Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06931
• Subject: XM_005265382.4
• Aligned Length: 2355
• Identities: 2261
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGCTTGTCGCCGGTCTTCTTCTCTGGGCTTCCCTACTGACCGGGGCCTGGCCATCCTTCCCCACCCAGGACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTGTCGCCGGTCTTCTTCTCTGGGCTTCCCTACTGACCGGGGCCTGGCCATCCTTCCCCACCCAGGACCA  74

Query   75  CCTCCCGGCCACGCCCCGGGTCCGGCTCTCATTCAAAGAGCTGAAGGCCACAGGCACCGCCCACTTCTTCAACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCGGCCACGCCCCGGGTCCGGCTCTCATTCAAAGAGCTGAAGGCCACAGGCACCGCCCACTTCTTCAACT  148

Query  149  TCCTGCTCAACACAACCGACTACCGAATCTTGCTCAAGGACGAGGACCACGACCGCATGTACGTGGGCAGCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCTGCTCAACACAACCGACTACCGAATCTTGCTCAAGGACGAGGACCACGACCGCATGTACGTGGGCAGCAAG  222

Query  223  GACTACGTGCTGTCCCTGGACCTGCACGACATCAACCGCGAGCCCCTCATTATACACTGGGCAGCCTCCCCACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTACGTGCTGTCCCTGGACCTGCACGACATCAACCGCGAGCCCCTCATTATACACTGGGCAGCCTCCCCACA  296

Query  297  GCGCATCGAGGAATGCGTGCTCTCAGGCAAGGATGTCAACGGCGAGTGTGGGAACTTCGTCAGGCTCATCCAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCGCATCGAGGAATGCGTGCTCTCAGGCAAGGATGTCAACGGCGAGTGTGGGAACTTCGTCAGGCTCATCCAGC  370

Query  371  CCTGGAACCGAACACACCTGTATGTGTGCGGGACAGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGCGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTGGAACCGAACACACCTGTATGTGTGCGGGACAGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGCGGA  444

Query  445  CGCCGCGCCCAGGCCACACCATGGACCCAGACTCAGGCGGTCAGAGGCCGCGGCAGCAGAGCCACGGATGGTGC  518
            ||||||||                                                                  
Sbjct  445  CGCCGCGC------------------------------------------------------------------  452

Query  519  CCTCCGCCCGATGCCCACAGCCCCACGCCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGCGACTCGAGTCAGGGA  592
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  453  ---------------------------CCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGCGACTCGAGTCAGGGA  499

Query  593  AGGGCAAGTGTCCGTACGATCCCAAGCTGGACACAGCATCGGCCCTCATCAATGAGGAGCTCTATGCTGGTGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  AGGGCAAGTGTCCGTACGATCCCAAGCTGGACACAGCATCGGCCCTCATCAATGAGGAGCTCTATGCTGGTGTG  573

Query  667  TACATCGATTTTATGGGCACTGATGCAGCCATCTTCCGCACACTTGGAAAGCAGACAGCCATGCGCACGGATCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  TACATCGATTTTATGGGCACTGATGCAGCCATCTTCCGCACACTTGGAAAGCAGACAGCCATGCGCACGGATCA  647

Query  741  GTACAACTCCCGGTGGCTGAACGACCCGTCGTTCATCCATGCTGAGCTCATTCCTGACAGTGCGGAGCGCAATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  GTACAACTCCCGGTGGCTGAACGACCCGTCGTTCATCCATGCTGAGCTCATTCCTGACAGTGCGGAGCGCAATG  721

Query  815  ATGATAAGCTTTACTTCTTCTTCCGTGAGCGGTCGGCAGAGGCGCCGCAGAGCCCCGCGGTGTACGCCCGCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  ATGATAAGCTTTACTTCTTCTTCCGTGAGCGGTCGGCAGAGGCGCCGCAGAGCCCCGCGGTGTACGCCCGCATC  795

Query  889  GGGCGCATTTGCCTGAACGATGACGGTGGTCACTGTTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCGCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  GGGCGCATTTGCCTGAACGATGACGGTGGTCACTGTTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCGCG  869

Query  963  GCTCGTCTGCTCTGTCCCGGGCGAGGATGGCATTGAGACTCACTTTGATGAGCTCCAGGACGTGTTTGTCCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  GCTCGTCTGCTCTGTCCCGGGCGAGGATGGCATTGAGACTCACTTTGATGAGCTCCAGGACGTGTTTGTCCAGC  943

Query 1037  AGACCCAGGACGTGAGGAACCCTGTCATTTACGCTGTCTTTACCTCCTCTGGCTCCGTGTTCCGAGGCTCTGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  AGACCCAGGACGTGAGGAACCCTGTCATTTACGCTGTCTTTACCTCCTCTGGCTCCGTGTTCCGAGGCTCTGCC  1017

Query 1111  GTGTGTGTCTACTCCATGGCTGATATTCGCATGGTCTTCAACGGGCCCTTTGCCCACAAAGAGGGGCCCAACTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018  GTGTGTGTCTACTCCATGGCTGATATTCGCATGGTCTTCAACGGGCCCTTTGCCCACAAAGAGGGGCCCAACTA  1091

Query 1185  CCAGTGGATGCCCTTCTCAGGGAAGATGCCCTACCCACGGCCGGGCACGTGCCCTGGTGGAACCTTCACGCCAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092  CCAGTGGATGCCCTTCTCAGGGAAGATGCCCTACCCACGGCCGGGCACGTGCCCTGGTGGAACCTTCACGCCAT  1165

