Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07304
Subject:
NM_147187.3
Aligned Length:
1320
Identities:
1232
Gaps:
87

Alignment

Query    1  ATGGAACAACGGGGACAGAACGCCCCGGCCGCTTCGGGGGCCCGGAAAAGGCACGGCCCAGGACCCAGGGAGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAACAACGGGGACAGAACGCCCCGGCCGCTTCGGGGGCCCGGAAAAGGCACGGCCCAGGACCCAGGGAGGC  74

Query   75  GCGGGGAGCCAGGCCTGGGCTCCGGGTCCCCAAGACCCTTGTGCTCGTTGTCGCCGCGGTCCTGCTGTTGGTCT  148
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGGGGAGCCAGGCCTGGGCCCCGGGTCCCCAAGACCCTTGTGCTCGTTGTCGCCGCGGTCCTGCTGTTGGTCT  148

Query  149  CAGCTGAGTCTGCTCTGATCACCCAACAAGACCTAGCTCCCCAGCAGAGAGCGGCCCCACAACAAAAGAGGTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCTGAGTCTGCTCTGATCACCCAACAAGACCTAGCTCCCCAGCAGAGAGCGGCCCCACAACAAAAGAGGTCC  222

Query  223  AGCCCCTCAGAGGGATTGTGTCCACCTGGACACCATATCTCAGAAGACGGTAGAGATTGCATCTCCTGCAAATA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCCCCTCAGAGGGATTGTGTCCACCTGGACACCATATCTCAGAAGACGGTAGAGATTGCATCTCCTGCAAATA  296

Query  297  TGGACAGGACTATAGCACTCACTGGAATGACCTCCTTTTCTGCTTGCGCTGCACCAGGTGTGATTCAGGTGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGACAGGACTATAGCACTCACTGGAATGACCTCCTTTTCTGCTTGCGCTGCACCAGGTGTGATTCAGGTGAAG  370

Query  371  TGGAGCTAAGTCCCTGCACCACGACCAGAAACACAGTGTGTCAGTGCGAAGAAGGCACCTTCCGGGAAGAAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAGCTAAGTCCCTGCACCACGACCAGAAACACAGTGTGTCAGTGCGAAGAAGGCACCTTCCGGGAAGAAGAT  444

Query  445  TCTCCTGAGATGTGCCGGAAGTGCCGCACAGGGTGTCCCAGAGGGATGGTCAAGGTCGGTGATTGTACACCCTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTCCTGAGATGTGCCGGAAGTGCCGCACAGGGTGTCCCAGAGGGATGGTCAAGGTCGGTGATTGTACACCCTG  518

Query  519  GAGTGACATCGAATGTGTCCACAAAGAATCAGGTACAAAGCACAGTGGGGAAGCCCCAGCTGTGGAGGAGACGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct  519  GAGTGACATCGAATGTGTCCACAAAGAA----------------------------------------------  546

Query  593  TGACCTCCAGCCCAGGGACTCCTGCCTCTCCCTGTTCTCTCTCAGGCATCATCATAGGAGTCACAGTTGCAGCC  666
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  -----------------------------------------TCAGGCATCATCATAGGAGTCACAGTTGCAGCC  579

Query  667  GTAGTCTTGATTGTGGCTGTGTTTGTTTGCAAGTCTTTACTGTGGAAGAAAGTCCTTCCTTACCTGAAAGGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  GTAGTCTTGATTGTGGCTGTGTTTGTTTGCAAGTCTTTACTGTGGAAGAAAGTCCTTCCTTACCTGAAAGGCAT  653

Query  741  CTGCTCAGGTGGTGGTGGGGACCCTGAGCGTGTGGACAGAAGCTCACAACGACCTGGGGCTGAGGACAATGTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  CTGCTCAGGTGGTGGTGGGGACCCTGAGCGTGTGGACAGAAGCTCACAACGACCTGGGGCTGAGGACAATGTCC  727

Query  815  TCAATGAGATCGTGAGTATCTTGCAGCCCACCCAGGTCCCTGAGCAGGAAATGGAAGTCCAGGAGCCAGCAGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  TCAATGAGATCGTGAGTATCTTGCAGCCCACCCAGGTCCCTGAGCAGGAAATGGAAGTCCAGGAGCCAGCAGAG  801

Query  889  CCAACAGGTGTCAACATGTTGTCCCCCGGGGAGTCAGAGCATCTGCTGGAACCGGCAGAAGCTGAAAGGTCTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  CCAACAGGTGTCAACATGTTGTCCCCCGGGGAGTCAGAGCATCTGCTGGAACCGGCAGAAGCTGAAAGGTCTCA  875

Query  963  GAGGAGGAGGCTGCTGGTTCCAGCAAATGAAGGTGATCCCACTGAGACTCTGAGACAGTGCTTCGATGACTTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  GAGGAGGAGGCTGCTGGTTCCAGCAAATGAAGGTGATCCCACTGAGACTCTGAGACAGTGCTTCGATGACTTTG  949

Query 1037  CAGACTTGGTGCCCTTTGACTCCTGGGAGCCGCTCATGAGGAAGTTGGGCCTCATGGACAATGAGATAAAGGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  CAGACTTGGTGCCCTTTGACTCCTGGGAGCCGCTCATGAGGAAGTTGGGCCTCATGGACAATGAGATAAAGGTG  1023

Query 1111  GCTAAAGCTGAGGCAGCGGGCCACAGGGACACCTTGTACACGATGCTGATAAAGTGGGTCAACAAAACCGGGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  GCTAAAGCTGAGGCAGCGGGCCACAGGGACACCTTGTACACGATGCTGATAAAGTGGGTCAACAAAACCGGGCG  1097

Query 1185  AGATGCCTCTGTCCACACCCTGCTGGATGCCTTGGAGACGCTGGGAGAGAGACTTGCCAAGCAGAAGATTGAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  AGATGCCTCTGTCCACACCCTGCTGGATGCCTTGGAGACGCTGGGAGAGAGACTTGCCAAGCAGAAGATTGAGG  1171

Query 1259  ACCACTTGTTGAGCTCTGGAAAGTTCATGTATCTAGAAGGTAATGCAGACTCTGCCATGTCC  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  ACCACTTGTTGAGCTCTGGAAAGTTCATGTATCTAGAAGGTAATGCAGACTCTGCCATGTCC  1233