Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09121
Subject:
NM_179203.3
Aligned Length:
648
Identities:
518
Gaps:
57

Alignment

Query   1  MSWLFGVNKGPKGEGAGPPPPLPPAQPGAEGGGDRGLGDRPAPKDKWSNFDPTGLERAAKAARELEHSRYAKEA  74
           ||||||. |||||||.|||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   1  MSWLFGI-KGPKGEGTGPPLPLPPAQPGAEGGGDRGAGDRPSPKDKWSNFDPTGLERAAKAARELEHSRHAKEA  73

Query  75  LNLAQMQEQTLQLEQQSKLKEYEAAVEQLKSEQIRAQAEERRKTLSEETRQHQARAQYQDKLARQRYEDQLKQQ  148
           |.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  74  LSLAQMQEQTLQLEQQSKLKEYEAAVEQLKSEQIRVQAEERRKTLTEETRQHQARAQYQDKLARQRYEDQLKQQ  147

Query 149  RLLNEENLRKQEESVQKQEAMRRATVEREMELRHKNEMLRVETEARARAKAERENADIIREQIRLKASEHRQTV  222
           .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||.
Sbjct 148  QLLNEENLRKQEESVQKQEAIRRATVEREMELRHKNEMLRVEAEARARAKADRENADIIREQIRLKAAEHRQTI  221

Query 223  LESIRTAGTLFGEGFRAFVTDRDKVTATVAGLTLLAVGVYSAKNATAVTGRFIEARLGKPSLVRETSRITVLEA  296
           ||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 222  LESIRTAGTLLGEGFRAFVTDWDKVTATVAGLTLLAVGVYSAKNATSVAGRYIEARLGKPSLVRETSRISVLEA  295

Query 297  LRHPIQVSRRLLSRPQDVLEGVVLSPSLEARVRDIAIATRNTKKNRGLYRHILLYGPPGTGKTLFAKKLALHSG  370
           |||||||||||.|||||.||||.||||||||||||||||||||||..|||..|.||||||||||||||||||||
Sbjct 296  LRHPIQVSRRLVSRPQDALEGVILSPSLEARVRDIAIATRNTKKNKSLYRNVLMYGPPGTGKTLFAKKLALHSG  369

Query 371  MDYAIMTGGDVAPMGREGVTAMHKLFDWANTSRRGLLLFMDEADAFLRKRATEEISKDLRATLNAFLYHMGQHS  444
           ||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||...||||
Sbjct 370  MDYAIMTGGDVAPMGREGVTAMHKVFDWASTSRRGLLLFVDEADAFLRKRATEKISEDLRATLNAFLHRTGQHS  443

Query 445  NKFMLVLASNLPEQFDCAINSRIDVMVHFDLPQQEERERLVRLHFDNCVLKPATEGKRRLKLAQFDYGRKCSEV  518
           .|||||||||.|||||.|||.|||.||.|.|||.||||||||..||..|||||||||.|||.||||||.|||||
Sbjct 444  SKFMLVLASNQPEQFDWAINDRIDEMVCFALPQREERERLVRMYFDKYVLKPATEGKQRLKVAQFDYGKKCSEV  517

Query 519  ARLTEGMSGREIAQLAVSWQATAYASKDGVLTEAMMDACVQDAVQQYRQKMRWLKAEGPGRGVEHPLSGVQGET  592
           |.|||||||||||||||.|||.||.|.|||||||||||.|||||||..|||.|||.|.|.              
Sbjct 518  AQLTEGMSGREIAQLAVAWQAMAYSSEDGVLTEAMMDARVQDAVQQHQQKMQWLKVERPD--------------  577

Query 593  LTSWSLATDPSYPCLAGPCTFRICSWMGTGLCPGPLSPRMSCGGGRPFCPPGHPLL  648
               |....|..|.|.. |                                     
Sbjct 578  ----SQTNKPPHPSLLS-C-------------------------------------  591