Query 1259  CTATGAAGTCCACCAAGGATTATCCTGATGAGGTGATCAACTTCATGCGCAGCCACCCACTCATGTACCAGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166  CTATGAAGTCCACCAAGGATTATCCTGATGAGGTGATCAACTTCATGCGCAGCCACCCACTCATGTACCAGGCC  1239

Query 1333  GTGTACCCTCTGCAGCGGCGGCCCCTGGTAGTCCGCACAGGTGCTCCCTACCGCCTTACCACTATTGCCGTGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240  GTGTACCCTCTGCAGCGGCGGCCCCTGGTAGTCCGCACAGGTGCTCCCTACCGCCTTACCACTATTGCCGTGGA  1313

Query 1407  CCAGGTGGATGCAGCCGACGGGCGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314  CCAGGTGGATGCAGCCGACGGGCGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGTCA  1387

Query 1481  TTGTGCTGCCCAAGGATGACCAGGAGATGGAGGAGCTCATGCTGGAGGAGGTGGAGGTCTTCAAGGATCCAGCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388  TTGTGCTGCCCAAGGATGACCAGGAGTTGGAGGAGCTCATGCTGGAGGAGGTGGAGGTCTTCAAGGATCCAGCA  1461

Query 1555  CCCGTCAAGACCATGACCATCTCTTCTAAGAGGCAACAACTCTACGTGGCGTCAGCCGTGGGTGTCACACACCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1462  CCCGTCAAGACCATGACCATCTCTTCTAAGAGGCAACAACTCTACGTGGCGTCAGCCGTGGGTGTCACACACCT  1535

Query 1629  GAGCCTGCACCGCTGCCAGGCGTATGGGGCTGCCTGTGCTGACTGCTGCCTTGCCCGGGACCCTTACTGTGCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1536  GAGCCTGCACCGCTGCCAGGCGTATGGGGCTGCCTGTGCTGACTGCTGCCTTGCCCGGGACCCTTACTGTGCCT  1609

Query 1703  GGGATGGCCAGGCCTGCTCCCGCTATACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGCCGCCGGCAGGACGTCCGGCACGGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610  GGGATGGCCAGGCCTGCTCCCGCTATACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGCCGCCGGCAGGACGTCCGGCACGGA  1683

Query 1777  AACCCCATCAGGCAGTGCCGTGGGTTCAACTCCAATGCCAACAAGAATGCCGTGGAGTCTGTGCAGTATGGCGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684  AACCCCATCAGGCAGTGCCGTGGGTTCAACTCCAATGCCAACAAGAATGCCGTGGAGTCTGTGCAGTATGGCGT  1757

Query 1851  GGCCGGCAGCGCAGCCTTCCTTGAGTGCCAGCCCCGCTCGCCCCAAGCCACTGTTAAGTGGCTGTTCCAGCGAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758  GGCCGGCAGCGCAGCCTTCCTTGAGTGCCAGCCCCGCTCGCCCCAAGCCACTGTTAAGTGGCTGTTCCAGCGAG  1831

Query 1925  ATCCTGGTGACCGGCGCCGAGAGATTCGTGCAGAGGACCGCTTCCTGCGCACAGAGCAGGGCTTGTTGCTCCGT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832  ATCCTGGTGACCGGCGCCGAGAGATTCGTGCAGAGGACCGCTTCCTGCGCACAGAGCAGGGCTTGTTGCTCCGT  1905

Query 1999  GCACTGCAGCTCAGCGATCGTGGCCTCTACTCCTGCACAGCCACTGAGAACAACTTTAAGCACGTCGTCACACG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906  GCACTGCAGCTCAGCGATCGTGGCCTCTACTCCTGCACAGCCACTGAGAACAACTTTAAGCACGTCGTCACACG  1979

Query 2073  AGTGCAGCTGCATGTACTGGGCCGGGACGCCGTCCATGCTGCCCTCTTCCCACCACTGTCCATGAGCGCCCCGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980  AGTGCAGCTGCATGTACTGGGCCGGGACGCCGTCCATGCTGCCCTCTTCCCACCACTGTCCATGAGCGCCCCGC  2053

Query 2147  CACCCCCAGGCGCAGGCCCCCCAACGCCTCCTTACCAGGAGTTAGCCCAGCTGCTGGCCCAGCCAGAAGTGGGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054  CACCCCCAGGCGCAGGCCCCCCAACGCCTCCTTACCAGGAGTTAGCCCAGCTGCTGGCCCAGCCAGAAGTGGGC  2127

Query 2221  CTCATCCACCAGTACTGCCAGGGTTACTGGCGCCATGTGCCCCCCAGCCCCAGGGAGGCTCCAGGGGCACCCCG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128  CTCATCCACCAGTACTGCCAGGGTTACTGGCGCCATGTGCCCCCCAGCCCCAGGGAGGCTCCAGGGGCACCCCG  2201

Query 2295  GTCTCCTGAGCCCCAGGACCAGAAAAAGCCCCGGAACCGCCGGCACCACCCTCCGGACACA  2355
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202  GTCTCCTGAGCCCCAGGACCAGAAAAAGCCCCGGAACCGCCGGCACCACCCTCCGGACACA  2262