Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07395
Subject:
NM_001258354.1
Aligned Length:
972
Identities:
961
Gaps:
10

Alignment

Query   1  MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGRETKDLDEMDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGRETKDLDEMDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYG  74

Query  75  PEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  75  PEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGK------  142

Query 149  LIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRIS  222
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143  ----THPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRIS  212

Query 223  DGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213  DGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE  286

Query 297  NLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLVSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFV  370
           ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 287  NLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFV  360

Query 371  EFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361  EFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVG  434

Query 445  AKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLED  518
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Sbjct 435  AKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLED  508

Query 519  EEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV  592
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Sbjct 509  EEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV  582

Query 593  EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETV  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583  EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETV  656

Query 667  VETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDAT  740
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Sbjct 657  VETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDAT  730

Query 741  GPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARR  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731  GPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARR  804

Query 815  VVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLR  888
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Sbjct 805  VVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLR  878

Query 889  THTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELA  962
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Sbjct 879  THTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELA  952

Query 963  KQDVVLNYPM  972
           ||||||||||
Sbjct 953  KQDVVLNYPM  962