCTCATGCTATTACCGTTCCTGCTGAAACAGCACAAGGTTTGGC 2809
Query 2636 GAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAATTAGAAGACAACAGTATCCAAATGAAGAAGGACCTAGCC 2709
|.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 2810 GGAAATGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAACTAGAAGACAACAGTATCCAGATGAAGAAGGATCTGGCC 2883
Query 2710 ACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGCGGAGGTAGAAGTGGTGGAGATGGTGAGAAAGCTGAGTTTGAGATA 2783
|||||.||.||.|||.|.|||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 2884 ACCTTTCTGTACCACCTGCGCATTGAGGCAGAAGTGGAAGTGGTGGAGAT------------------------ 2933
Query 2784 CAAGAGCATGACAGTGATATATCAGCATATACTTACGAGCGCACTT---------------------------- 2829
|||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||..
Sbjct 2934 -----GCACGACAGTGACATATCTGCCTATACATATGAGCGCACCCTGATGATGGAGCAGAGGTCCCAGATGCT 3002
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3003 TCGGCATATGCGGCTGTCCAAAACAGAGCGAGACAGGGAGGCACAGCTGGTGAAAGATCGAAACTCAATGCTAC 3076
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3077 GCTTGACCAGCATTGGCTCTGATGAGGACGAAGAGACAGAAACGTACCAGGAGAAGGTGCACATGACTTGGACC 3150
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3151 AAGGATAAATACATGGCATCCCGGGGGCAAAAGGTCAAGTCAATGGAAGGATTCCAGGACCTACTTAATATGCG 3224
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3225 TCCGGACCAGTCCAACGTGAGACGGATGCATACAGCAGTGAAGCTCAATGAAGTTATAGTCAACAAGTCTCATG 3298
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3299 AAGCAAAGCTGGTTTTGTTGAATATGCCAGGACCACCCCGGAACCCTGAAGGTGATGAAAACTACATGGAATTT 3372
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3373 CTAGAAGTGCTCACTGAGGGATTAGAACGAGTCCTTCTTGTCCGGGGTGGTGGCAGTGAGGTCATCACCATTTA 3446
Query 2830 ---- 2829
Sbjct 3447 CTCA 3450
