Construct: sgRNA BRDN0001146186

Construct Description:

Construct Type:
sgRNA
Other Identifiers:
n/a
DNA Barcode:
GAGATGATGCTATATGTGAA

Original Target:

Taxon:
Homo sapiens (human)
Gene:
NME7 (29922)
Gene Description:
n/a
CRISPR Mechanism
CRISPRko

Vector Information:

Vector Backbone:
pXPR_003
Pol II Cassette 1:
EF1A-PuroR
Pol II Cassette 2:
n/a
Selection Marker:
PuroR
Visible Reporter:
n/a
Epitope Tag:
n/a

Additional Information:

Addgene ID:
76494

Gene matches for this target sequence (CRISPRko, PAM=NGG, human):

Reference Sequence Chromosome Cut Position Match Strand Match Gene Match Sequence PAM Seq. Mismatches[?] CFD Score[?] Match Tier[?]
1 NC_000001.11 1 169298694 - NME7 NNNATGATGCTATATGTGAA NGG 0 1.0 Tier I
2 NC_000009.12 9 116187374 + PAPPA NNNATGAAGCTCTATGTGAA NGG 2 0.2105 Tier I
3 NC_000006.12 6 88066321 + SPACA1 NNNATGATGCTTTAAGTGAA NGG 2 0.193 Tier I
4 NC_000018.10 18 72809903 - NETO1 NNNATGATGCTATATATTAA NGG 2 0.6667 Tier II
5 NC_000020.11 20 13349680 - TASP1 NNNATCATGTTATATGTGAA NGG 2 0.6417 Tier II
6 NC_000011.10 11 7025568 + NLRP14 NNNATTATGCTAAATGTGAA NGG 2 0.4615 Tier II
7 NC_000002.12 2 170229755 - MYO3B NNNATTATACTATATGTGAA NGG 2 0.4286 Tier II
8 NC_000015.10 15 88827391 - ACAN NNNATGATGCTGTAAGTGAA NGG 2 0.4181 Tier II
9 NC_000001.11 1 66162354 - PDE4B NNNTAGATGCTATATGTGAA NGG 2 0.3182 Tier II
10 NC_000012.12 12 463881 + B4GALNT3 NNNATGATGCTGTATGTGGA NGG 2 0.2708 Tier II
11 NC_000014.9 14 29744901 - PRKD1 NNNATGATTCTATGTGTGAA NGG 2 0.2489 Tier II
12 NC_000009.12 9 112570315 + KIAA1958 NNNATGGTGCTATACGTGAA NGG 2 0.1925 Tier II
13 NC_000006.12 6 65295597 - EYS NNNATGATGGTATATGTCAA NGG 2 0.1852 Tier II
14 NC_000011.10 11 19614507 - NAV2 NNNAGGATGCTATATGTGCA NGG 2 0.1324 Tier II
15 NC_000007.14 7 117187064 + ST7 NNNAAGATGCTCTATGTGAA NGG 2 0.1316 Tier II
16 NC_000001.11 1 39323903 + MACF1 NNNAAGATGCTATATGTGAA NAG 2 0.1296 Tier II
17 NC_000011.10 11 121489681 + SORL1 NNNATGCTGCTATCTGTGAA NGG 2 0.0938 Tier II
18 NC_000002.12 2 178705162 + TTN NNNATGATGCTATATATGAA NGA 2 0.0694 Tier II
19 NC_000004.12 4 152908711 - ARFIP1 NNNATGATGTTATATGTGAA NGA 2 0.0654 Tier II
20 NC_000023.11 X 151662080 - PASD1 NNNATGATGCTAAATGTGAA NGA 2 0.0481 Tier II
21 NC_000016.10 16 76493269 + CNTNAP4 NNNATGATGCCATATGTGAA NGA 2 0.0463 Tier II
22 NC_000003.12 3 160784301 - PPM1L NNNATGATACTATATGTGAA NGA 2 0.0446 Tier II
23 NC_000007.14 7 11403660 - THSD7A NNNATGATGCTAAATGTGAA NTG 2 0.027 Tier II
24 NC_000002.12 2 29683735 + ALK NNNATGATGTTATATGTGAA NGC 2 0.0209 Tier II
25 NC_000007.14 7 128981668 + TNPO3 NNNATGATGATATATGTGAA NGT 2 0.014 Tier II
26 NC_000002.12 2 114454210 + DPP10 NNNATGGTGCTATATGTGAA NGT 2 0.0114 Tier II
27 NC_000005.10 5 95600786 + ARSK NNNATGATGCTATTTGTGAA NGT 2 0.0086 Tier II
28 NC_000007.14 7 7670608 - RPA3 NNNATGATGCTATATCTGAA NGG 1 0.0 Tier II
29 NC_000007.14 7 7670608 - UMAD1 NNNATGATGCTATATCTGAA NGG 1 0.0 Tier II
30 NC_000020.11 20 13349680 - LOC124904872 NNNATCATGTTATATGTGAA NGG 2 0.6417 Tier III
31 NC_000010.11 10 121277513 - LOC105378523 NNNATCATGCTACATGTGAA NGG 2 0.5383 Tier III
32 NC_000001.11 1 203390473 + LOC102723529 NNNATGATGCAATATGAGAA NGG 2 0.4 Tier III
33 NC_000006.12 6 134733585 + LOC101928277 NNNATGGTGCTATGTGTGAA NGG 2 0.3294 Tier III
34 NC_000007.14 7 117187064 + ST7-OT3 NNNAAGATGCTCTATGTGAA NGG 2 0.1316 Tier III
35 NC_000002.12 2 178705162 + LOC124906100 NNNATGATGCTATATATGAA NGA 2 0.0694 Tier III
36 NC_000002.12 2 178705162 + LOC124907912 NNNATGATGCTATATATGAA NGA 2 0.0694 Tier III
37 NC_000004.12 4 19494453 - LOC105374511 NNNATGATGCTGTATGTGAA NGA 2 0.0502 Tier III
38 NC_000006.12 6 84362378 - LOC107986620 NNNATGATGCAATATTTGAA NGG 2 0.0 Tier III
39 NC_000006.12 6 84362378 - LOC107986621 NNNATGATGCAATATTTGAA NGG 2 0.0 Tier III
Download CSV

