Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07959
• Subject: NM_001199812.1
• Aligned Length: 962
• Identities: 941
• Gaps: 20

Alignment

Query   1  MASNSTKSFLADAGYGEQELDANSALMELDKGLRSGKLGEQCEAVVRFPRLFQKYPFPILINSAFLKLADVFRV  74
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Sbjct   1  MASNSTKSFLADAGYGEQELDANSALMELDKGLRSGKLGEQCEAVVRFPRLFQKYPFPILINSAFLKLADVFRV  74

Query  75  GNNFLRLCVLKVTQQSEKHLEKILNVDEFVKRIFSVIHSNDPVARAITLRMLGSLASIIPERKNAHHSIRQSLD  148
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Sbjct  75  GNNFLRLCVLKVTQQSEKHLEKILNVDEFVKRIFSVIHSNDPVARAITLRMLGSLASIIPERKNAHHSIRQSLD  148

Query 149  SHDNVEVEAAVFAAANFSAQSKDFAVGICNKISEMIQGLATPVDLKLKLIPILQHMHHDAILASSARQLLQQLV  222
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Sbjct 149  SHDNVEVEAAVFAAANFSAQSKDFAVGICNKISEMIQGLATPVDLKLKLIPILQHMHHDAILASSARQLLQQLV  222

Query 223  TSYPSTKMVIVSLHTFTLLAASSLVDTPKQIQLLLQYLKNDPRKAVKRLAIQDLKLLANKTPHTWSRENIQALC  296
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Sbjct 223  TSYPSTKMVIVSLHTFTLLAASSLVDTPKQIQLLLQYLKNDPRKAVKRLAIQDLKLLANKTPHTWSRENIQALC  296

Query 297  ECALQTPYDSLKLGMLSVLSTLSGTIAIKHYFSIVPGNVSSSPRSSDLVKLAQECCYHNNRGIAAHGVRVLTNI  370
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Sbjct 297  ECALQTPYDSLKLGMLSVLSTLSGTIAIKHYFSIVPGNVSSSPRSSDLVKLAQECCYHNNRGIAAHGVRVLTNI  370

Query 371  TVSCQEKDLLALEQDAVFGLESLLVLCSQDDSPGAQATLKIALNCMVKLAKGRPRLSQSVVETLLTQLHSAQDA  444
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Sbjct 371  TVSCQEKDLLALEQDAVFGLESLLVLCSQDDSPGAQATLKIALNCMVKLAKGRPHLSQSVVETLLTQLHSAQDA  444

Query 445  ARILMCHCLAAIAMQLPVLGDGMLGDLMELYKVIGRSATDKQQELLVSLATVIFVASQKALSVESKAVIKQQLE  518
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Sbjct 445  ARILMCHCLAAIAMQLPVLGDGMLGDLMELYKVIGRSATDKQQELLVSLATVIFVASQKALSVESKAVIKQQLE  518

Query 519  SVSNGWTVYRIARQASRMGNHDMAKELYQSLLTQVASEHFYFWLNSLKEFSHAEQCLTGLQEENYSSALSCIAE  592
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Sbjct 519  SVSNGWTVYRIARQASRMGNHDMAKELYQSLLTQVASEHFYFWLNSLKEFSHAEQCLTGLQEENYSSALSCIAE  592

Query 593  SLKFYHKGIASLTAASTPLNPLSFQCEFVKLRIDLLQAFSQLICTCNSLKTSPPPAIATTIAMTLGNDLQRCGR  666
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Sbjct 593  SLKFYHKGIASLTAASTPLNPLSFQCEFVKLRIDLLQAFSQLICTCNSLKTSPPPAIATTIAMTLGNDLQRCGR  666

Query 667  ISNQMKQSMEEFRSLASRYGDLYQASFDADSATLRNVELQQQSCLLISHAIEALILDPESASFQEYGSTGTAHA  740
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Sbjct 667  ISNQMKQSMEEFRSLASRYGDLYQASFDADSATLRNVELQQQSCLLISHAIEALILDPESASFQEYGSTGTAHA  740

Query 741  DSEYERRMMSVYNHVLEEVESLNRKYTPVSYMHTACLCNAIIALLKVPLSFQRYFFQKLQSTSIKLALSPSPRN  814
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Sbjct 741  DSEYERRMMSVYNHVLEEVESLNRKYTPVSYM--------------------RYFFQKLQSTSIKLALSPSPRN  794

Query 815  PAEPIAVQNNQQLALKVEGVVQHGSKPGLFRKIQSVCLNVSSTLQSKSGQDYKIPIDNMTNEMEQRVEPHNDYF  888
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Sbjct 795  PAEPIAVQNNQQLALKVEGVVQHGSKPGLFRKIQSVCLNVSSTLQSKSGQDYKIPIDNMTNEMEQRVEPHNDYF  868

Query 889  STQFLLNFAILGTHNITVESSVKDANGIVWKTGPRTTIFVKSLEDPYSQQIRLQQQQAQQPLQQQQQRNAYTRF  962
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Sbjct 869  STQFLLNFAILGTHNITVESSVKDANGIVWKTGPRTTIFVKSLEDPYSQQIRLQQQQAQQPLQQQQQRNAYTRF  942