Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08417
• Subject: XM_006537717.1
• Aligned Length: 2059
• Identities: 1707
• Gaps: 167

Alignment

Query    1  ATGACGGCCTCTCCGGATTACTTGGTGGTGCTTTTTGGGATCACTGCTGGGGCCACCGGGGCCAAGCTAGGCTC  74
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGACGGCGTCTCCGGATTACTTGGTGGTGCTTTTTGGGATCACTGCTGGGGCCACCGGAGCCAAGCTGGGTTC  74

Query   75  GGATGAGAAGGAGTTGATCCTGCTGTTCTGGAAAGTCGTGGATCTGGCCAACAAGAAGGTGGGACAGTTGCACG  148
            |||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   75  GGATGAGAAGGAGCTGATCCTGCTGTTATGGAAAGTCGTGGATTTGGCCAACAAGAAGGTGGGACAGCTGCACG  148

Query  149  AAGTGCTAGTTAGACCGGATCAGTTGGAACTGACGGAGGACTGCAAAGAAGAAACTAAAATAGACGTCGAAAGC  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  149  AAGTACTAGTTAGACCGGATCAGTTGGAACTGACAGAGGATTGTAAAGAAGAAACTAAAATAGACGCCGAAAAC  222

Query  223  CTGTCCTCGGCGTCGCAGCTGGACCAAGCCCTCCGACAGTTTAACCAGTCAGTGAGCAATGAACTGAATATTGG  296
            |||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  223  CTGTCTTCCGCGCCGCAGCTGGACCAAGCCCTCCGACAGTTTAACCAGTCAGTGAGCAATGAACTGAACATCGG  296

Query  297  AGTAGGGACTTCCTTCTGTCTCTGTACTGATGGGCAGCTTCATGTCAGGCAAATCCTGCATCCTGAGGCTTCCA  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.|||||.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct  297  GGTAGGGACTTCCTTCTGTCTCTGTACTGACGGGCAGCTTCACATTAGGCAGATCTTGCATCCCGAGGCTTCCA  370

Query  371  AGAAGAATGTACTATTACCTGAATGCTTCTATTCCTTTTTTGATCTTCGAAAAGAATTCAAGAAATGTTGCCCT  444
            ||||||||||..||.|.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct  371  AGAAGAATGTGTTACTGCCTGAGTGCTTCTATTCCTTTTTCGATCTTCGGAAAGAGTTCAAGAAGTGCTGCCCG  444

Query  445  GGTTCACCTGATATTGACAAACTGGACGTTGCCACAATGACAGAGTATTTAAATTTTGAGAAGAGTAGTTCAGT  518
            ||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||..|.||||||||.....|.||.||||||||||||...||.||
Sbjct  445  GGCTCTCCCGATATCGACAAGCTGGATGTCGCAGCGATGACAGAAAGCCTGAACTTTGAGAAGAGTGACTCTGT  518

Query  519  CTCTCGATATGGAGCCTCTCAAGTTGAAGATATGGGGAATATAATTTTAGCAATGATTTCAGAGCCTTATAATC  592
            .||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct  519  GTCCCGATACGGAGCCTCCCAAGTTGAAGACATGGGGAACATAATTTTAGCAATGATCTCCGAGCCCTACAATC  592

Query  593  ACAGGTTTTCAGATCCAGAGAGAGTGAATTACAAGTTTGAAAGTGGAACTTGCAGCAAGATGGAACTTATTGAT  666
            ||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGATTTTCAGATCCAGAGAGAGTAAACTACAAGTTTGAAAGTGGCACTTGCAGCAAGATGGAACTTATTGAT  666

Query  667  GATAACACCGTAGTCAGGGCACGAGGTTTACCATGGCAGTCTTCAGATCAAGATATTGCAAGATTCTTCAAAGG  740
            ||.|.|||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GACAGCACAGTGGTGAGAGCTCGAGGTTTGCCCTGGCAATCTTCAGATCAAGATATTGCAAGGTTCTTCAAAGG  740

Query  741  ACTCAATATTGCCAAGGGAGGTGCAGCACTTTGTCTGAATGCTCAGGGTCGAAGGAACGGAGAAGCTCTGGTTA  814
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTCAATATTGCCAAGGGTGGCGCAGCACTTTGCCTGAATGCTCAGGGCCGGAGGAACGGAGAAGCTCTGGTTA  814

Query  815  GGTTTGTAAGTGAGGAGCACCGAGACCTAGCACTACAGAGGCACAAACATCACATGGGGACCCGGTATATTGAG  888
            |.||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  GATTTGTAAGTGAGGAGCACAGAGATCTAGCCCTGCAGAGGCACAAACATCACATGGGGACCCGGTACATTGAG  888

Query  889  GTTTACAAAGCAACAGGTGAAGATTTCCTTAAAATTGCTGGTGGTACTTCCAATGAGGTAGCCCAGTTTCTCTC  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTTACAAAGCAACAGGCGAAGATTTCCTTAAAATTGCCGGAGGGACATCCAATGAGGTAGCCCAGTTTCTCTC  962

Query  963  CAAGGAAAATCAAGTCATTGTTCGCATGCGGGGGCTCCCTTTCACGGCCACAGCTGAAGAAGTGGTGGCCTTCT  1036
            |||||||||.||||||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGGAAAACCAAGTCATCGTGCGCATGAGGGGGCTCCCTTTCACGGCCACGGCTGAAGAAGTGGTGGCCTTCT  1036

