Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07353
Subject:
NM_004671.5
Aligned Length:
621
Identities:
552
Gaps:
49

Alignment

Query   1  MADFEDLRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIRELYRRRYPRTLEGLSD  74
           |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIRELYRRRYPRTLEGLSD  74

Query  75  LSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGSVLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQL  148
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Sbjct  75  LSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGSVLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQL  148

Query 149  KNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFIFALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQ  222
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Sbjct 149  KNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFIFALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQ  222

Query 223  EDNYPNSLCIKVNGKLFPLPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLV  296
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Sbjct 223  EDNYPNSLCIKVNGKLFPLPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLV  296

Query 297  RQLTSAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAVTCTHLQCFDA  370
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Sbjct 297  RQLTSAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAVTCTHLQCFDA  370

Query 371  ALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQEDGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKI  444
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Sbjct 371  ALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQEDGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKI  444

Query 445  ESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSDEEEDPPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLMYQPSSVRVPSVT  518
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Sbjct 445  ESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSDEEEDPPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLMYQPSSVRVPSVT  518

Query 519  SVDPAAIPPSLTDYSVPFHHTPISSMSSDLPG---------------EQRRNDINNELKLGTSSDTVQQ-----  572
           ||||||||||||||||||||||||||||||||               ..........|.....|.|...     
Sbjct 519  SVDPAAIPPSLTDYSVPFHHTPISSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQYCPPMFLDSLTSPLTASSTSVTTTSSHESS  592

Query 573  -----------------------------  572
                                        
Sbjct 593  THVSSSSSRSETGVITSSGSNIPDIISLD  621