Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000474705
Subject:
XR_001751888.2
Aligned Length:
1260
Identities:
983
Gaps:
276

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGCTGCCCGGCGCCGGCTTCCGGGTGGTGCGAGCGAGATGGGGCGGAGGGCCGGTCTTGCAGAGTAGCTGCGGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAGTGGGCGTGTGCGCCGAGCGGTCTGGCCCAAGGGCTGGGGGCCGGCCGAGGGTCTTCGGGAGCAGGCCGCAG  148

Query    1  ---------------------------------------------ATGTCGGCGGAGGCCTCGGGCCCGGCTGC  29
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCGCGGAGAGATCCTGGGATCGCCGTCCGCCGCTGCTACCCGGCATGTCGGCGGAGGCCTCGGGCCCGGCTGC  222

Query   30  CGCCGCGGCCCCGTCCCTGGAAGCCCCCAAGCCCTCGGGTCTCGAGCCTGGCCCCGCCGCCTACGGTCTCAAGC  103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCGCGGCCCCGTCCCTGGAAGCCCCCAAGCCCTCGGGTCTCGAGCCTGGCCCCGCCGCCTACGGTCTCAAGC  296

Query  104  CGCTGACCCCGAACAGCAAATACGTGAAGCTGAACGTGGGCGGCTCGTTGCACTACACCACGCTGCGCACCCTC  177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCTGACCCCGAACAGCAAATACGTGAAGCTGAACGTGGGCGGCTCGTTGCACTACACCACGCTGCGCACCCTC  370

Query  178  ACGGGACAGGACACCATGCTCAAAGCCATGTTCAGCGGCCGCGTGGAGGTGCTGACCGATGCCGGAGGTTGGGT  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGGGACAGGACACCATGCTCAAAGCCATGTTCAGCGGCCGCGTGGAGGTGCTGACCGATGCCGGAGGTTGGGT  444

Query  252  GCTGATTGACCGGAGCGGCCGTCACTTTGGTACAATCCTCAATTACCTGCGGGATGGGTCTGTGCCACTGCCGG  325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGATTGACCGGAGCGGCCGTCACTTTGGTACAATCCTCAATTACCTGCGGGATGGGTCTGTGCCACTGCCGG  518

Query  326  AGAGTACGAGAGAACTGGGGGAGCTGCTGGGCGAAGCACGCTACTACCTGGTGCAGGGCCTGATTGAGGACTGC  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAGTACGAGAGAACTGGGGGAGCTGCTGGGCGAAGCACGCTACTACCTGGTGCAGGGCCTGATTGAGGACTGC  592

Query  400  CAGCTGGCGCTGCAGCAAAAAAGGGAGACGCTGTCCCCGCTGTGCCTCATCCCCATGGTGACATCTCCCCGGGA  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGCTGGCGCTGCAGCAAAAAAGGGAGACGCTGTCCCCGCTGTGCCTCATCCCCATGGTGACATCTCCCCGGGA  666

Query  474  GGAGCAGCAGCTCCTGGCCAGCACCTCCAAGCCCGTGGTGAAGCTCCTGCACAACCGCAGTAACAACAAGTACT  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAGCAGCAGCTCCTGGCCAGCACCTCCAAGCCCGTGGTGAAGCTCCTGCACAACCGCAGTAACAACAAGTACT  740

Query  548  CCTACACC------------------------------------------------------------------  555
            ||||||||                                                                  
Sbjct  741  CCTACACCAGGAACTGGCAGAGTCCTCCCCCTTGAGGTCAGTACTGTTGTGAGCTCCATTTTACAGATGAGGAG  814

Query  556  --------------AGCACTTCAGATGACAACCTACTTAAGAACATCGAGCTGTTCGACAAGCTGGCCCTGCGC  615
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTCGGGACACCAAGAGCACTTCAGATGACAACCTACTTAAGAACATCGAGCTGTTCGACAAGCTGGCCCTGCGC  888

Query  616  TTCCACGGGCGGCTACTCTTCCTCAAGGATGTCCTGGGGGACGAGATCTGTTGCTGGTCTTTCTACGGGCAGGG  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCCACGGGCGGCTACTCTTCCTCAAGGATGTCCTGGGGGACGAGATCTGCTGCTGGTCTTTCTACGGGCAGGG  962

Query  690  CCGCAAAATCGCCGAGGTGTGCTGCACCTCCATTGTCTATGCTACGGAGAAGAAGCAGACCAAGGTGGAATTTC  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGCAAAATCGCCGAGGTGTGCTGCACCTCCATTGTCTATGCTACGGAGAAGAAGCAGACCAAGGTGGAATTTC  1036

Query  764  CAGAGGCCCGGATCTTCGAGGAGACCCTGAACATCCTCATCTACGAGACTCCCCGGGGCCCAGACCCAGCCCTC  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGAGGCCCGGATCTTCGAGGAGACCCTGAACATCCTCATCTACGAGACTCCCCGGGGCCCAGACCCAGCCCTC  1110

Query  838  CTGGAGGCCACAGGGGGAGCAGCTGGAGCTGGTGGGGCTGGCCGCGGGGAGGATGAAGAGAACCGAGAGCACCG  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGGAGGCCACAGGGGGAGCAGCTGGAGCTGGTGGGGCTGGCCGCGGGGAGGATGAAGAGAACCGAGAGCACCG  1184

Query  912  TGTCCGCAGGATCCATGTCCGGCGCCATATCACCCACGACGAGCGTCCTCATGGCCAACAAATTGTCTTCAAGG  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1185  TGTCCGCAGGATCCATGTCCGGCGCCATATCACCCACGACGAGCGTCCTCATGGCCAACAAATTGTCTTCAAG-  1257

Query  986  AC  987
              
Sbjct 1258  --  1257