Query 1037  TTGGACAGCATTGCCCTATTACTGGGGGAAAGGAAGGCATCCTCTTTGTCACCTACCCAGATGGTAGGCCAACA  1110
            ||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  TTGGACAGCACTGCCCCATCACTGGAGGGAAGGAAGGCATCCTCTTCGTTACCTACCCAGATGGTAGGCCAACC  1110

Query 1111  GGGGACGCTTTTGTCCTCTTTGCCTGTGAGGAATATGCACAGAATGCGTTGAGGAAGCATAAAGACTTGTTGGG  1184
            ||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.||.|||.||||
Sbjct 1111  GGAGATGCTTTTGTGCTCTTTGCTTGTGAGGAGTATGCTCAGAACGCCCTGAGGAAGCACAAGGAGTTGCTGGG  1184

Query 1185  TAAAAGATACATTGAACTCTTCAGGAGCACAGCAGCTGAAGTTCAGCAGGTGCTGAATCGATTCTCCTCGGCCC  1258
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1185  TAAAAGATACATCGAGCTCTTCAGGAGCACAGCTGCCGAAGTTCAGCAGGTGCTGAACCGATTCTCCTCAGCCC  1258

Query 1259  CTCTCATTCCACTTCCAACCCCTCCCATTATTCCAGTACTACCTCAGCAATTTGTGCCCCCTACAAATGTTAGA  1332
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 1259  CTCTGATTCCACTTCCAACCCCTCCCATTATCCCTGTACTACCTCAGCAGTTTGTGCCTCCCACGAATGTCAGA  1332

Query 1333  GACTGTATACGCCTTCGAGGTCTTCCCTATGCAGCCACAATTGAGGACATCCTGGATTTCCTGGGGGAGTTCGC  1406
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||..|
Sbjct 1333  GACTGCATACGTCTGCGAGGTCTTCCCTATGCTGCCACAATAGAAGACATTCTGGACTTCCTGGGGGAGTTTTC  1406

Query 1407  CACAGATATTCGTACTCATGGGGTTCACATGGTTTTGAATCACCAGGGCCGCCCATCAGGAGATGCCTTTATCC  1480
            |||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACAGATATTCGTACACATGGAGTGCACATGGTATTGAATCACCAGGGACGCCCGTCAGGAGATGCCTTTATCC  1480

Query 1481  AGATGAAGTCTGCGGACAGAGCATTTATGGCTGCACAGAAGTGTCATAAAAAAAACATGAAGGACAGATATGTT  1554
            ||||||||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||||..||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGATGAAGTCAACAGACAGAGCATTCATGGCTGCGCAGAAGTACCATAAAAAAACCATGAAGGACAGATATGTT  1554

Query 1555  GAAGTCTTTCAGTGTTCAGCTGAGGAGATGAACTTTGTGTTAATGGGGGGCACTTTAAATCGAAATGGCTTATC  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1555  GAAGTCTTTCAGTGTTCAGCTGAGGAGATGAACTTTGTGTTAATGGGGGGCACTTTAAATCGAAATGGCTTGTC  1628

Query 1629  CCCACCGCCATGTAAGTTACCATGCCTGTCTCCTCCCTCCTACACATTTCCAGCTCCTGCTGCAGTTATTCCTA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.||.||.|||||||
Sbjct 1629  CCCACCGCCATGTAAGTTACCATGCCTGTCTCCTCCCTCCTACACATTCCCAGCTCCCACGGCTGTGATTCCTA  1702

Query 1703  CAGAAGCTGCCATTTACCAGCCCTCTGTGATTTTGAATCCACGAGCACTGCAGCCCTCCACAGCGTACTACCCA  1776
            |.||||||||||||||.||.||.|||.||.|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1703  CCGAAGCTGCCATTTATCAACCTTCTCTGCTCTTGAACCCACGGGCACTGCAGCCCTCCACTGCATACTACCCG  1776

Query 1777  GCAGGCACTCAGCTCTTCATGAACTACACAGCGTACTATCCCAGCCCCCCAGGTTCGCCTAATAGTCTTGGCTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||                                  
Sbjct 1777  GCAGGCACTCAGCTCTTCATGAACTACACAGCCTACTATC----------------------------------  1816

Query 1851  CTTCCCTACAGCTGCTAATCTTAGCGGTGTCCCTCCACAGCCTGGCACGGTGGTCAGAATGCAGGGCCTGGCCT  1924
                                                                                      
Sbjct 1817  --------------------------------------------------------------------------  1816

Query 1925  ACAATACTGGAGTTAAGGAAATTCTTAACTTCTTCCAAGGTTACCAGTATGCAACCGAGGATGGACTTATACAC  1998
                                                       |||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1817  -------------------------------------------CCAGTATGCAACCGAGGATGGACTTGTACAC  1847

Query 1999  ACAAATGACCAGGCCAGGACTCTACCCAAAGAATGGGTTTGTATT----------------  2043
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 1848  ACAAATGACCAGGCCAGGACTCTACCCAAAGAATGGGTTTGTATTTAAGGGCCCCAGCAGT  1908