Gene matches for this target sequence (CRISPRko, PAM=NGG, mouse):

Reference Sequence Chromosome Cut Position Match Strand Match Gene Match Sequence PAM Seq. Mismatches[?] CFD Score[?] Match Tier[?]
1 NC_000067.6 1 24562708 - Col19a1 NNNATGAAGCTATATGTGAA NGG 1 0.8 Tier II
2 NC_000084.6 18 7508187 + Mpp7 NNNATGATGTTACATGTGAA NGG 2 0.743 Tier II
3 NC_000078.6 12 36160904 - Ankmy2 NNNATGATGATGTATGTGAA NGG 2 0.6259 Tier II
4 NC_000077.6 11 89661909 + Ankfn1 NNNATGATAATATATGTGAA NGG 2 0.5571 Tier II
5 NC_000069.6 3 37511557 - Spata5 NNNATGGTGCTATATGCGAA NGG 2 0.4983 Tier II
6 NC_000071.6 5 150729657 + Pds5b NNNATCATGCTGTATGTGAA NGG 2 0.4924 Tier II
7 NC_000074.6 8 13612056 + Rasa3 NNNATGAAGCTAGATGTGAA NGG 2 0.2087 Tier II
8 NC_000072.6 6 87836522 + Isy1 NNNATGATGGTATTTGTGAA NGG 2 0.2074 Tier II
9 NC_000067.6 1 62065895 - Pard3b NNNATGATGCTACATGTGAA NAG 2 0.2047 Tier II
10 NC_000073.6 7 120853238 - Eef2k NNNATGAAGCTATATGTGAA NCG 2 0.0857 Tier II
11 NC_000079.6 13 16981938 - Sugct NNNTTGATGCTATATGTGAA NGA 2 0.0442 Tier II
12 NC_000086.7 X 42517916 - Sh2d1a NNNATGATGTTATATGTGAA NTG 2 0.0367 Tier II
13 NC_000082.6 16 6405725 - Rbfox1 NNNATGATGCTATATGTGAT NGC 2 0.0133 Tier II
14 NC_000080.6 14 75971619 - Gtf2f2 NNNATGATTCTATATGTGAA NGT 2 0.0086 Tier II
15 NC_000071.6 5 103212186 - Mapk10 NNNATGATGCTATATGTGAA NTA 2 0.0 Tier II
16 NC_000081.6 15 66551875 - Tmem71 NNNATGATGCTATGTCTGAA NGG 2 0.0 Tier II
17 NC_000074.6 8 48871208 + Tenm3 NNNATGATGCTATTTTTGAA NGG 2 0.0 Tier II
18 NC_000077.6 11 103883164 + Nsf NNNATGCTGCTATATTTGAA NGG 2 0.0 Tier II
19 NC_000068.7 2 70932067 - Gm39843 NNNATGATGCTATATCTCAA NGG 2 0.0 Tier III
20 NC_000074.6 8 48871208 + Gm19744 NNNATGATGCTATTTTTGAA NGG 2 0.0 Tier III
Download CSV

Other clones with same target sequence:

(none)