Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_15972
Subject:
NM_001045807.1
Aligned Length:
979
Identities:
871
Gaps:
63

Alignment

Query   1  --------------------------------------------MKGKERSPVKAKRSRGGEDSTSRGERSKKL  30
                                                       ||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct   1  MRSAGREPLPRRSPRWRRASPLCETSAGWRVSQLRRDDLRRPSTMKGKERSPVKPKRSRGGEDSSSRGERSKKL  74

Query  31  GGSGGSNGSSSGKTDSGGGSRRSLHLDKSSSRGGSREYDTGGGSSSSRLHSYSSPSTKNSSGGGESRSSSRGGG  104
           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GGSGGSNGSSSGKTDS-GGSRRSLHLDKSSSRGGSREYETGGGSSSSRLHSYSSPSTKNSSGGGESRSSSRGGG  147

Query 105  GESRSSGAASSAPGGGDGAEYKTLKISELGSQLSDEAVEDGLFHEFKRFGDVSVKISHLSGSGSGDERVAFVNF  178
           ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148  GESRSSGAASSAPGGGDGVEYKTLKISELGSQLSDEAVEDGLFHEFKRFGDVSVKISHLSGSGSGDERVAFVNF  221

Query 179  RRPEDARAAKHARGRLVLYDRPLKIEAVYVSRRRSRSPLDKDTYPPSASVVGASVGGHRHPPGGGGGQRSLSPG  252
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||.|||.|||.|||||||||||||
Sbjct 222  RRPEDARAAKHARGRLVLYDRPLKIEAVYVSRRRSRSPLDKDAYAPSSSVVGTSVGSHRHAPGGGGGQRSLSPG  295

Query 253  GAALGYRDYRLQQLALGRLPPPPPPPLPRDLERERDYPFYERVRPAYSLEPRVGAGAGAAPFREVDEISPEDDQ  326
           |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296  GAALGYRDYRLQQLALGRLPPPPPPPLPRELERERDYPFYDRVRPAYSLEPRVGAGAGAAPFREVDEISPEDDQ  369

Query 327  RANRTLFLGNLDITVTESDLRRAFDRFGVITEVDIKRPSRGQTSTYGFLKFENLDMSHRAKLAMSGKIIIRNPI  400
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370  RANRTLFLGNLDITVTENDLRRAFDRFGVITEVDIKRPSRGQTSTYGFLKFENLDMSHRAKLAMSGKIIIRNPI  443

Query 401  KIGYGKATPTTRLWVGGLGPWVPLAALAREFDRFGTIRTIDYRKGDSWAYIQYESLDAAHAAWTHMRGFPLGGP  474
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444  KIGYGKATPTTRLWVGGLGPWVPLAALAREFDRFGTIRTIDYRKGDSWAYIQYESLDAAHAAWTHMRGFPLGGP  517

Query 475  DRRLRVDFADTEHRYQQQYLQPLPLTHYELVTDAFGHRAPDPLRGARDRTPPLLYRDRDRDLYPDSDWVPPPPP  548
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 518  DRRLRVDFADTEHRYQQQYLQPLPLTHYELVTDTFGHRAPDPLRSARDRTPPLLYRDRDRDLYTDSDWVPPPPP  591

Query 549  VRERSTRTAATSVPAYEPLDSLDRRRDGWSLDRDRGDRDLPSSRDQPRKRRLPEESGGRHLDRSPESDRPRK-R  621
           |||||.|.|...|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||| |
Sbjct 592  VRERSARAATSAVTAYEPLDSLDRRRDGWSLDRDRGDRDLPSSRDQPRKRRLPEESGGRHLDRSPESERPRKQR  665

Query 622  HCAPSPDRSPELSSSRDRYNSDNDRSSR-LLLERPSPIRDRRGSLEKSQGDKRDRKNSASAERDRKHRTTAPTE  694
           ||.|||||||||||.||||||||||||| |||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.||||
Sbjct 666  HCTPSPDRSPELSSNRDRYNSDNDRSSRLLLLERSSPVRDRRGSLEKSQSDKRDRKNSASAERDRKHRTAAPTE  739

Query 695  GKSPLKKEDRSDGSAPSTSTASSKLKSPSQKQDGGTAPVASASPKLCLAWQGMLLLKNSNFPSNMHLLQGDLQV  768
           ||.||||||||||.|||.||.|||.|.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740  GKNPLKKEDRSDGNAPSASTSSSKQKPPSQKQDGGTAPVAASSPKLCLAWQGMLLLKNSNFPSNMHLLQGDLQV  813

Query 769  ASSLLVEGSTGGKVAQLKITQRLRLDQPKLDEVTRRIKVAGPNGYAILLAVPGSSDSRSSSSSAASDTATSTQR  842
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 814  ASSLLVEGSTGGKVAQLKITQRLRLDQPKLDEVTRRIKVAGPNGYAILLAVPGSSDSRSSSSSATSDTAASTQR  887

Query 843  PLRNLVSYLKQKQAAGVISLPVGGNKDKENTGVLHAFPPCEFSQQFLDSPAKALAKSEEDYLVMIIVRGFGFQI  916
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||......
Sbjct 888  PLRNLVSYLKQKQAAGVISLPVGGNKDKENTGVLHAFPPCEFSQQFLDSPAKALAKSEEDYLVMIIVRAKLVNS  961

Query 917  GVRYENKKRENLALTLL  933
           |                
Sbjct 962  G----------------  962